More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1313 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03520  conserved hypothetical protein  83.1 
 
 		 452 aa  757    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0926  putative hexuronate transporter  75.17 
 
 		 435 aa  664    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1611  major facilitator superfamily MFS_1  80.28 
 
 		 433 aa  707    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.585379  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3599  major facilitator transporter  76.16 
 
 		 435 aa  672    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00583195  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1313  major facilitator transporter  100 
 
 		 433 aa  874    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.720769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3361  putative hexuronate transporter  75.17 
 
 		 435 aa  663    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1642  major facilitator superfamily MFS_1  80.74 
 
 		 432 aa  706    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.3142  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2353  major facilitator superfamily MFS_1  86.54 
 
 		 436 aa  768    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0978  major facilitator transporter  75.17 
 
 		 435 aa  664    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03471  hypothetical protein  83.1 
 
 		 452 aa  757    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2627  major facilitator superfamily MFS_1  85.85 
 
 		 436 aa  768    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  47.03 
 
 		 430 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  47.27 
 
 		 430 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  46.84 
 
 		 423 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  46.44 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  45.84 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4207  major facilitator transporter  45.48 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0961062  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  45.48 
 
 		 423 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3566  major facilitator transporter  45.15 
 
 		 443 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000684429  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4048  major facilitator transporter  45.11 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0187179  normal  0.633628 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4159  major facilitator transporter  45.48 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  decreased coverage  0.00263409 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0834  hexuronate transporter transmembrane protein  43.84 
 
 		 435 aa  358  9e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00560856 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4579  major facilitator superfamily MFS_1  41.63 
 
 		 433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571903 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3386  hexuronate transporter  43.74 
 
 		 434 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.333246  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4445  major facilitator superfamily MFS_1  41.63 
 
 		 433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3316  hexuronate transporter  43.74 
 
 		 434 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3380  hexuronate transporter  43.74 
 
 		 434 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  0.6284 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3306  hexuronate transporter  43.74 
 
 		 434 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3479  hexuronate transporter  43.74 
 
 		 434 aa  356  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0610  major facilitator transporter  44.28 
 
 		 430 aa  354  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400877  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4322  d-galactonate transporter  42.65 
 
 		 432 aa  351  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02962  hexuronate transporter  42.79 
 
 		 472 aa  351  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3561  putative hexuronate transporter  42.79 
 
 		 432 aa  351  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02913  hypothetical protein  42.79 
 
 		 472 aa  351  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0553  d-galactonate transporter  41.77 
 
 		 434 aa  349  5e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.351291  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1105  putative hexuronate MFS transporter ExuT  41.77 
 
 		 434 aa  349  5e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000998284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0490  putative hexuronate MFS transporter ExuT  41.77 
 
 		 433 aa  349  5e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.40951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0528  d-galactonate transporter  42.96 
 
 		 433 aa  349  6e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0745  d-galactonate transporter  41.94 
 
 		 433 aa  348  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3386  d-galactonate transporter  42 
 
 		 434 aa  346  4e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3547  d-galactonate transporter  42.72 
 
 		 474 aa  345  6e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.48586 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3529  hexuronate transporter  42.31 
 
 		 432 aa  343  4e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3512  d-galactonate transporter  42.61 
 
 		 433 aa  342  7e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0608  d-galactonate transporter  42.55 
 
 		 432 aa  340  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4408  hexuronate transporter  42.55 
 
 		 432 aa  340  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.591703 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3385  hexuronate transporter  42.55 
 
 		 432 aa  340  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0607  d-galactonate transporter  42.55 
 
 		 432 aa  340  2e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3276  putative hexuronate transporter  42.55 
 
 		 432 aa  340  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  41.93 
 
 		 425 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  41.93 
 
 		 425 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4247  major facilitator transporter  40.83 
 
 		 429 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  42.27 
 
 		 411 aa  323  4e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0935  major facilitator transporter  40.34 
 
 		 427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.881993  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5219  MFS transporter, phthalate permease family  41.04 
 
 		 436 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4857  major facilitator superfamily MFS_1  39.66 
 
 		 430 aa  300  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133188  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1806  major facilitator superfamily metabolite(phthalate/hexuronate)/H(+) symporter  39.16 
 
 		 433 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0119934 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0325  general substrate transporter:TonB box, N-terminal  41.04 
 
 		 436 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000282343  normal  0.265981 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  33.74 
 
 		 433 aa  223  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 441 aa  208  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 428 aa  204  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 441 aa  202  9e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 434 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  29.25 
 
 		 424 aa  197  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 		 431 aa  196  7e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 432 aa  193  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2345  transporter, putative  32.18 
 
 		 439 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 		 436 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 430 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 426 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5030  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 441 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.580497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 424 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2129  major facilitator transporter  32.4 
 
 		 442 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.526702  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 441 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 441 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  31.84 
 
 		 480 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  30.8 
 
 		 441 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0325  MFS family transporter  30.23 
 
 		 442 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 420 aa  180  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11473  putative hexuronate transport protein (MFS family)  27.36 
 
 		 424 aa  180  4.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.485615  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51130  MFS (major facilitator superfamily) transporter  30.39 
 
 		 439 aa  179  9e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.845287  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 449 aa  179  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1170  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 		 425 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 431 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3179  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 432 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 427 aa  176  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4907  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3045  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 435 aa  170  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 453 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 439 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 449 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 		 415 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 429 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3658  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 432 aa  162  9e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02062  putative transporter transmembrane protein  27.62 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000104941  normal  0.781434 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 430 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 442 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 454 aa  161  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>