More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2393 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A1913  cold shock-like protein CspC  100 
 
 
69 aa  139  2e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.58e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1977  cold shock-like protein CspC  100 
 
 
69 aa  139  2e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  7.86929e-06  normal  0.190727 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2038  cold shock-like protein CspC  100 
 
 
69 aa  139  2e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  1.33144e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2051  cold shock-like protein CspC  100 
 
 
69 aa  139  2e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.65967e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1981  cold shock-like protein CspC  100 
 
 
69 aa  139  2e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  1.73649e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1294  cold shock-like protein CspC  100 
 
 
69 aa  139  2e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  6.32959e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01781  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  139  2e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000220518  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1478  cold shock-like protein CspC  100 
 
 
69 aa  139  2e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000112944  normal  0.636634 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2554  cold shock-like protein CspC  100 
 
 
69 aa  139  2e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  8.10099e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2393  cold shock-like protein CspC  100 
 
 
69 aa  139  2e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  1.01532e-07  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1820  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 
69 aa  139  2e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  3.76643e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1365  cold shock-like protein CspC  100 
 
 
69 aa  139  2e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000234098  normal  0.0150165 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01793  stress protein, member of the CspA-family  100 
 
 
69 aa  139  2e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000145825  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2089  cold shock-like protein CspC  100 
 
 
69 aa  139  2e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.57783e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2474  cold shock-like protein CspC  98.55 
 
 
69 aa  138  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00166025  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2822  cold shock-like protein CspC  98.55 
 
 
69 aa  138  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  7.20852e-09  decreased coverage  1.9593e-05 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_5001  cold shock protein  98.55 
 
 
69 aa  138  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.56924e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2213  cold shock-like protein CspC  97.1 
 
 
69 aa  137  5e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  9.72653e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1920  cold shock-like protein CspC  97.1 
 
 
69 aa  137  5e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  2.17103e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2027  cold shock-like protein CspC  95.65 
 
 
69 aa  135  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1977  cold shock-like protein CspC  95.65 
 
 
69 aa  135  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.25837e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3159  cold shock protein CspE  85.51 
 
 
69 aa  121  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  1.39034e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1172  cold shock protein CspE  85.51 
 
 
69 aa  121  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  5.86616e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0730  cold shock protein CspE  84.06 
 
 
69 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1159  cold shock protein CspE  84.06 
 
 
69 aa  120  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0670  cold shock protein CspE  84.06 
 
 
69 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00211319  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0788  cold shock protein CspE  84.06 
 
 
69 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0838453  normal  0.873226 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0684  cold shock protein CspE  84.06 
 
 
69 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0744  cold shock protein CspE  84.06 
 
 
69 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.231158  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2974  cold shock protein CspE  84.06 
 
 
69 aa  119  1e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0538  cold shock protein CspE  82.61 
 
 
69 aa  118  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3021  cold shock protein CspE  82.61 
 
 
69 aa  118  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0130834  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00593  cold shock protein E  82.61 
 
 
69 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0712  cold shock protein CspE  82.61 
 
 
69 aa  118  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0018015  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0644  cold shock protein CspE  82.61 
 
 
69 aa  118  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0784428  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0648  cold shock protein CspE  82.61 
 
 
69 aa  118  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00594526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00582  hypothetical protein  82.61 
 
 
69 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3002  cold-shock DNA-binding domain protein  82.61 
 
 
69 aa  118  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0574427  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0675  cold shock protein CspE  82.61 
 
 
69 aa  118  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.92249e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3052  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  86.36 
 
 
70 aa  117  4e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1858  cold shock protein CspE  82.61 
 
 
69 aa  117  5e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.32354 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1083  cold-shock DNA-binding domain protein  82.61 
 
 
69 aa  117  5e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3031  cold shock protein CspE  82.61 
 
 
69 aa  117  5e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.036334  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0261  cold shock protein CspE  82.61 
 
 
69 aa  117  5e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2958  cold shock protein CspE  82.61 
 
