More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1571 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  100 
 
 
192 aa  380  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  72.34 
 
 
213 aa  280  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  72.19 
 
 
188 aa  275  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  72.19 
 
 
188 aa  275  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  72.19 
 
 
188 aa  276  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  72.19 
 
 
188 aa  276  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  72.19 
 
 
188 aa  275  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  72.19 
 
 
188 aa  276  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  72.19 
 
 
188 aa  276  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  72.19 
 
 
188 aa  276  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  69.68 
 
 
190 aa  271  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2031  YceJ  70 
 
 
192 aa  267  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1269  hypothetical protein  70.21 
 
 
190 aa  267  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2215  hypothetical protein  70.21 
 
 
190 aa  266  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.511005 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1254  hypothetical protein  68.42 
 
 
192 aa  264  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.73358 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  63.44 
 
 
189 aa  254  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  61.83 
 
 
189 aa  250  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  65.03 
 
 
184 aa  248  6e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  68.13 
 
 
184 aa  246  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1930  cytochrome B561  64.29 
 
 
184 aa  244  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1820  cytochrome b561 family protein  64.29 
 
 
184 aa  244  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593327  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2223  cytochrome b561 family protein  63.74 
 
 
184 aa  243  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0039455  hitchhiker  0.00454282 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  61.75 
 
 
183 aa  239  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  61.75 
 
 
183 aa  239  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  62.84 
 
 
183 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  65.75 
 
 
184 aa  236  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  62.3 
 
 
183 aa  235  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  61.2 
 
 
183 aa  227  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  63.19 
 
 
182 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5072  cytochrome b561, putative  63.54 
 
 
184 aa  225  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  59.12 
 
 
196 aa  221  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2822  cytochrome B561  65.38 
 
 
184 aa  216  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79842  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03240  cytochrome b561  56.83 
 
 
184 aa  202  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  49.44 
 
 
189 aa  186  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2791  cytochrome B561  50.56 
 
 
182 aa  185  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  46.15 
 
 
186 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  46.45 
 
 
183 aa  180  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1120  cytochrome B561  49.44 
 
 
184 aa  171  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000137011  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  47.73 
 
 
179 aa  169  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  46.02 
 
 
179 aa  168  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  46.33 
 
 
183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  46.33 
 
 
183 aa  164  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  45.2 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  45.76 
 
 
183 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1216  cytochrome b561  48.02 
 
 
183 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000559854  normal  0.299312 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  45.6 
 
 
181 aa  160  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2876  cytochrome B561  48.02 
 
 
185 aa  159  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.379711  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  43.5 
 
 
183 aa  157  7e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  43.5 
 
 
183 aa  157  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  43.5 
 
 
183 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  47.49 
 
 
183 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  43.5 
 
 
183 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2129  cytochrome B561  46.2 
 
 
198 aa  155  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000482046  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1316  cytochrome B561  48.02 
 
 
183 aa  154  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171547  normal  0.725201 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03827  putative cytochrome b561  45.65 
 
 
189 aa  154  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1313  cytochrome B561  46.86 
 
 
184 aa  149  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169075  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3371  cytochrome B561  42.37 
 
 
183 aa  148  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1042  cytochrome B561  48.02 
 
 
175 aa  143  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  41.71 
 
 
188 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1404  cytochrome B561  40.45 
 
 
179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.610566  normal  0.317054 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0949  cytochrome b561  44.32 
 
 
181 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000303039  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  36.96 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  39.2 
 
 
183 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  36.47 
 
 
195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  38.17 
 
 
176 aa  112  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  35.29 
 
 
193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  37.63 
 
 
176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  32.94 
 
 
193 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  34.43 
 
 
190 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  34.81 
 
 
182 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  34.81 
 
 
182 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  34.07 
 
 
203 aa  101  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  34.88 
 
 
178 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  31.58 
 
 
173 aa  98.6  4e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  34.64 
 
 
191 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  37.36 
 
 
196 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2152  cytochrome B561  38.1 
 
 
180 aa  95.5  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00081786  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  31.98 
 
 
183 aa  95.1  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2570  cytochrome B561  35 
 
 
197 aa  94.7  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  32.18 
 
 
186 aa  94.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  34.43 
 
 
197 aa  94.7  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  32.18 
 
 
186 aa  94.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  34.97 
 
 
222 aa  94.4  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  32.37 
 
 
186 aa  94.4  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  32.75 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  34.64 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  34.81 
 
 
203 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  40 
 
 
174 aa  92  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0973  cytochrome b561 family protein  33.13 
 
 
181 aa  92  5e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  32.76 
 
 
186 aa  92  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  29.48 
 
 
181 aa  92  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  33.7 
 
 
199 aa  91.3  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  34.22 
 
 
188 aa  90.5  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  30.94 
 
 
182 aa  90.9  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  32.18 
 
 
186 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  31.75 
 
 
185 aa  89.4  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  31.46 
 
 
186 aa  89.4  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  31.46 
 
 
186 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  30.9 
 
 
186 aa  89  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  31.98 
 
 
191 aa  88.2  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>