91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2460 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2460  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  100 
 
 
253 aa  518  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1801  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  43.17 
 
 
258 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.109168  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1961  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  43.67 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2361  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  41.46 
 
 
264 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.200412  normal  0.497633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3334  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  41.46 
 
 
258 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3670  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  40.65 
 
 
260 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.295639  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1775  chaperone protein  44.08 
 
 
250 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241363  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2670  pilus assembly chaperone  44.08 
 
 
250 aa  193  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0194825 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1664  pilus assembly chaperone  44.08 
 
 
250 aa  192  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.74351  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1447  putative fimbrial chaperone  40.43 
 
 
260 aa  190  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2109  putative chaperone protein  44 
 
 
254 aa  181  9.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0024073 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2818  putative fimbrial chaperone  38.3 
 
 
257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61530  putative pili assembly chaperone  41.86 
 
 
262 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.223638 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1792  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  41.01 
 
 
279 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0680  putative fimbrial assembly chaperone  41.01 
 
 
279 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902912  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1635  fimbrial chaperone protein  41.01 
 
 
279 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1613  type I pilus usher pathway chaperone CsuC  41.01 
 
 
279 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0478  putative fimbrial assembly chaperone  41.01 
 
 
280 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.621456  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1398  putative fimbrial assembly chaperone  41.01 
 
 
279 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0875  fimbrial assembly chaperone, putative  41.01 
 
 
279 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5300  putative pili assembly chaperone  41.31 
 
 
262 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2678  fimbrial assembly chaperone, putative  39.91 
 
 
279 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4601  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  35.96 
 
 
288 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001217  pilus assembly protein chaperone PapD  32.77 
 
 
252 aa  149  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4396  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  33.94 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809922  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01137  pili assembly chaperone  35.78 
 
 
235 aa  128  8.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0327551  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1922  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  31.97 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0722  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278946  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1222  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0849986  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1606  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1070  putative pilus assembly chaperone  33.33 
 
 
236 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2993  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.810791  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2293  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1063  P pilus assembly protein, chaperone PapD  32.89 
 
 
236 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1271  pili assembly chaperone  34.04 
 
 
244 aa  122  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1269  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  33.18 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0558339  normal  0.0398715 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5758  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  34.17 
 
 
236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0866  hypothetical protein  31.14 
 
 
236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00391209  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4689  putataive fimbrial chaperone protein  31.53 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192366  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2474  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  33.67 
 
 
237 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.631121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2340  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  33.67 
 
 
237 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.200473 
 
 
-
 
NC_003296  RS03042  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  33.7 
 
 
241 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168941  normal  0.259112 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1830  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  31.17 
 
 
254 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0343  putative pilus assembly protein chaperone PapD  26.91 
 
 
241 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0006  pilus chaperone protein, putative  29.34 
 
 
247 aa  88.2  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0451749  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0007  chaperone protein EcpD  29.34 
 
 
247 aa  88.2  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0410847  hitchhiker  0.00437464 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5510  putative fimbrial chaperone protein  25.76 
 
 
252 aa  79  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0779  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  26.87 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.765293  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1267  pili assembly chaperone  29.84 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.475835 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2694  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  26.98 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.25409 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01133  pili assembly chaperone  27.47 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0694484  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  28.1 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0305  chaperone protein pmfD, putative  23.41 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4406  chaperone CupC2  32 
 
 
133 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0611  chaperone protein PmfD, putative  22.12 
 
 
245 aa  59.3  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000224808  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2058  putative P pilus assembly protein, chaperone PapD  26.73 
 
 
263 aa  58.9  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.62462e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  26.34 
 
 
237 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3666  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  29.82 
 
 
250 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.486976  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  22.89 
 
 
259 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  26.28 
 
 
248 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0145  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  24.18 
 
 
262 aa  52.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.195396  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  25.87 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  28.19 
 
 
238 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  22.47 
 
 
252 aa  50.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  24.39 
 
 
247 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  24.39 
 
 
247 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3600  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  28.07 
 
 
250 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3741  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  27.93 
 
 
250 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  24.23 
 
 
264 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  26.57 
 
 
247 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0762  Pili assembly chaperone, N-terminal  25.68 
 
 
248 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0172596 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  26.86 
 
 
256 aa  45.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  26.86 
 
 
256 aa  45.4  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  26.86 
 
 
256 aa  45.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0536  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  21.84 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  24.5 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  26.86 
 
 
256 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1547  Pili assembly chaperone, N-terminal  22.96 
 
 
224 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1537  pili assembly chaperone  22.96 
 
 
224 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1465  pili assembly chaperone  24.68 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2400  pilus assembly chaperone  22.96 
 
 
224 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2246  pilus assembly chaperone  22.96 
 
 
224 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0470931  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  24.61 
 
 
257 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3093  gram-negative pilus assembly chaperone  23.26 
 
 
224 aa  43.5  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  20.52 
 
 
282 aa  42.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1276  gram-negative pili assembly chaperone  26.81 
 
 
233 aa  43.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.315526 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  25.96 
 
 
234 aa  42.7  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  24.75 
 
 
246 aa  42.4  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0492  Pili assembly chaperone, N-terminal  22.01 
 
 
224 aa  42.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  23.27 
 
 
250 aa  42.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  21.21 
 
 
250 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>