75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2020 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2906  sucrose porin ScrY  80.99 
 
 
505 aa  852    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00076782  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2020  porin, LamB type  100 
 
 
505 aa  1038    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0033188  normal  0.185389 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0394  porin LamB type  62.36 
 
 
519 aa  650    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215814  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3756  porin LamB type  57.33 
 
 
538 aa  634    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0380817  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0350  porin LamB type  63.14 
 
 
511 aa  656    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672249  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3593  porin LamB type  56.4 
 
 
539 aa  626  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0257  porin, LamB type  47.85 
 
 
504 aa  459  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0890  sucrose porin precursor  52.98 
 
 
540 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0763  porin, LamB type  52.97 
 
 
525 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00125923  normal  0.916374 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000601  maltoporin  45.35 
 
 
479 aa  437  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00907071  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51510  sucrose porin  46.34 
 
 
535 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51790  sucrose porin  45.26 
 
 
539 aa  396  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3435  porin LamB type  40.38 
 
 
550 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0966151  hitchhiker  0.0055401 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0457  porin, LamB type  29.05 
 
 
531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.467074 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001084  maltoporin  26.73 
 
 
423 aa  94.4  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.62709  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1154  porin, LamB type  27.31 
 
 
411 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193768  normal  0.463073 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3137  maltoporin  25.87 
 
 
423 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559098  normal  0.0102829 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4574  maltoporin  27.33 
 
 
452 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4625  maltoporin  27.83 
 
 
452 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.121289 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4423  maltoporin  27.33 
 
 
452 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179955 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4488  maltoporin  27.61 
 
 
452 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27200  LamB type porin  27.61 
 
 
412 aa  84.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178962  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4573  maltoporin  27.11 
 
 
452 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.254819  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3911  maltoporin  27.27 
 
 
423 aa  83.6  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.714195  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0381  maltoporin  27.27 
 
 
423 aa  83.6  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0309  maltoporin  27.27 
 
 
423 aa  83.6  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.288969  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04821  maltoporin  25.38 
 
 
447 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5152  porin LamB type  26.86 
 
 
416 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.430452  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03908  maltoporin precursor  26.25 
 
 
446 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3959  porin LamB type  26.25 
 
 
446 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03868  hypothetical protein  26.25 
 
 
446 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4498  maltoporin  26.25 
 
 
446 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4276  maltoporin  26.25 
 
 
446 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4588  maltoporin  26.25 
 
 
446 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3993  maltoporin  26.25 
 
 
446 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4285  porin LamB type  27.13 
 
 
441 aa  77  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5517  maltoporin  26.03 
 
 
446 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.338652  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0241  maltoporin  26.59 
 
 
444 aa  76.6  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4263  porin LamB type  26 
 
 
468 aa  74.7  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50270  LamB type porin  26.21 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0837995  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22010  LamB type porin  25.87 
 
 
380 aa  72.8  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.791841  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4132  porin, LamB type  26.04 
 
 
463 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50210  LamB type porin  26.9 
 
 
410 aa  69.3  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.250171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51390  LamB type porin  24.6 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0975  maltoporin  25.81 
 
 
419 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0920  maltoporin  25.81 
 
 
419 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3356  maltoporin  25.81 
 
 
419 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0213  maltoporin  26.67 
 
 
416 aa  64.3  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00663461  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16650  LamB type porin  25.06 
 
 
424 aa  63.9  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.628655  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4469  maltoporin  24.22 
 
 
434 aa  63.5  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.46123  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4204  hypothetical protein  42.75 
 
 
469 aa  62.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33610  LamB type porin  25.68 
 
 
407 aa  63.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26940  LamB type porin  24.94 
 
 
424 aa  63.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453855  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0254  maltoporin  24.61 
 
 
456 aa  61.6  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09190  LamB type porin  25.46 
 
 
411 aa  60.8  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0328705  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1736  glucoside specific outer membrane porin BglH-like protein  22.96 
 
 
557 aa  57  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2955  maltoporin  30.41 
 
 
435 aa  53.9  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0766  glycoporin  37.78 
 
 
494 aa  53.9  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0618406  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0760  porin LamB type  22.14 
 
 
540 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.44731  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3690  maltoporin precursor  25.29 
 
 
395 aa  51.6  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0553  maltoporin  32.69 
 
 
450 aa  50.8  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1781  maltoporin precursor  26.14 
 
 
395 aa  50.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.488444  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1636  glucoside specific outer membrane porin BglH  25.88 
 
 
557 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4291  glycoporin RafY  33 
 
 
464 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.216775 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03786  putative glycoporin  33 
 
 
464 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1323  maltoporin  28.77 
 
 
435 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03735  hypothetical protein  33 
 
 
464 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5352  glycoporin RafY  33 
 
 
464 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05328  porin transmembrane protein  24.04 
 
 
414 aa  47.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245127  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1282  maltoporin  30.34 
 
 
423 aa  47.8  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2933  putative glycoporin  38.14 
 
 
456 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0271208  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3016  putative glycoporin  38.14 
 
 
456 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112246 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2964  putative glycoporin  38.14 
 
 
456 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  hitchhiker  0.00105838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2999  putative glycoporin  33.33 
 
 
456 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.419579  hitchhiker  0.000157267 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2740  porin LamB type  24.41 
 
 
518 aa  43.9  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>