93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2598 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  100 
 
 
409 aa  842  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  58.15 
 
 
412 aa  452  1e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  35.92 
 
 
417 aa  232  8e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  33.09 
 
 
413 aa  229  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  28.93 
 
 
411 aa  179  8e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1970  major capsid-like protein  31.91 
 
 
425 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  30.61 
 
 
440 aa  174  3e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  29.93 
 
 
397 aa  139  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  31.39 
 
 
399 aa  139  8e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2179  phage major capsid protein, HK97 family  32.83 
 
 
373 aa  139  8e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  29.85 
 
 
400 aa  139  9e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  32.87 
 
 
405 aa  135  2e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  29.93 
 
 
397 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  31.29 
 
 
392 aa  122  8e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  26.54 
 
 
388 aa  120  4e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  28.36 
 
 
386 aa  110  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  30.47 
 
 
386 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  28.93 
 
 
389 aa  104  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  25.68 
 
 
427 aa  92  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  25.68 
 
 
427 aa  92  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  25.68 
 
 
427 aa  92  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  27.27 
 
 
403 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  27.83 
 
 
385 aa  87  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  27.53 
 
 
384 aa  86.3  1e-15  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  26.76 
 
 
382 aa  84.7  2e-15  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  28.2 
 
 
421 aa  82.8  1e-14  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  27.71 
 
 
421 aa  82  2e-14  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  24.27 
 
 
420 aa  82  2e-14  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  27.65 
 
 
405 aa  81.3  3e-14  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  26.64 
 
 
398 aa  79  2e-13  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  24.36 
 
 
388 aa  79  2e-13  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  25.47 
 
 
385 aa  77  5e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  24.81 
 
 
382 aa  76.6  6e-13  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  24.81 
 
 
382 aa  76.6  6e-13  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  26.16 
 
 
393 aa  77  6e-13  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  28.08 
 
 
421 aa  76.6  6e-13  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  25.7 
 
 
312 aa  76.6  7e-13  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  25.53 
 
 
424 aa  76.6  8e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  25.59 
 
 
418 aa  75.9  1e-12  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  26.53 
 
 
431 aa  74.3  4e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  24.72 
 
 
385 aa  71.6  2e-11  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  24.72 
 
 
385 aa  71.6  2e-11  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  25.36 
 
 
380 aa  71.6  2e-11  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  27.39 
 
 
419 aa  70.9  4e-11  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  24.82 
 
 
430 aa  70.1  7e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  1.54569e-05 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  26.32 
 
 
435 aa  70.1  7e-11  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  24.23 
 
 
389 aa  69.7  8e-11  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  24.56 
 
 
380 aa  68.9  2e-10  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  24.53 
 
 
390 aa  67.4  4e-10  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  24.93 
 
 
387 aa  67  6e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  25.25 
 
 
315 aa  66.6  7e-10  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  24.93 
 
 
416 aa  66.6  7e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  23.86 
 
 
408 aa  65.1  2e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  24.51 
 
 
417 aa  65.5  2e-09  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  25 
 
 
562 aa  65.5  2e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.33544e-10 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  24.86 
 
 
428 aa  64.7  3e-09  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  25.91 
 
 
387 aa  64.7  3e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  25.47 
 
 
398 aa  63.9  5e-09  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  25.4 
 
 
416 aa  63.5  7e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  22.71 
 
 
425 aa  62  2e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  22.55 
 
 
388 aa  61.6  2e-08  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08230  phage major capsid protein, HK97 family  26.52 
 
 
403 aa  62  2e-08  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0061868  hitchhiker  0.00502474 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3486  HK97 family phage major capsid protein  23.79 
 
 
394 aa  61.2  3e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168874  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  25.33 
 
 
450 aa  60.5  5e-08  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  24.88 
 
 
379 aa  60.1  7e-08  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  24.88 
 
 
379 aa  59.3  1e-07  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  25.1 
 
 
400 aa  57.8  4e-07  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  23.31 
 
 
441 aa  57.4  4e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  23.95 
 
 
417 aa  56.6  7e-07  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  23.24 
 
 
417 aa  56.6  8e-07  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  22.51 
 
 
471 aa  54.3  4e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  25.95 
 
 
399 aa  53.9  5e-06  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2954  phage major capsid protein, HK97  27.76 
 
 
281 aa  53.1  8e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.624972  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2910  phage major capsid protein, HK97  27.76 
 
 
281 aa  53.1  8e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0468  prophage LambdaBa04, major capsid protein  23.28 
 
 
396 aa  52.8  1e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0446  prophage LambdaBa04, major capsid protein  23.28 
 
 
400 aa  52.8  1e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  21.32 
 
 
407 aa  52.4  1e-05  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  24.65 
 
 
403 aa  52.4  1e-05  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  23.75 
 
 
401 aa  52.8  1e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  7.39522e-11 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  21.95 
 
 
406 aa  52.8  1e-05  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1622  hypothetical protein  23.38 
 
 
439 aa  52  2e-05  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3078  phage major capsid protein, HK97  28.01 
 
 
282 aa  52  2e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5360  HK97 family phage major capsid protein  23.55 
 
 
346 aa  51.2  3e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4981  HK97 family phage major capsid protein  23.73 
 
 
359 aa  51.2  3e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  24.86 
 
 
401 aa  51.6  3e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  24.59 
 
 
401 aa  50.8  5e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2399e-07 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  19.11 
 
 
382 aa  48.1  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7144  HK97 family phage major capsid protein  22.88 
 
 
434 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647338 
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  22.75 
 
 
424 aa  47.4  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  22.05 
 
 
383 aa  46.6  0.0008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  22.87 
 
 
420 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  20.45 
 
 
438 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1284  major capsid protein HK97  23.42 
 
 
416 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0461297  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>