More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1195 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  61.61 
 
 
569 aa  696  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2669  glutaminyl-tRNA synthetase  73.5 
 
 
556 aa  853  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0864702  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  94.05 
 
 
555 aa  1105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  57.94 
 
 
565 aa  670  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  94.23 
 
 
555 aa  1107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  94.05 
 
 
555 aa  1105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0682  glutaminyl-tRNA synthetase  57.37 
 
 
582 aa  657  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  normal  0.476969 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1216  glutaminyl-tRNA synthetase  73.22 
 
 
555 aa  851  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  56.43 
 
 
560 aa  645  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0492  glutaminyl-tRNA synthetase  67.03 
 
 
553 aa  790  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.607402 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1845  glutaminyl-tRNA synthetase  58.75 
 
 
559 aa  682  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  58.84 
 
 
570 aa  668  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  57.84 
 
 
558 aa  667  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04610  glutaminyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 
579 aa  635  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.959469  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1419  glutaminyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 
569 aa  657  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0737  glutaminyl-tRNA synthetase  56.82 
 
 
576 aa  653  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2828  glutaminyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 
569 aa  637  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531779  normal  0.0114243 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0459  glutaminyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 
569 aa  657  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.200352  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01892  glutaminyl-tRNA synthetase  70.02 
 
 
555 aa  830  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00449379  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  59.17 
 
 
564 aa  672  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2184  glutaminyl-tRNA synthetase  73.88 
 
 
558 aa  889  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2758  glutaminyl-tRNA synthetase  73.32 
 
 
556 aa  852  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112039  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3475  glutaminyl-tRNA synthetase  55.6 
 
 
580 aa  641  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.675011  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 
552 aa  645  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 
552 aa  644  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  1.13459e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  73.73 
 
 
548 aa  863  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  91.89 
 
 
554 aa  1082  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  73.14 
 
 
556 aa  847  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0137132  hitchhiker  0.0018216 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2571  glutaminyl-tRNA synthetase  73.32 
 
 
556 aa  849  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838936  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  79.45 
 
 
552 aa  939  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2615  glutaminyl-tRNA synthetase  71.74 
 
 
556 aa  843  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  94.23 
 
 
555 aa  1107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  57.96 
 
 
589 aa  658  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  94.23 
 
 
555 aa  1107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1282  glutaminyl-tRNA synthetase  57.99 
 
 
569 aa  647  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  59.28 
 
 
556 aa  686  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  61.37 
 
 
565 aa  717  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  92.25 
 
 
554 aa  1083  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  62.16 
 
 
580 aa  704  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  2.34027e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  92.43 
 
 
554 aa  1086  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  85.66 
 
 
555 aa  1013  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  60.69 
 
 
567 aa  709  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  60.51 
 
 
567 aa  707  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  85.84 
 
 
555 aa  1014  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  8.8467e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1910  glutaminyl-tRNA synthetase  57.27 
 
 
569 aa  648  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  60.5 
 
 
557 aa  696  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  59.46 
 
 
561 aa  687  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1585  glutaminyl-tRNA synthetase  73.5 
 
 
571 aa  855  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000343871  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1619  glutaminyl-tRNA synthetase  73.68 
 
 
556 aa  854  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308456  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  57.92 
 
 
562 aa  657  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  85.84 
 
 
555 aa  1014  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2689  glutaminyl-tRNA synthetase  73.5 
 
 
556 aa  856  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00133273  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  85.74 
 
 
554 aa  1009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1533  glutaminyl-tRNA synthetase  71.82 
 
 
556 aa  840  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.208966  normal  0.486812 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  92.43 
 
 
554 aa  1086  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  80.98 
 
 
556 aa  965  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4500  glutaminyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 
563 aa  643  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111687  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  92.25 
 
 
554 aa  1084  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0421  glutaminyl-tRNA synthetase  56.47 
 
 
559 aa  644  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0907  glutaminyl-tRNA synthetase  56.33 
 
 
573 aa  643  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47238  normal  0.116742 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  73.14 
 
 
556 aa  851  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00615688  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1633  glutaminyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 
569 aa  657  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234579  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1655  glutaminyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 
569 aa  657  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434975  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0701  glutaminyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 
569 aa  657  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2516  glutaminyl-tRNA synthetase  71.82 
 
 
556 aa  842  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0318208  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1316  glutaminyl-tRNA synthetase  57.99 
 
 
569 aa  647  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 
561 aa  675  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 
555 aa  1161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  2.65755e-05 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1482  glutaminyl-tRNA synthetase  72.6 
 
 
556 aa  845  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  60.73 
 
 
555 aa  698  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1012  glutaminyl-tRNA synthetase  56.17 
 
 
705 aa  639  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1383  glutaminyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 
569 aa  637  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.21862 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3121  glutaminyl-tRNA synthetase  70.91 
 
 
556 aa  833  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  4.96067e-06 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  59.49 
 
 
568 aa  689  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  60.33 
 
 
567 aa  707  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  92.43 
 
 
554 aa  1086  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2363  glutaminyl-tRNA synthetase  57.64 
 
 
570 aa  646  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.621285 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0922  glutaminyl-tRNA synthetase  68.55 
 
 
559 aa  809  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3486  glutaminyl-tRNA synthetase  57.69 
 
 
565 aa  642  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3791  glutaminyl-tRNA synthetase  59.17 
 
 
565 aa  664  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  59.49 
 
 
556 aa  683  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1843  glutaminyl-tRNA synthetase  55.8 
 
 
559 aa  640  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311784  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  56.49 
 
 
609 aa  662  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  58.8 
 
 
565 aa  662  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0242  glutaminyl-tRNA synthetase  60.33 
 
 
555 aa  679  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 
569 aa  652  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1133  glutaminyl-tRNA synthetase  56.45 
 
 
579 aa  645  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.613915  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4241  glutaminyl-tRNA synthetase  58.09 
 
 
564 aa  659  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2811  glutaminyl-tRNA synthetase  54.76 
 
 
561 aa  638  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  58.15 
 
 
556 aa  664  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00970277  normal  0.785784 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  58.11 
 
 
563 aa  665  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0791  glutaminyl-tRNA synthetase  55.75 
 
 
580 aa  642  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00535923  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  82.07 
 
 
556 aa  971  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  8.5379e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6655  glutaminyl-tRNA synthetase  55.82 
 
 
583 aa  652  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204769  normal  0.445852 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1270  glutaminyl-tRNA synthetase  54.69 
 
 
551 aa  649  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1812  glutaminyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 
596 aa  657  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0624978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  61.02 
 
 
566 aa  703  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1786  glutaminyl-tRNA synthetase  73.14 
 
 
556 aa  846  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  58.23 
 
 
572 aa  679  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3126  glutaminyl-tRNA synthetase  83.45 
 
 
552 aa  986  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0016183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>