More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0966 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0966  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 
284 aa  567  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0553  thioredoxin domain-containing protein  87.68 
 
 
293 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0612  thioredoxin domain-containing protein  87.68 
 
 
293 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.557632  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0568  thioredoxin domain protein  87.68 
 
 
293 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0427  protein YbbN  86.27 
 
 
284 aa  504  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0571  protein YbbN  86.27 
 
 
284 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0596  protein YbbN  86.27 
 
 
284 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0531  protein YbbN  86.27 
 
 
284 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.735174  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0558  thioredoxin domain protein  87.32 
 
 
293 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0541  protein YbbN  86.27 
 
 
284 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0551  thioredoxin domain protein  86.97 
 
 
293 aa  504  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00443  predicted thioredoxin domain-containing protein  85.92 
 
 
284 aa  501  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3118  Thioredoxin domain protein  85.92 
 
 
284 aa  501  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00448  hypothetical protein  85.92 
 
 
284 aa  501  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3124  thioredoxin domain-containing protein  85.92 
 
 
284 aa  501  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112242 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3195  Thioredoxin domain protein  72.5 
 
 
286 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1155  thioredoxin domain-containing protein  72.54 
 
 
294 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  70.93 
 
 
289 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1120  Thioredoxin domain protein  70.36 
 
 
286 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  70.93 
 
 
289 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  70.93 
 
 
289 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3007  Thioredoxin domain protein  70.36 
 
 
286 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  66.43 
 
 
286 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01318  hypothetical protein  48.75 
 
 
334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0845  hypothetical protein  47.14 
 
 
282 aa  258  8e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  47.33 
 
 
289 aa  248  9e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004149  thioredoxin domain-containing protein  46.59 
 
 
284 aa  245  6e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0804  thioredoxin  44.37 
 
 
284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0498  hypothetical protein  42.86 
 
 
306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  43.82 
 
 
285 aa  223  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1527  thioredoxin domain-containing protein  45.39 
 
 
281 aa  221  8e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000426652  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1429  thioredoxin-related  40.14 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000020457  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2250  thioredoxin domain-containing protein  42.81 
 
 
287 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000378794  normal  0.196783 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2017  thioredoxin-like protein  42.46 
 
 
287 aa  212  7e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2442  thioredoxin domain-containing protein  42.81 
 
 
287 aa  210  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000180145  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2322  thioredoxin domain-containing protein  42.46 
 
 
287 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000013282  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2231  thioredoxin domain-containing protein  42.14 
 
 
279 aa  208  9e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00861922  hitchhiker  0.000221991 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2848  thioredoxin domain-containing protein  42.2 
 
 
281 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000781433  decreased coverage  0.00000000282875 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2298  thioredoxin domain-containing protein  41.75 
 
 
287 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0272  thioredoxin domain-containing protein  40.28 
 
 
281 aa  198  9e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0149418  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2662  thioredoxin domain-containing protein  43.16 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00566405  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2585  thioredoxin domain-containing protein  43.16 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000251345  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1539  thioredoxin domain-containing protein  38.73 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1859  thioredoxin domain-containing protein  37.83 
 
 
283 aa  190  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.145875  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1799  Thioredoxin domain protein  42.46 
 
 
287 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.635888  hitchhiker  0.000000415158 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2547  thioredoxin domain-containing protein  42.11 
 
 
287 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00617037  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4343  thioredoxin domain-containing protein  35 
 
 
280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1797  thioredoxin domain-containing protein  39.72 
 
 
281 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00348973  hitchhiker  0.000000176932 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1314  putative thioredoxin-like protein  37.94 
 
 
291 aa  176  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0231071  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  36.49 
 
 
290 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  36.14 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  34.4 
 
 
286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  35.79 
 
 
290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  35.34 
 
 
290 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  35.79 
 
 
290 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  35.44 
 
 
290 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  36.11 
 
 
289 aa  159  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  34.98 
 
 
290 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  35.54 
 
 
287 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  34.66 
 
 
290 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  35.44 
 
 
290 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  35.79 
 
 
289 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  32.62 
 
 
287 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  35.52 
 
 
286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  34.28 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  31.56 
 
 
287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  34.44 
 
 
282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  34.44 
 
 
282 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  33.7 
 
 
282 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  33.8 
 
 
291 aa  132  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  34.15 
 
 
274 aa  132  9e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  33.83 
 
 
280 aa  130  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  31.69 
 
 
302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  33.09 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  31.8 
 
 
317 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  30.21 
 
 
324 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  29.51 
 
 
324 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  32.16 
 
 
280 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  32 
 
 
302 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  32.72 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  32.72 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  32.52 
 
 
302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  32.52 
 
 
302 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  31.69 
 
 
301 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  32 
 
 
282 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  31.33 
 
 
302 aa  119  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  34.27 
 
 
304 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  33.22 
 
 
289 aa  118  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  33.22 
 
 
289 aa  118  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  29.82 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  32.17 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  32.73 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  32.73 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  28.77 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  34.14 
 
 
286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  34.08 
 
 
314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  31 
 
 
302 aa  115  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  32.72 
 
 
282 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  28.28 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  31.91 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>