More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2574 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  81.76 
 
 
547 aa  773    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  81.76 
 
 
495 aa  773    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  81.76 
 
 
546 aa  775    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  83.9 
 
 
484 aa  779    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  81.33 
 
 
484 aa  770    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  81.55 
 
 
484 aa  771    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  81.76 
 
 
547 aa  773    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  100 
 
 
480 aa  949    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  81.55 
 
 
546 aa  771    Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  81.55 
 
 
495 aa  769    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  68.57 
 
 
474 aa  629  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  67.75 
 
 
476 aa  628  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  66.45 
 
 
478 aa  615  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  66 
 
 
474 aa  609  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  67.1 
 
 
502 aa  606  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  65.78 
 
 
474 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  65.78 
 
 
476 aa  606  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  32.21 
 
 
446 aa  227  5.0000000000000005e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  30.4 
 
 
445 aa  202  8e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  29.5 
 
 
469 aa  201  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  29.08 
 
 
475 aa  183  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  30.39 
 
 
454 aa  182  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.74 
 
 
458 aa  177  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  26.76 
 
 
446 aa  173  5e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  29.49 
 
 
450 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.36 
 
 
461 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1132  mate efflux family protein  28.47 
 
 
446 aa  156  6e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0193769  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  27.58 
 
 
439 aa  152  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1724  multi anti extrusion protein MatE  28.35 
 
 
471 aa  149  8e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  25.9 
 
 
456 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  27.77 
 
 
459 aa  147  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  31.03 
 
 
469 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  27.75 
 
 
450 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1856  Na+-driven multidrug efflux pump  26.62 
 
 
429 aa  143  6e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0920105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  30.05 
 
 
468 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.67 
 
 
464 aa  139  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.67 
 
 
464 aa  139  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  28.22 
 
 
483 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  26.13 
 
 
442 aa  137  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  27.7 
 
 
447 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  27.63 
 
 
464 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  27.48 
 
 
447 aa  133  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  29.52 
 
 
452 aa  133  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  26.52 
 
 
453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  25.67 
 
 
439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  26.48 
 
 
446 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  28.1 
 
 
463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  27.94 
 
 
464 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  28.1 
 
 
464 aa  126  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  28.1 
 
 
464 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  24.72 
 
 
440 aa  125  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  28.1 
 
 
464 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  28.1 
 
 
464 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  28.1 
 
 
464 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  27.69 
 
 
463 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  27.47 
 
 
464 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  28.04 
 
 
464 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  26.39 
 
 
467 aa  123  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25.52 
 
 
475 aa  123  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  26.33 
 
 
450 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  25.55 
 
 
459 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  26.39 
 
 
440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  26.37 
 
 
464 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  23.75 
 
 
446 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  24.55 
 
 
438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  23.75 
 
 
472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  28.11 
 
 
462 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.5 
 
 
461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  23.94 
 
 
445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  27.74 
 
 
434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  28.44 
 
 
452 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  27.27 
 
 
453 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  23.39 
 
 
464 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  24.32 
 
 
460 aa  106  8e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  28.99 
 
 
462 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  26.44 
 
 
475 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0056  MATE efflux family protein  23.97 
 
 
412 aa  104  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  29.19 
 
 
452 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  24.03 
 
 
460 aa  103  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  25.67 
 
 
470 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  25.22 
 
 
450 aa  103  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3187  MATE efflux family protein  24.83 
 
 
486 aa  102  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0998  MATE efflux family protein  24.22 
 
 
500 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280475  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2404  hypothetical protein  25.23 
 
 
429 aa  100  5e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.146193  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3779  MATE efflux family protein  25.56 
 
 
453 aa  99.8  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  23.85 
 
 
448 aa  99.4  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0649  MATE efflux family protein  25.11 
 
 
453 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3589  MATE efflux family protein  24.89 
 
 
476 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3656  MATE efflux family protein  24.89 
 
 
453 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  27.37 
 
 
436 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3485  MATE efflux family protein  25.44 
 
 
453 aa  97.4  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3315  MATE efflux family protein  25.88 
 
 
456 aa  97.1  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  25.68 
 
 
451 aa  96.7  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  24.02 
 
 
469 aa  96.7  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0638  MATE efflux family protein  25.88 
 
 
456 aa  96.7  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2630  MATE efflux family protein  24.94 
 
 
472 aa  95.9  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  25.61 
 
 
444 aa  96.3  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  24.83 
 
 
458 aa  95.1  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  22.2 
 
 
469 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  22.2 
 
 
469 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>