More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1753 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  64.62 
 
 		 715 aa  995    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  64.76 
 
 		 715 aa  994    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00920  formate dehydrogenase alpha subunit  53.91 
 
 		 737 aa  842    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  64.62 
 
 		 715 aa  995    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3829  formate dehydrogenase, alpha subunit  70.39 
 
 		 715 aa  1062    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151921  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0281  formate dehydrogenase alpha subunit  62.23 
 
 		 559 aa  744    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0729  formate dehydrogenase H  70.67 
 
 		 715 aa  1064    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.708724 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4635  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  63.15 
 
 		 559 aa  749    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1753  formate dehydrogenase alpha subunit  100 
 
 		 716 aa  1496    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0179443  hitchhiker  0.000996092 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1781  formate dehydrogenase, alpha subunit  69.24 
 
 		 716 aa  1062    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2859  formate dehydrogenase, alpha subunit  56.94 
 
 		 808 aa  879    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  67.37 
 
 		 713 aa  1033    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  65.03 
 
 		 715 aa  999    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  65.03 
 
 		 715 aa  999    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  65.03 
 
 		 715 aa  999    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1383  formate dehydrogenase, alpha subunit  68.9 
 
 		 716 aa  1057    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.627092  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4578  formate dehydrogenase, alpha subunit  67.46 
 
 		 723 aa  1024    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1268  formate dehydrogenase, alpha subunit  69.01 
 
 		 716 aa  1061    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2721  formate dehydrogenase, alpha subunit  69.01 
 
 		 716 aa  1057    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0016187  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2424  formate dehydrogenase, alpha subunit  80.36 
 
 		 718 aa  1216    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.680227 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3682  anaerobic formate dehydrogenase, alpha subunit, -type  70.53 
 
 		 715 aa  1063    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  44.63 
 
 		 745 aa  613  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.19 
 
 		 893 aa  597  1e-169  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.77 
 
 		 676 aa  581  1e-164  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.19 
 
 		 893 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.34 
 
 		 676 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.34 
 
 		 676 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.67 
 
 		 900 aa  570  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.67 
 
 		 917 aa  566  1e-160  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.59 
 
 		 893 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  42.17 
 
 		 689 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.01 
 
 		 901 aa  565  1.0000000000000001e-159  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.87 
 
 		 677 aa  559  1e-158  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.41 
 
 		 689 aa  555  1e-157  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  42.2 
 
 		 899 aa  557  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.4 
 
 		 904 aa  555  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.9 
 
 		 688 aa  554  1e-156  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.2 
 
 		 674 aa  550  1e-155  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.06 
 
 		 686 aa  549  1e-155  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.77 
 
 		 687 aa  551  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.74 
 
 		 879 aa  547  1e-154  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.75 
 
 		 674 aa  543  1e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.63 
 
 		 688 aa  543  1e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.97 
 
 		 688 aa  544  1e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.75 
 
 		 674 aa  543  1e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.52 
 
 		 905 aa  545  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  41.06 
 
 		 695 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.52 
 
 		 674 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  40.66 
 
 		 687 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.4 
 
 		 688 aa  538  1e-151  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.58 
 
 		 906 aa  533  1e-150  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.67 
 
 		 686 aa  529  1e-149  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.07 
 
 		 898 aa  530  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.46 
 
 		 685 aa  526  1e-148  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.37 
 
 		 1424 aa  522  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.24 
 
 		 685 aa  524  1e-147  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.74 
 
 		 911 aa  524  1e-147  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.78 
 
 		 1440 aa  522  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.12 
 
 		 900 aa  522  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.6 
 
 		 724 aa  520  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.78 
 
 		 1421 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.34 
 
 		 945 aa  513  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.83 
 
 		 1425 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.77 
 
 		 1110 aa  511  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.78 
 
 		 1425 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.94 
 
 		 1425 aa  512  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.17 
 
 		 903 aa  509  1e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.94 
 
 		 1432 aa  510  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.64 
 
 		 1428 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.66 
 
 		 1432 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.52 
 
 		 1410 aa  505  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.43 
 
 		 925 aa  504  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.66 
 
 		 1432 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2274  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.74 
 
 		 956 aa  496  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217783 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.71 
 
 		 937 aa  498  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.98 
 
 		 1130 aa  496  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  40.32 
 
 		 1387 aa  497  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.9 
 
 		 1406 aa  498  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  38.85 
 
 		 1385 aa  494  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.52 
 
 		 1440 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.55 
 
 		 927 aa  493  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.55 
 
 		 920 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.05 
 
 		 1111 aa  490  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4072  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.81 
 
 		 957 aa  489  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.34 
 
 		 963 aa  489  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.33 
 
 		 944 aa  488  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.79 
 
 		 933 aa  487  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.43 
 
 		 989 aa  483  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  39.09 
 
 		 1412 aa  485  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0293  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.31 
 
 		 989 aa  480  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.61 
 
 		 886 aa  480  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.97 
 
 		 979 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.43 
 
 		 1426 aa  482  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.02 
 
 		 947 aa  478  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.43 
 
 		 956 aa  478  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.49 
 
 		 1000 aa  476  1e-133  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0255  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.41 
 
 		 952 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971632  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3710  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  36.92 
 
 		 977 aa  478  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.749683  normal  0.699855 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0720  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.31 
 
 		 949 aa  478  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  37.25 
 
 		 982 aa  479  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>