More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2212 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01159  DNA polymerase V subunit UmuC  84.12 
 
 		 422 aa  763    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000022565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2464  DNA-directed DNA polymerase  84.12 
 
 		 422 aa  763    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050901  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2212  DNA polymerase V subunit UmuC  100 
 
 		 422 aa  882    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1329  DNA polymerase V subunit UmuC  84.12 
 
 		 422 aa  763    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024147  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1671  DNA polymerase V subunit UmuC  83.89 
 
 		 422 aa  762    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0525212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2215  DNA polymerase V subunit UmuC  90.52 
 
 		 422 aa  801    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69246  normal  0.844364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01169  hypothetical protein  84.12 
 
 		 422 aa  763    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000148835  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2158  DNA polymerase V subunit UmuC  90.52 
 
 		 422 aa  806    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.512063  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1287  DNA polymerase V subunit UmuC  83.89 
 
 		 422 aa  761    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000534988  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2162  DNA polymerase V subunit UmuC  90.52 
 
 		 422 aa  805    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.229342 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1965  DNA polymerase V subunit UmuC  83.89 
 
 		 422 aa  762    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000119892  normal  0.867639 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2441  DNA polymerase V subunit UmuC  84.12 
 
 		 422 aa  763    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000365295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2606  DNA-directed DNA polymerase  68.9 
 
 		 422 aa  608  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.4458 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1908  DNA-directed DNA polymerase  64.93 
 
 		 420 aa  553  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0002  DNA polymerase V subunit UmuC  64.62 
 
 		 423 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0036  DNA polymerase V subunit UmuC  57.78 
 
 		 424 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0503759 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1982  DNA-directed DNA polymerase  56.7 
 
 		 423 aa  486  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0053  mutagenesis and repair protein MucB  56.22 
 
 		 421 aa  478  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000259717  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2005  DNA-directed DNA polymerase  54.98 
 
 		 424 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000515421 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2342  DNA-directed DNA polymerase  54.74 
 
 		 424 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2458  DNA-directed DNA polymerase  54.74 
 
 		 424 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2353  DNA-directed DNA polymerase  55.21 
 
 		 424 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4000  DNA-directed DNA polymerase  51.9 
 
 		 430 aa  430  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5030  DNA-directed DNA polymerase  51.54 
 
 		 426 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2950  DNA-directed DNA polymerase  47.63 
 
 		 424 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2745  DNA-directed DNA polymerase  48.34 
 
 		 424 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1425  DNA-directed DNA polymerase  47.87 
 
 		 426 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2761  DNA-directed DNA polymerase  46.68 
 
 		 426 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0282343 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1279  DNA-directed DNA polymerase  48 
 
 		 423 aa  387  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1751  umuC protein  47.51 
 
 		 427 aa  371  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0886  DNA-directed DNA polymerase  47.98 
 
 		 439 aa  368  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1550  DNA-directed DNA polymerase  46.41 
 
 		 418 aa  366  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0477659 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0705  DNA-directed DNA polymerase  42.69 
 
 		 450 aa  365  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0859  DNA-directed DNA polymerase  43.56 
 
 		 450 aa  361  1e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1369  DNA-directed DNA polymerase  45.54 
 
 		 426 aa  359  7e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.772919  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2106  DNA-directed DNA polymerase  45.93 
 
 		 421 aa  355  6.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1662  hypothetical protein  46.1 
 
 		 418 aa  347  3e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1005  hypothetical protein  45.02 
 
 		 425 aa  346  6e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0052  DNA-directed DNA polymerase  42.73 
 
 		 449 aa  345  8e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154189 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1668  hypothetical protein  46.1 
 
 		 418 aa  345  8.999999999999999e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1040  hypothetical protein  44.42 
 
 		 425 aa  344  2e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2200  DNA-directed DNA polymerase  47.42 
 
 		 424 aa  344  2e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0055  hypothetical protein  44.37 
 
 		 425 aa  343  4e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.352875  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4341  DNA-directed DNA polymerase  43.25 
 
 		 432 aa  342  7e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3752  DNA-directed DNA polymerase  43.71 
 
 		 420 aa  335  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1492  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  40.52 
 
 		 420 aa  335  1e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00564635  decreased coverage  0.000128837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1966  DNA-directed DNA polymerase  41.23 
 
 		 446 aa  335  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.577995  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4983  UMUC-like DNA-repair protein  44.47 
 
 		 432 aa  333  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000315583 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3235  DNA-directed DNA polymerase  43.63 
 
