39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1693 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1693  putative ABC transporter solute-binding protein  100 
 
 
390 aa  796    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.949015  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1888  extracellular solute-binding protein family 1  75.27 
 
 
388 aa  553  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00824785  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01711  hypothetical protein  75.27 
 
 
388 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1878  putative ABC transporter solute-binding protein  75 
 
 
388 aa  551  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000418187 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1977  putative ABC transporter solute-binding protein  75.48 
 
 
388 aa  552  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1838  putative ABC transporter solute-binding protein  75.27 
 
 
388 aa  553  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01723  hypothetical protein  75.27 
 
 
388 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2003  putative ABC transporter solute-binding protein  75.2 
 
 
388 aa  549  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.203142  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1436  putative ABC transporter solute-binding protein  74.46 
 
 
388 aa  550  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.463512  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2473  putative ABC transporter solute-binding protein  74.18 
 
 
388 aa  546  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3278  putative ABC transporter solute-binding protein  47.75 
 
 
408 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2438  hypothetical protein  47.34 
 
 
409 aa  355  5.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.557423  normal  0.459913 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4046  putative ABC transporter solute-binding protein  48.37 
 
 
406 aa  355  8.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02678  putative ABC transporter solute-binding protein  43.73 
 
 
403 aa  347  3e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003793  ABC transporter substrate-binding protein YnjB  42.86 
 
 
386 aa  345  6e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000277117  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0361  putative ABC transporter solute-binding protein  43.6 
 
 
380 aa  331  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.083844  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2768  putative ABC transporter solute-binding protein  43.05 
 
 
381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.211813  normal  0.195627 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3226  putative ABC transporter solute-binding protein  43.39 
 
 
401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0901142  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1269  putative ABC transporter solute-binding protein  43.49 
 
 
382 aa  323  3e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000820878  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0200  putative ABC transporter solute-binding protein  41.67 
 
 
401 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91232  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2251  putative ABC transporter solute-binding protein  42.67 
 
 
399 aa  317  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1446  putative ABC transporter solute-binding protein  43.58 
 
 
401 aa  316  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.50777  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1832  putative ABC transporter solute-binding protein  43.12 
 
 
401 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.563171 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0976  putative ABC transporter solute-binding protein  38.27 
 
 
435 aa  292  8e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0656307 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2153  extracellular solute-binding protein  41.51 
 
 
404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000427732 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01789  putative ABC-type transport system, periplasmic component  39.4 
 
 
384 aa  272  8.000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2959  putative ABC transporter solute-binding protein  37.4 
 
 
419 aa  266  5e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0393  putative ABC transporter solute-binding protein  37.99 
 
 
373 aa  258  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.235452  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0532  putative ABC transporter solute-binding protein  39.22 
 
 
439 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.96386  normal  0.487675 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0759  putative ABC transporter solute-binding protein  37.67 
 
 
429 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1199  putative ABC transporter solute-binding protein  40.84 
 
 
430 aa  233  5e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.134978 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2122  putative ABC transporter solute-binding protein  36.09 
 
 
409 aa  231  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4231  putative ABC transporter solute-binding protein  35.71 
 
 
410 aa  230  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0791  putative ABC transporter solute-binding protein  35.16 
 
 
403 aa  226  6e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1236  hypothetical protein  37.19 
 
 
429 aa  209  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2068  putative ABC transporter solute-binding protein  35.71 
 
 
424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.730242  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1874  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 
375 aa  59.7  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2094  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  25.08 
 
 
377 aa  55.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6580  extracellular solute-binding protein family 1  23.74 
 
 
381 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384654  normal  0.213985 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>