241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0866 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  81.7 
 
 		 400 aa  689    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  81.7 
 
 		 400 aa  689    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  81.7 
 
 		 400 aa  688    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  79.95 
 
 		 400 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  81.2 
 
 		 400 aa  686    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  79.95 
 
 		 400 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  81.7 
 
 		 400 aa  689    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  81.2 
 
 		 400 aa  684    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  81.7 
 
 		 400 aa  689    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  100 
 
 		 401 aa  827    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  81.7 
 
 		 400 aa  689    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  79.95 
 
 		 400 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  81.7 
 
 		 400 aa  689    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  80.2 
 
 		 400 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  79.7 
 
 		 400 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  60.59 
 
 		 410 aa  516  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  59.01 
 
 		 408 aa  484  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  59.17 
 
 		 412 aa  487  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3277  exonuclease subunit SbcD  57.84 
 
 		 414 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  57.39 
 
 		 410 aa  480  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3288  exonuclease subunit SbcD  57.84 
 
 		 414 aa  479  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3138  exonuclease subunit SbcD  57.6 
 
 		 414 aa  478  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  60.7 
 
 		 410 aa  468  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  53.64 
 
 		 442 aa  431  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  52.96 
 
 		 404 aa  430  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1332  exonuclease subunit SbcD  50.98 
 
 		 414 aa  416  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  52.78 
 
 		 423 aa  414  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  50.99 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  49.77 
 
 		 506 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  49.88 
 
 		 414 aa  396  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  47.24 
 
 		 515 aa  385  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3442  exonuclease subunit SbcD  46.91 
 
 		 483 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.289654  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  51.98 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  47.84 
 
 		 425 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  44.92 
 
 		 408 aa  346  3e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  42.59 
 
 		 425 aa  340  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  37.99 
 
 		 409 aa  277  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  36.52 
 
 		 418 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2569  nuclease SbcCD, D subunit  36.74 
 
 		 410 aa  271  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  36.25 
 
 		 410 aa  261  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  36.03 
 
 		 414 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  36.76 
 
 		 408 aa  259  5.0000000000000005e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  35.68 
 
 		 409 aa  252  8.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2541  nuclease SbcCD, D subunit  31.7 
 
 		 498 aa  239  6.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1319  nuclease SbcCD, D subunit  36.1 
 
 		 411 aa  237  3e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  34.71 
 
 		 416 aa  233  7.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1159  nuclease SbcCD, D subunit  33.58 
 
 		 410 aa  229  7e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.067261  normal  0.815946 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1398  nuclease SbcCD, D subunit  41.97 
 
 		 517 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1064  exodeoxyribonuclease I subunit D  42.34 
 
 		 528 aa  212  1e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1100  nuclease SbcCD, D subunit  41.96 
 
 		 537 aa  210  3e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  32.29 
 
 		 409 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4885  nuclease SbcCD, D subunit  29.7 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.788581 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  31.7 
 
 		 409 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1822  nuclease SbcCD, D subunit  32.61 
 
 		 467 aa  168  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3717  nuclease SbcCD, D subunit  33.52 
 
 		 412 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2025  nuclease SbcCD, D subunit  33.24 
 
 		 412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3765  exonuclease SbcD  32.85 
 
 		 414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0831731  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1557  nuclease SbcCD, D subunit  33.52 
 
 		 412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436101  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1585  nuclease SbcCD, D subunit  33.24 
 
 		 412 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583238  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1715  exonuclease SbcD  33.14 
 
 		 414 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.38 
 
 		 418 aa  162  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  32.42 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3216  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.79 
 
 		 414 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  31.91 
 
 		 382 aa  154  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0468  nuclease SbcCD, D subunit  35.13 
 
 		 417 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  33.13 
 
 		 379 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  29.85 
 
 		 407 aa  152  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  32.52 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1419  nuclease SbcCD, D subunit  31.38 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.366401  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0434  exodeoxyribonuclease I subunit D  35.74 
 
 		 428 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0609998  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  29.12 
 
 		 392 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  32.76 
 
 		 386 aa  145  8.000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  28.4 
 
 		 409 aa  145  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  29.02 
 
 		 393 aa  145  9e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0463  nuclease SbcCD, D subunit  35.85 
 
 		 419 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165432  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  30.79 
 
 		 380 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  32.7 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  29.17 
 
 		 381 aa  141  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  32.19 
 
 		 382 aa  139  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  31.12 
 
 		 375 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0380  nuclease SbcCD, D subunit  33.02 
 
 		 415 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.061787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0348  nuclease SbcCD, D subunit  29.86 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0304  nuclease SbcCD, D subunit  32.39 
 
 		 415 aa  136  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.919689  normal  0.177579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  32 
 
 		 387 aa  137  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  30.03 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  27.43 
 
 		 381 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  28.02 
 
 		 381 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.77 
 
 		 386 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.5 
 
 		 400 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.38 
 
 		 418 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4361  nuclease SbcCD, D subunit  33.33 
 
 		 383 aa  132  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.820345  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  27.49 
 
 		 381 aa  132  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  27.18 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.68 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  27.18 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  30.33 
 
 		 381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0858  putative Exonuclease SbcD homolog  26.93 
 
 		 413 aa  130  3e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  30.41 
 
 		 390 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  31.44 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  28.23 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>