 		 418 aa  333  3e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2378  DNA-directed DNA polymerase  43.9 
 
 		 425 aa  331  1e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0759  DNA-directed DNA polymerase  42.52 
 
 		 423 aa  327  3e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1031  DNA-directed DNA polymerase  42.82 
 
 		 426 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0175  DNA-directed DNA polymerase  43.16 
 
 		 423 aa  326  6e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10658  putative RumB/ImpB like DNA repair protein  42.02 
 
 		 422 aa  325  1e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08269  DNA-directed DNA polymerase  40.94 
 
 		 418 aa  324  2e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3075  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  44.84 
 
 		 419 aa  323  3e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2605  DNA-directed DNA polymerase  41.96 
 
 		 418 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.733552  normal  0.0235112 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3210  DNA-directed DNA polymerase  42.25 
 
 		 418 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000012227 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1369  DNA-directed DNA polymerase  43.23 
 
 		 426 aa  319  5e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0086  ultraviolet light resistance protein B  46.74 
 
 		 360 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1200  DNA-directed DNA polymerase  45.75 
 
 		 432 aa  317  2e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2171  DNA-directed DNA polymerase  42.42 
 
 		 417 aa  317  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0898  DNA-directed DNA polymerase  42.55 
 
 		 437 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.694521 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2973  DNA-directed DNA polymerase  42.86 
 
 		 492 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0296388  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0920  DNA-directed DNA polymerase  43.43 
 
 		 423 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.21788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3553  DNA-directed DNA polymerase  42 
 
 		 418 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4321  DNA-directed DNA polymerase  42.59 
 
 		 428 aa  312  9e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.466657 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6848  DNA-directed DNA polymerase  41.27 
 
 		 422 aa  311  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.615058  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0012  SOS mutagenesis protein RulB  41.33 
 
 		 418 aa  311  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374057  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2344  DNA-directed DNA polymerase  40.98 
 
 		 421 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3453  DNA-directed DNA polymerase  40.38 
 
 		 418 aa  308  8e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00650413  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1832  DNA-repair protein  40.61 
 
 		 418 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1178  DNA-directed DNA polymerase  41.61 
 
 		 424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0736762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4414  DNA-repair protein  40.19 
 
 		 418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000291737  decreased coverage  0.00359939 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4598  DNA-repair protein  40.19 
 
 		 418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000181511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4570  DNA-repair protein  40.19 
 
 		 418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2196  DNA-directed DNA polymerase  40.98 
 
 		 418 aa  306  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2195  DNA-directed DNA polymerase  41.08 
 
 		 417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.147122  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3536  DNA-repair protein  41.9 
 
 		 418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1964  DNA-directed DNA polymerase  40 
 
 		 418 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2682  umuC protein  39.38 
 
 		 418 aa  300  3e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261647  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2040  DNA-directed DNA polymerase  42.24 
 
 		 418 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939043  normal  0.0886472 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7046  UMUC domain protein DNA-repair protein  42.15 
 
 		 442 aa  300  5e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4407  DNA-directed DNA polymerase  41.83 
 
 		 418 aa  299  7e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4268  DNA-directed DNA polymerase  41.83 
 
 		 418 aa  299  7e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0315  DNA-directed DNA polymerase  42.89 
 
 		 443 aa  299  7e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.639091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3517  DNA-directed DNA polymerase  43.79 
 
 		 478 aa  298  8e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0591  impB/mucB/samB family protein  42.12 
 
 		 366 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110123  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1434  DNA-directed DNA polymerase  41.38 
 
 		 497 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6255  DNA-directed DNA polymerase  41.27 
 
 		 442 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.983679 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1292  DNA-directed DNA polymerase  39.1 
 
 		 424 aa  290  4e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.355097  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2466  DNA-repair protein  39.95 
 
 		 417 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0312138  normal  0.965014 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0459  DNA-directed DNA polymerase  41.67 
 
 		 423 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204967  normal  0.799613 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15961  putative UmuC protein  39.39 
 
 		 424 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0220  DNA-directed DNA polymerase  41.55 
 
 		 436 aa  280  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4498  DNA-directed DNA polymerase  40.61 
 
 		 426 aa  280  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10201  putative UmuC protein  37.26 
 
 		 430 aa  275  8e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.31245  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07071  putative UmuC protein  37.03 
 
 		 422 aa  275  9e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.109713 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4172  DNA-directed DNA polymerase  36.84 
 
 		 416 aa  272  9e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.06239 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09231  putative UmuC protein  35.75 
 
 		 428 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.986725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>