30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1003 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_1003  RecT protein  100 
 
 		 303 aa  632  1e-180  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  hitchhiker  0.0000388428 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0283  RecT family protein  60.87 
 
 		 300 aa  275  7e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1916  RecT protein  50.39 
 
 		 307 aa  246  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.427469  hitchhiker  0.0000000000811142 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4070  RecT protein  38.99 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0866384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10013  bet  47.79 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00713  hypothetical protein  47.79 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3564  phage recombination protein Bet  47.06 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0102109  hitchhiker  5.30303e-19 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0805  phage recombination protein Bet  47.41 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501424  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3241  phage recombination protein Bet  47.41 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0062068  hitchhiker  0.00000845343 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2876  phage recombination protein Bet  47.41 
 
 		 261 aa  119  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00954022  normal  0.0589709 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0884  recombination protein bet  47.06 
 
 		 215 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2931  phage recombination protein Bet  46.32 
 
 		 261 aa  119  9e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321205  decreased coverage  3.3595200000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1112  recombination protein bet  46.32 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.104209  normal  0.366414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4008  RecT protein  27.78 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2617  recombination and repair protein RecT  29.27 
 
 		 268 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000206281  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0604  recombination and repair protein RecT  30.7 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01336  hypothetical protein  29.45 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2295  RecT protein  29.45 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000133363  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01326  recombination and repair protein  29.45 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1472  recombination and repair protein RecT  27.31 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.515262  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7123  RecT protein  33.14 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0610415  hitchhiker  0.000150871 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1382  recombination and repair protein RecT  28.83 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000254024 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1851  RecT protein  25.77 
 
 		 349 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0204847  decreased coverage  0.000000000311645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3047  RecT protein  31.21 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00571481  normal  0.0332137 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2699  rect protein  28.57 
 
 		 294 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497074  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4180  hypothetical protein  27.33 
 
 		 215 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.171725  normal  0.246945 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4181  hypothetical protein  26.89 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.120409  normal  0.252411 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1674  recombinational DNA repair protein (RecE pathway)  21.08 
 
 		 310 aa  43.5  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2078  RecT protein  24.44 
 
 		 306 aa  42.4  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2041  RecT protein  24.44 
 
 		 306 aa  42.4  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>