92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2471 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2471  universal stress protein UspC  100 
 
 
141 aa  288  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  1.43058e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2143  universal stress protein UspC  70.92 
 
 
142 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0567863  hitchhiker  5.63035e-26 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1317  universal stress protein UspC  70.21 
 
 
142 aa  219  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  hitchhiker  3.24254e-23 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2088  universal stress protein UspC  70.21 
 
 
142 aa  219  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0115018  hitchhiker  1.03858e-28 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1194  universal stress protein UspC  70.21 
 
 
142 aa  219  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000126998  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2082  universal stress protein UspC  70.21 
 
 
142 aa  219  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.025537  decreased coverage  2.91933e-07 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2632  universal stress protein UspC  71.22 
 
 
142 aa  212  2e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00097653  hitchhiker  1.32668e-14 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01853  hypothetical protein  70.5 
 
 
142 aa  209  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.171198  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01864  universal stress protein  70.5 
 
 
142 aa  209  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.113188  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2127  universal stress protein UspC  70.5 
 
 
142 aa  209  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.53827e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1992  universal stress protein UspC  70.5 
 
 
142 aa  209  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.0089e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1739  universal stress protein UspC  70.5 
 
 
142 aa  209  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.342522  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1290  universal stress protein UspC  70.5 
 
 
142 aa  209  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000158426  hitchhiker  6.04455e-08 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1747  UspA domain protein  69.78 
 
 
142 aa  206  6e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.17703  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2991  universal stress protein UspC  43.88 
 
 
139 aa  142  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.764967  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0120  UspA domain-containing protein  41.43 
 
 
148 aa  117  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.792174  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4035  universal stress protein A  41.43 
 
 
148 aa  116  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4090  universal stress protein A  41.43 
 
 
148 aa  116  9e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03344  universal stress global response regulator  40.71 
 
 
144 aa  116  1e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134289  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3909  UspA domain-containing protein  40.71 
 
 
145 aa  116  1e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0221  UspA domain-containing protein  40.71 
 
 
144 aa  116  1e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4841  universal stress protein A  40.71 
 
 
144 aa  116  1e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0220  UspA domain protein  40.71 
 
 
144 aa  116  1e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3695  universal stress protein A  40.71 
 
 
144 aa  116  1e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3977  universal stress protein A  40.71 
 
 
144 aa  116  1e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3794  universal stress protein A  40 
 
 
144 aa  115  1e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3861  universal stress protein A  40 
 
 
144 aa  115  1e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0446526  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3827  universal stress protein A  40.71 
 
 
144 aa  116  1e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3904  universal stress protein A  40 
 
 
144 aa  115  1e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79916  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03297  hypothetical protein  40.71 
 
 
144 aa  116  1e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3784  universal stress protein A  40 
 
 
144 aa  115  1e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0353489  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3965  universal stress protein A  40 
 
 
144 aa  115  1e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3784  universal stress protein A  40.71 
 
 
144 aa  116  1e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4114  UspA domain protein  39.29 
 
 
144 aa  115  2e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3927  UspA domain protein  40 
 
 
144 aa  115  2e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4691  UspA domain-containing protein  40 
 
 
148 aa  114  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4484  UspA domain protein  40.71 
 
 
145 aa  114  4e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4201  UspA domain protein  40.71 
 
 
145 aa  114  4e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2438  universal stress protein A  38.03 
 
 
141 aa  104  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00532  universal stress protein  37.32 
 
 
141 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001946  universal stress protein A  35.92 
 
 
141 aa  98.6  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0959  universal stress protein  34.46 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2946  universal stress protein A  33.1 
 
 
141 aa  90.1  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1234  universal stress protein  33.57 
 
 
138 aa  87.4  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.144061 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0955  universal stress protein  37.58 
 
 
141 aa  85.9  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06392  hypothetical protein  32.39 
 
 
143 aa  84.7  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001381  universal stress protein family 8  32.14 
 
 
189 aa  85.5  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000691396  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0954  universal stress protein  34.04 
 
 
142 aa  80.9  6e-15  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4095  universal stress protein UspD  30.71 
 
 
142 aa  80.5  7e-15  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4062  UspA domain protein  30.71 
 
 
142 aa  80.5  7e-15  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03757  hypothetical protein  30.71 
 
 
142 aa  80.5  7e-15  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1121  universal stress protein A  31.16 
 
 
141 aa  80.5  7e-15  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  7.57775e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4457  universal stress protein UspD  30.71 
 
 
142 aa  80.5  7e-15  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4154  universal stress protein UspD  30.71 
 
 
142 aa  80.5  7e-15  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03808  stress-induced protein  30.71 
 
 
142 aa  80.5  7e-15  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4405  universal stress protein UspD  30.71 
 
 
142 aa  80.5  7e-15  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5378  universal stress protein UspD  30.71 
 
 
142 aa  80.1  1e-14  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4363  universal stress protein UspD  30.71 
 
 
142 aa  80.1  1e-14  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.54659 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000133  universal stress protein family 2  33.09 
 
 
129 aa  77.4  6e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0671042  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0125  universal stress protein  34.97 
 
 
140 aa  76.6  9e-14  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1452  UspA domain-containing protein  25.87 
 
 
145 aa  62.4  2e-09  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  28.87 
 
 
144 aa  62  3e-09  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  28.87 
 
 
144 aa  62  3e-09  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1969  UspA domain-containing protein  25 
 
 
141 aa  60.8  6e-09  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0857578  hitchhiker  0.00755954 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1486  hypothetical protein  26.53 
 
 
140 aa  51.2  5e-06  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  26.24 
 
 
151 aa  50.4  8e-06  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1780  universal stress protein  23.4 
 
 
149 aa  48.9  2e-05  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134073  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1497  hypothetical protein  26.76 
 
 
140 aa  49.7  2e-05  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 
146 aa  48.9  2e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  23.4 
 
 
146 aa  47.8  5e-05  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  9.30123e-07 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  22.92 
 
 
166 aa  47.4  7e-05  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  26.39 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  29.51 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2742  hypothetical protein  28.57 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  25.85 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  25.9 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  26.39 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  25 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  23.28 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  28.1 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  25 
 
 
149 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  27.03 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  30.77 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2132  universal stress protein  25.69 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0989997 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  23.73 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  26.39 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2094  hypothetical protein  23.57 
 
 
140 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  30.77 
 
 
143 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  26.03 
 
 
170 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  26.03 
 
 
170 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  26.39 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4004  hypothetical protein  26.03 
 
 
167 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209434  normal  0.67916 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>