40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1196 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00638  predicted outer membrane porin  88.89 
 
 
468 aa  854  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.207066  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0325  OprD family outer membrane porin  67.81 
 
 
473 aa  646  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.8295e-09  normal  0.923743 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1230  outer membrane porin  75.16 
 
 
467 aa  716  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.033366  normal  0.0846349 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0709  porin D  88.68 
 
 
468 aa  853  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.16757e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0728  OprD family outer membrane porin  88.89 
 
 
468 aa  854  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00197385  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2905  OprD family outer membrane porin  67.81 
 
 
473 aa  647  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0155537  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2993  outer membrane porin  67.81 
 
 
473 aa  647  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2975  outer membrane porin  88.89 
 
 
468 aa  854  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162497  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0703  OprD family outer membrane porin  88.46 
 
 
468 aa  851  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000220662  normal  0.949628 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1196  outer membrane porin  100 
 
 
465 aa  953  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000266112  decreased coverage  3.40238e-05 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0569  outer membrane porin, OprD family  88.68 
 
 
468 aa  852  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.03252e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2956  outer membrane porin  88.68 
 
 
468 aa  852  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00243761  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00629  hypothetical protein  88.89 
 
 
468 aa  854  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0734  outer membrane porin, OprD family  87.82 
 
 
468 aa  842  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.897732  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0843  outer membrane porin, OprD family  87.82 
 
 
468 aa  842  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0807  OprD family outer membrane porin  87.82 
 
 
468 aa  842  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0746  outer membrane porin, OprD family  87.61 
 
 
468 aa  840  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1391  outer membrane porin  39.13 
 
 
447 aa  315  1e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01313  hypothetical protein  34.67 
 
 
461 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004152  N-acetylglucosamine-regulated outer membrane porin  30.06 
 
 
469 aa  136  7e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.569888  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22560  OprE-like outer membrane porin  22.95 
 
 
443 aa  69.3  1e-10  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  25.25 
 
 
418 aa  55.8  2e-06  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  24.6 
 
 
446 aa  53.1  1e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  1.58939e-06  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  24.49 
 
 
417 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  24.49 
 
 
417 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  23.32 
 
 
440 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  24.49 
 
 
417 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0268  outer membrane porin  20.67 
 
 
439 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0284  outer membrane porin  20.67 
 
 
439 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314228  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  22.74 
 
 
443 aa  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4940  outer membrane porin  21.21 
 
 
439 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.849665  hitchhiker  1.84372e-07 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4465  porin, putative  22.8 
 
 
450 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  24.53 
 
 
448 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0294  outer membrane porin  20.46 
 
 
439 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21290  OprE-like outer membrane porin  22.25 
 
 
457 aa  45.8  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3987  porin D  24.38 
 
 
448 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4237  outer membrane porin  22.29 
 
 
471 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0537439  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  22.3 
 
 
439 aa  43.5  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10640  OprE-like outer membrane porin  24.01 
 
 
456 aa  43.1  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0112866  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  31.71 
 
 
440 aa  43.1  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.530004 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>