More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2099 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  77.27 
 
 
700 aa  1152    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  77.41 
 
 
700 aa  1154    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  53.46 
 
 
709 aa  750    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  77.2 
 
 
706 aa  1158    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  77.2 
 
 
706 aa  1158    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  71.05 
 
 
715 aa  1061    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
728 aa  1503    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  77.41 
 
 
700 aa  1157    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  77.41 
 
 
700 aa  1153    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  77.27 
 
 
700 aa  1152    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  77.56 
 
 
700 aa  1157    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  77.27 
 
 
700 aa  1153    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  77.34 
 
 
706 aa  1160    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  77.84 
 
 
700 aa  1156    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  77.34 
 
 
706 aa  1160    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  77.41 
 
 
700 aa  1157    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  76.5 
 
 
721 aa  1164    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  44.07 
 
 
694 aa  554  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  42.78 
 
 
726 aa  538  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  42.42 
 
 
742 aa  523  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  42.19 
 
 
720 aa  525  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  41.87 
 
 
712 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  41.22 
 
 
710 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  41.17 
 
 
706 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  41.22 
 
 
697 aa  485  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  40.77 
 
 
681 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3353  TonB-dependent receptor plug  39.77 
 
 
736 aa  470  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130298  normal  0.417052 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  40.54 
 
 
731 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  39.58 
 
 
743 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  36.71 
 
 
701 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  39.33 
 
 
705 aa  443  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  37.21 
 
 
706 aa  444  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  38.65 
 
 
723 aa  420  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  37.13 
 
 
723 aa  409  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 
675 aa  372  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  33.63 
 
 
688 aa  365  1e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  32.54 
 
 
691 aa  306  1.0000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  33.58 
 
 
678 aa  295  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 
705 aa  270  1e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 
680 aa  247  6.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 
726 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 
696 aa  171  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 
742 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 
737 aa  168  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  26.28 
 
 
727 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  24.96 
 
 
703 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 
770 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 
736 aa  165  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 
734 aa  163  8.000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  24.38 
 
 
701 aa  159  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  26.71 
 
 
797 aa  154  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 
730 aa  153  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 
780 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 
681 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 
715 aa  139  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  21.93 
 
 
762 aa  138  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 
681 aa  138  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 
700 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 
717 aa  137  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  23.89 
 
 
711 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  23.57 
 
 
656 aa  135  3e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 
713 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 
682 aa  130  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  22.56 
 
 
757 aa  126  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 
692 aa  125  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  25.38 
 
 
713 aa  125  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  26.65 
 
 
809 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 
706 aa  124  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  25.6 
 
 
795 aa  124  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  25.34 
 
 
673 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 
700 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 
702 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  25.32 
 
 
795 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3048  TonB-dependent receptor  22.49 
 
 
774 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20503  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 
678 aa  122  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 
688 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 
652 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5774  TonB-dependent receptor plug  22.52 
 
 
690 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.872771  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  27.07 
 
 
721 aa  120  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3149  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 
776 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0958639  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2924  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 
776 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753718  normal  0.115907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5661  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 
769 aa  117  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303106  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 
705 aa  117  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  25.42 
 
 
724 aa  116  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  26.06 
 
 
809 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  26.49 
 
 
809 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 
809 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 
721 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  25.71 
 
 
712 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 
653 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  24.58 
 
 
653 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 
653 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  25.6 
 
 
774 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  24.3 
 
 
690 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1601  TonB-dependent heme receptor  23.48 
 
 
702 aa  111  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2074  TonB domain-containing protein  24.35 
 
 
741 aa  111  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 
698 aa  111  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  23.58 
 
 
664 aa  110  9.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 
665 aa  110  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 
653 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>