25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2258 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2258  DNA polymerase III subunit theta  100 
 
 
51 aa  104  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000273189  unclonable  0.00000264119 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1941  DNA polymerase III subunit theta  68.75 
 
 
76 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286111 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2413  DNA polymerase III subunit theta  64.58 
 
 
76 aa  68.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2121  DNA polymerase III subunit theta  68.09 
 
 
76 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1837  DNA polymerase III subunit theta  66.67 
 
 
76 aa  67.4  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.97705  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1345  DNA polymerase III subunit theta  69.57 
 
 
76 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.385833 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01801  hypothetical protein  69.57 
 
 
76 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2577  DNA polymerase III subunit theta  69.57 
 
 
76 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.477917  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2117  DNA polymerase III subunit theta  69.57 
 
 
76 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01813  DNA polymerase III, theta subunit  69.57 
 
 
76 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1790  DNA polymerase III subunit theta  69.57 
 
 
76 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712189  normal  0.095364 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2071  DNA polymerase III subunit theta  69.57 
 
 
76 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1933  DNA polymerase III subunit theta  69.57 
 
 
76 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1800  DNA polymerase II beta subunit  69.57 
 
 
76 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.614073  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2035  DNA polymerase III subunit theta  67.39 
 
 
76 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.512691  normal  0.0941775 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2090  DNA polymerase III subunit theta  67.39 
 
 
76 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2030  DNA polymerase III subunit theta  67.39 
 
 
76 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.531552  normal  0.522468 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1373  DNA polymerase III subunit theta  67.39 
 
 
76 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000169619 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1248  DNA polymerase III subunit theta  67.39 
 
 
76 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2439  DNA polymerase III subunit theta  62.5 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1625  DNA polymerase III subunit theta  62.5 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2343  DNA polymerase III subunit theta  62.5 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.763691  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2040  DNA polymerase II beta subunit  63.83 
 
 
86 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.079168  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2239  DNA polymerase II beta subunit  57.45 
 
 
76 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2126  DNA polymerase II beta subunit  60.87 
 
 
76 aa  55.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>