More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0828 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0828  homocysteine methyltransferase  100 
 
 
311 aa  631  1e-180  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3344  homocysteine S-methyltransferase  83.82 
 
 
310 aa  528  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1535  homocysteine methyltransferase  70.76 
 
 
315 aa  425  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  70.1 
 
 
313 aa  423  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3471  homocysteine methyltransferase  64.95 
 
 
312 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  65.12 
 
 
325 aa  387  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  57.84 
 
 
319 aa  337  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5466  homocysteine methyltransferase  52.43 
 
 
325 aa  324  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0696243  hitchhiker  0.00895387 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0866  homocysteine methyltransferase  55.3 
 
 
316 aa  322  7e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.142005  normal  0.135969 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1230  homocysteine S-methyltransferase  47.06 
 
 
311 aa  290  2e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.829907  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1042  homocysteine methyltransferase  45.45 
 
 
310 aa  264  1e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000341653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2740  homocysteine methyltransferase  48.63 
 
 
287 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1305  homocysteine methyltransferase  43.83 
 
 
314 aa  262  6e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.343801  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  47.96 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12483  homocysteine methyltransferase  45.79 
 
 
302 aa  247  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0891  homocysteine S-methyltransferase  50 
 
 
303 aa  246  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  44.83 
 
 
295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0628  homocysteine methyltransferase  42.39 
 
 
316 aa  232  5e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4577  homocysteine methyltransferase  43.92 
 
 
320 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3061  homocysteine S-methyltransferase  41.29 
 
 
314 aa  168  9e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30270  AdoMet-homocysteine methyltransferase  34.37 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39914  predicted protein  30.48 
 
 
418 aa  125  7e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0674804  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  30.36 
 
 
819 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1187  homocysteine S-methyltransferase  30.06 
 
 
629 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1598  homocysteine S-methyltransferase  31.17 
 
 
297 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  28.43 
 
 
800 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00664  homocysteine S-methyltransferase family protein  28.38 
 
 
305 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  27.24 
 
 
804 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  30.16 
 
 
804 aa  99.8  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0073  homocysteine S-methyltransferase  31.67 
 
 
290 aa  98.6  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0325  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  30.13 
 
 
605 aa  97.4  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2930  homocysteine S-methyltransferase  29.25 
 
 
303 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  31.49 
 
 
811 aa  97.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  31.53 
 
 
816 aa  97.8  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0283  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  34.01 
 
 
615 aa  95.9  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  30.07 
 
 
813 aa  95.5  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0238  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  32.12 
 
 
609 aa  95.5  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1497  homocysteine S-methyltransferase  31.23 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.191799  normal  0.658864 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  26.67 
 
 
807 aa  94.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2815  homocysteine S-methyltransferase  27.81 
 
 
304 aa  94.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  28.71 
 
 
806 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  28.87 
 
 
801 aa  93.6  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2974  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  31.31 
 
 
605 aa  93.2  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3865  homocysteine S-methyltransferase  31.37 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3243  homocysteine S-methyltransferase  33.74 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.562987  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1277  homocysteine S-methyltransferase  33.74 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0441893 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  28.62 
 
 
804 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03378  homocysteine S-methyltransferase (Eurofung)  26.36 
 
 
355 aa  91.3  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02520  homocysteine S-methyltransferase, putative  25 
 
 
381 aa  91.7  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3090  homocysteine S-methyltransferase  32.1 
 
 
300 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2160  homocysteine S-methyltransferase  28.18 
 
 
310 aa  90.1  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0392  homocysteine S-methyltransferase  28.94 
 
 
305 aa  89.7  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108543  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  29.69 
 
 
1169 aa  89.7  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0504  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  32.66 
 
 
605 aa  89.7  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120544  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3100  homocysteine S-methyltransferase  31.79 
 
 
300 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  25.93 
 
 
1227 aa  89  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0627  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  33.11 
 
 
610 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.07944e-34 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  27.33 
 
 
617 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0613  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  33 
 
 
610 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0658  homocysteine S-methyltransferase family protein  30.19 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  26.98 
 
 
1224 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  28.93 
 
 
841 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  26.23 
 
 
1228 aa  86.3  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2102  B12-dependent methionine synthase  26.67 
 
 
1249 aa  85.9  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.876734  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0692  homocysteine S-methyltransferase  29.55 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0245772 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  24.13 
 
 
841 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  28.75 
 
 
1236 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  27.91 
 
 
1266 aa  84  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2779  homocysteine S-methyltransferase  29.77 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  27.7 
 
 
801 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5017  S-methyltransferase  30.16 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05821  homocysteine S-methyltransferase  25.71 
 
 
301 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  24.44 
 
 
1225 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  26.94 
 
 
818 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2463  B12-dependent methionine synthase  26.9 
 
 
1240 aa  80.5  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  30.82 
 
 
1212 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  27.51 
 
 
1208 aa  80.5  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  27.24 
 
 
804 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  28.48 
 
 
768 aa  79.7  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  28.05 
 
 
804 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5121  homocysteine S-methyltransferase  30.94 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0135376  normal  0.478948 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3747  homocysteine S-methyltransferase  31.56 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4366  B12-dependent methionine synthase  26.88 
 
 
1247 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778137  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1508  homocysteine S-methyltransferase  26.43 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  26.17 
 
 
793 aa  79  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6392  homocysteine S-methyltransferase  29.74 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.612657 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1670  homocysteine S-methyltransferase family protein  25.6 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0708  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  29.1 
 
 
604 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.537957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0839  homocysteine S-methyltransferase  26 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  28.16 
 
 
768 aa  77.4  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4282  homocysteine S-methyltransferase  31.01 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2832  B12-dependent methionine synthase  26.88 
 
 
1271 aa  76.3  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.192266 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  28.01 
 
 
1176 aa  75.9  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  28.06 
 
 
1191 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1601  B12-dependent methionine synthase  27.19 
 
 
1250 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179961 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2123  B12-dependent methionine synthase  26.71 
 
 
1250 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.607854 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  26.95 
 
 
1208 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  25.31 
 
 
1239 aa  75.5  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2828  homocysteine S-methyltransferase  27.38 
 
 
355 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  23.73 
 
 
774 aa  75.5  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>