More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0925 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0925  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
485 aa  979    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.447964  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6790  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.17 
 
 
487 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0748  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.87 
 
 
493 aa  371  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0620  GntR family transcriptional regulator  45.61 
 
 
496 aa  368  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1835  GntR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
478 aa  356  5.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.422733  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1854  GntR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
478 aa  355  7.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1901  GntR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
478 aa  355  7.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1043  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.8 
 
 
486 aa  342  9e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2700  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  43.22 
 
 
475 aa  339  8e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0691632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2084  GntR family transcriptional regulator  43.53 
 
 
504 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.87186  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2093  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.73 
 
 
503 aa  334  2e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.619312  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3184  regulatory protein GntR, HTH  41.39 
 
 
485 aa  334  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3410  transcriptional regulator  41.35 
 
 
485 aa  329  7e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.723571  decreased coverage  0.0095682 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4275  GntR family transcriptional regulator  39.87 
 
 
480 aa  325  9e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.310254  normal  0.794822 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2441  GntR family transcriptional regulator  40.92 
 
 
449 aa  324  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3402  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.73 
 
 
515 aa  319  7.999999999999999e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000368024  hitchhiker  0.000012724 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4144  putative transcriptional regulator, GntR family  43.79 
 
 
472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.805557 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3373  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
478 aa  311  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576212  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1408  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.44 
 
 
488 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5956  putative transcriptional regulator, GntR family  43.71 
 
 
486 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.072408 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2248  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.89 
 
 
486 aa  296  7e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000288373  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2369  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.17 
 
 
505 aa  288  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3344  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.71 
 
 
482 aa  286  7e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416348  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3924  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.6 
 
 
468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0615  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.66 
 
 
491 aa  240  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736452  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2586  putative transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 
478 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0905182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4172  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  33.54 
 
 
488 aa  221  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03897  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5610  putative transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 
468 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1217  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.92 
 
 
466 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  31.81 
 
 
493 aa  184  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6330  putative transcriptional regulator, GntR family  33.23 
 
 
437 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00057428  hitchhiker  0.00168096 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  26.62 
 
 
480 aa  176  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  27.96 
 
 
480 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  26.68 
 
 
480 aa  170  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
481 aa  169  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  26.89 
 
 
480 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  30.68 
 
 
498 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.14 
 
 
490 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  25.55 
 
 
485 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  24.31 
 
 
477 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  29.48 
 
 
471 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  25.05 
 
 
478 aa  154  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  23.99 
 
 
477 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  25.32 
 
 
477 aa  151  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  24.58 
 
 
477 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  28.19 
 
 
500 aa  150  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  26.06 
 
 
480 aa  150  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  24.68 
 
 
477 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  25.28 
 
 
477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  27.68 
 
 
517 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.85 
 
 
480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  24.84 
 
 
477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.58 
 
 
483 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  26.54 
 
 
480 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  29.74 
 
 
484 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  26.53 
 
 
480 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  26.3 
 
 
463 aa  148  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  24.62 
 
 
477 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  24.62 
 
 
477 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  24.48 
 
 
477 aa  147  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  0.00000201635 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  24.62 
 
 
477 aa  147  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  25.64 
 
 
480 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  25.64 
 
 
480 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  24.4 
 
 
477 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  26.99 
 
 
483 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  26.9 
 
 
480 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  24.4 
 
 
477 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.32 
 
 
480 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  24.03 
 
 
503 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  26.43 
 
 
480 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  24.4 
 
 
477 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3375  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.53 
 
 
470 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  26.81 
 
 
468 aa  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.34 
 
 
483 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3572  transcriptional regulator  27.31 
 
 
470 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.529399 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0112  transcriptional regulator  26.35 
 
 
484 aa  144  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  25.64 
 
 
480 aa  144  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0915  GntR family transcriptional regulator  27.53 
 
 
470 aa  143  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1425  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.75 
 
 
472 aa  143  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  23.75 
 
 
477 aa  142  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
397 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  26.23 
 
 
498 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3448  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
470 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1082  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  31.9 
 
 
457 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.029023  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  28.45 
 
 
504 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.11 
 
 
473 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  28.21 
 
 
478 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0253  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
483 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
482 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6904  transcriptional regulator  28.27 
 
 
483 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1567  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
397 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4302  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
521 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  28.73 
 
 
485 aa  136  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.63 
 
 
468 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0347  GntR family transcriptional regulator  21.59 
 
 
519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0965  GntR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 
402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 
402 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  26.54 
 
 
477 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0356  GntR family transcriptional regulator  21.34 
 
 
520 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.716166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>