 
69 aa  117  5e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0282333  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_5000  cold shock protein  84.85 
 
 
70 aa  117  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1740  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  84.85 
 
 
70 aa  117  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183326  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1189  cold shock protein CspE  82.61 
 
 
69 aa  116  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0375  cold shock DNA-binding domain-containing protein  77.61 
 
 
70 aa  108  2e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1124  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.12 
 
 
70 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.92661e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3545  cold shock protein  76.12 
 
 
70 aa  108  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.14537e-07  hitchhiker  0.00788202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1070  cold shock protein  76.12 
 
 
70 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00138821  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0374  cold shock DNA-binding domain-containing protein  77.61 
 
 
70 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1221  cold shock DNA-binding domain-containing protein  77.61 
 
 
70 aa  107  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0444  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.12 
 
 
70 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0442  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.12 
 
 
70 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2498  cold-shock DNA-binding protein family protein  74.63 
 
 
70 aa  105  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  2.41121e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1220  cold shock DNA-binding domain-containing protein  76.12 
 
 
70 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0443  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.63 
 
 
70 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0376  cold shock DNA-binding domain-containing protein  74.63 
 
 
70 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0201  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.13 
 
 
70 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.766684  hitchhiker  0.00947065 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3862  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.13 
 
 
70 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.563148  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0172  cold-shock DNA-binding domain protein  77.78 
 
 
67 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  1.63048e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1715  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.57 
 
 
69 aa  101  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1642  cold shock DNA-binding protein  73.13 
 
 
71 aa  101  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.78552e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0221  cold-shock DNA-binding domain protein  73.13 
 
 
70 aa  101  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2092  cold-shock DNA-binding domain protein  73.13 
 
 
70 aa  100  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00894908  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2085  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.13 
 
 
70 aa  100  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180168  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2061  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.59 
 
 
70 aa  100  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.97163  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1840  cold-shock DNA-binding domain protein  73.13 
 
 
70 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2607  cold shock protein CspG  68.66 
 
 
70 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286712  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0492  putative cold-shock DNA-binding domain protein  72.31 
 
 
67 aa  98.6  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1099  cold shock protein CspG  68.66 
 
 
70 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2135  cold shock protein CspG  68.66 
 
 
70 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1225  cold shock protein CspG  68.66 
 
 
70 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  2.03795e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00999  hypothetical protein  68.66 
 
 
70 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2129  cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 
70 aa  98.6  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2653  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 
70 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000496106  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2326  cold shock protein CspG  68.66 
 
 
70 aa  99.4  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.27415e-15  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00992  DNA-binding transcriptional regulator  68.66 
 
 
70 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1105  cold shock protein CspG  68.66 
 
 
70 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.33553e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2559  cold-shock DNA-binding domain protein  78.12 
 
 
67 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0164583 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3877  major cold shock protein  70.15 
 
 
70 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.76351  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0160  major cold shock protein  70.15 
 
 
70 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03406  major cold shock protein  70.15 
 
 
70 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4033  major cold shock protein  70.15 
 
 
70 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.661127  normal  0.575238 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3864  major cold shock protein  70.15 
 
 
70 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03357  hypothetical protein  70.15 
 
 
70 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3845  major cold shock protein  70.15 
 
 
70 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.644384  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4932  major cold shock protein  70.15 
 
 
70 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.859989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3973  major cold shock protein  70.15 
 
 
70 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3929  major cold shock protein  70.15 
 
 
70 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3970  major cold shock protein  70.15 
 
 
70 aa  98.6  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4052  major cold shock protein  70.15 
 
 
70 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3757  major cold shock protein  70.15 
 
 
70 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0156  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 
70 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2122  cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 
70 aa  98.2  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0166  major cold shock protein  68.66 
 
 
70 aa  96.3  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1765  cold shock DNA-binding protein  70.31 
 
 
71 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0225255  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0927  cold-shock protein, DNA-binding  68.66 
 
 
70 aa  96.3  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  6.50584e-08  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>