More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2023 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2023  LacI family transcription regulator  100 
 
 
338 aa  702    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2909  sucrose operon repressor  84.18 
 
 
335 aa  600  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00007545  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4207  LacI family transcription regulator  70.79 
 
 
347 aa  479  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3596  transcriptional regulator, LacI family  68.22 
 
 
339 aa  461  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3759  transcriptional regulator, LacI family  67.41 
 
 
339 aa  462  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.899629  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0347  transcriptional regulator, LacI family  64.07 
 
 
339 aa  460  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.427458  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0391  transcriptional regulator, LacI family  64.07 
 
 
339 aa  456  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.133972  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1582  DNA-binding transcriptional regulator FruR  34.08 
 
 
329 aa  173  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05957  DNA-binding transcriptional regulator FruR  34.2 
 
 
331 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0452  DNA-binding transcriptional regulator FruR  32.65 
 
 
326 aa  172  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0089  DNA-binding transcriptional regulator FruR  32.11 
 
 
325 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18230  DNA-binding transcriptional regulator FruR  33.44 
 
 
329 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0329354  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000221  fructose repressor FruR LacI family  32.79 
 
 
326 aa  169  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3791  DNA-binding transcriptional regulator FruR  31.85 
 
 
334 aa  169  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3603  DNA-binding transcriptional regulator FruR  32.14 
 
 
334 aa  169  7e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0750  DNA-binding transcriptional regulator FruR  31.55 
 
 
334 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3916  transcriptional regulator, LacI family  30 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0127  DNA-binding transcriptional regulator FruR  30.42 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0134  DNA-binding transcriptional regulator FruR  30.42 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.118856 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0135  DNA-binding transcriptional regulator FruR  30.42 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0130  DNA-binding transcriptional regulator FruR  30.42 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15013  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0130  DNA-binding transcriptional regulator FruR  30.42 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000945493 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00081  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.12 
 
 
334 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0598  DNA-binding transcriptional regulator FruR  29.22 
 
 
334 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0073  DNA-binding transcriptional regulator FruR  30.12 
 
 
334 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0082  DNA-binding transcriptional regulator FruR  30.12 
 
 
334 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00080  hypothetical protein  30.12 
 
 
334 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0085  DNA-binding transcriptional regulator FruR  30.12 
 
 
334 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0088  DNA-binding transcriptional regulator FruR  30.12 
 
 
334 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.936017 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0086  DNA-binding transcriptional regulator FruR  30.12 
 
 
334 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3577  DNA-binding transcriptional regulator FruR  30.12 
 
 
334 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3529  DNA-binding transcriptional regulator FruR  30.21 
 
 
336 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3520  transcriptional regulator, LacI family  30.12 
 
 
334 aa  160  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3399  DNA-binding transcriptional regulator FruR  30.21 
 
 
336 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0636  DNA-binding transcriptional regulator FruR  29.52 
 
 
334 aa  160  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0785  DNA-binding transcriptional regulator FruR  33.33 
 
 
330 aa  159  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0792  DNA-binding transcriptional regulator FruR  30.51 
 
 
331 aa  159  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2929  DNA-binding transcriptional regulator FruR  29.91 
 
 
336 aa  159  9e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0626  DNA-binding transcriptional regulator FruR  28.7 
 
 
334 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.800956  normal  0.256043 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3550  DNA-binding transcriptional regulator FruR  30.8 
 
 
327 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1821  LacI family transcription regulator  30.96 
 
 
338 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0820  DNA-binding transcriptional regulator FruR  30.72 
 
 
331 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0953  fructose repressor FruR, putative  30.41 
 
 
331 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02609  hypothetical protein  29.68 
 
 
332 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0815  DNA-binding transcriptional regulator FruR  30.23 
 
 
354 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0792  DNA-binding transcriptional regulator FruR  30.3 
 
 
331 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217297  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0826  DNA-binding transcriptional regulator FruR  30.61 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 
353 aa  146  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 
333 aa  146  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02648  L-fuculose phosphate aldolase  30.03 
 
 
314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4401  DNA-binding transcriptional regulator FruR  30.27 
 
 
331 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  32.79 
 
 
334 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  29.55 
 
 
335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  30.23 
 
 
348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  31.95 
 
 
337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1009  transcriptional regulator, LacI family  29.63 
 
 
345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.285853 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  34.38 
 
 
330 aa  140  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.97 
 
 
339 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  28.08 
 
 
339 aa  136  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3944  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 
346 aa  135  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  30.57 
 
 
343 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2649  DNA-binding transcriptional regulator FruR  30.1 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2503  transcriptional regulator  28.08 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117668  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  30.03 
 
 
342 aa  133  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.62 
 
 
333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12180  DNA-binding transcriptional regulator FruR  30.38 
 
 
330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382176  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  31.41 
 
 
340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  26.95 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.03 
 
 
342 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.03 
 
 
342 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  31.49 
 
 
334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  30.68 
 
 
344 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0226  LacI family transcription regulator  30.36 
 
 
336 aa  129  8.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.15 
 
 
336 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  31.65 
 
 
340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  30.65 
 
 
337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.94 
 
 
342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  31.01 
 
 
355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  29.59 
 
 
337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  30.41 
 
 
343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6090  transcriptional regulator, LacI family  31.27 
 
 
347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  31 
 
 
338 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  31.2 
 
 
339 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  29.41 
 
 
334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00440  transcriptional regulator, LacI family  25.89 
 
 
338 aa  126  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  31.29 
 
 
340 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5093  transcriptional regulator, LacI family  29.57 
 
 
343 aa  125  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.225066  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1069  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  30.92 
 
 
328 aa  125  9e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.209088 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2811  regulatory protein LacI  26.65 
 
 
412 aa  125  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2837  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 
344 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672578  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.29 
 
 
338 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0588  LacI family transcription regulator  30.92 
 
 
328 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.979882  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0527  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  30.92 
 
 
328 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  31.2 
 
 
346 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  31.89 
 
 
347 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  31.25 
 
 
333 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  28.8 
 
 
336 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  28.1 
 
 
336 aa  125  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.74 
 
 
337 aa  124  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  29.88 
 
 
337 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>