More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0776 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0776  exodeoxyribonuclease X  100 
 
 
223 aa  460  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000394057  hitchhiker  0.00105392 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1938  exodeoxyribonuclease X  53.57 
 
 
222 aa  234  9e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.652538  hitchhiker  0.0098923 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2092  exodeoxyribonuclease X  50 
 
 
232 aa  214  6e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1371  exodeoxyribonuclease X  50.23 
 
 
232 aa  214  1e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  3.25159e-11 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2032  exodeoxyribonuclease X  50.23 
 
 
232 aa  213  1e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497061  normal  0.786881 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2037  exodeoxyribonuclease X  50.23 
 
 
232 aa  214  1e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0918048 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1246  exodeoxyribonuclease X  49.77 
 
 
232 aa  212  4e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.940165  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2074  exodeoxyribonuclease X  48.87 
 
 
220 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1798  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  48.87 
 
 
220 aa  210  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1342  exodeoxyribonuclease X  48.87 
 
 
220 aa  210  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.214775 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2415  exodeoxyribonuclease X  50 
 
 
220 aa  209  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01815  exodeoxyribonuclease X  48.42 
 
 
220 aa  208  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01803  hypothetical protein  48.42 
 
 
220 aa  208  6e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1788  exodeoxyribonuclease X  47.98 
 
 
220 aa  207  9e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0941 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1935  exodeoxyribonuclease X  48.42 
 
 
220 aa  207  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2580  exodeoxyribonuclease X  48.42 
 
 
220 aa  207  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2120  exodeoxyribonuclease X  48.42 
 
 
220 aa  207  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1500  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.86 
 
 
240 aa  134  2e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  1.53009e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0498  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.01 
 
 
240 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.231087  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1099  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.5 
 
 
240 aa  118  8e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0819547  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6608  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.32 
 
 
262 aa  88.6  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0307436 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0559  exonuclease  31.33 
 
 
234 aa  86.3  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0326  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.35 
 
 
269 aa  85.1  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.242447 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1790  exonuclease  29.22 
 
 
247 aa  84.3  1e-15  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1383  exonuclease  37.97 
 
 
181 aa  81.3  1e-14  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  34.52 
 
 
1444 aa  80.5  2e-14  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  34.36 
 
 
1433 aa  80.1  2e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  34.36 
 
 
1433 aa  80.1  2e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  6.48048e-05 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2482  DNA-directed DNA polymerase  33.12 
 
 
168 aa  80.1  3e-14  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  34.36 
 
 
970 aa  79.7  3e-14  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  33.33 
 
 
1435 aa  79.7  3e-14  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  34.36 
 
 
1433 aa  79.3  4e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  34.36 
 
 
1433 aa  79.3  4e-14  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  34.36 
 
 
1433 aa  79.3  4e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  34.36 
 
 
1433 aa  79.3  4e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  34.36 
 
 
1433 aa  79.7  4e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  34.36 
 
 
1433 aa  79.3  4e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0925  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.63 
 
 
246 aa  78.6  7e-14  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0908  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.71 
 
 
292 aa  78.6  7e-14  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  33.89 
 
 
1367 aa  78.6  7e-14  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  33.74 
 
 
1433 aa  78.6  7e-14  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  33.89 
 
 
1367 aa  78.6  8e-14  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  32.35 
 
 
1449 aa  78.2  8e-14  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  32.35 
 
 
1449 aa  78.2  9e-14  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  32.5 
 
 
1442 aa  77.4  2e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  34.36 
 
 
1433 aa  75.9  5e-13  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 
944 aa  75.9  5e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0549  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.4 
 
 
342 aa  73.9  2e-12  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.860226  hitchhiker  0.000115657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 
956 aa  73.9  2e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 
180 aa  72.8  4e-12  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.562654 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  32.35 
 
 
1440 aa  72.4  5e-12  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  31.68 
 
 
1397 aa  72.4  5e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0504  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.95 
 
 
909 aa  71.6  9e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1442  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.55 
 
 
220 aa  71.2  1e-11  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0697655  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  29.61 
 
 
1426 aa  71.2  1e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1767  exodeoxyribonuclease X, putative  29.55 
 
 
220 aa  71.2  1e-11  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  29.26 
 
 
1436 aa  71.2  1e-11  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2346  DNA-directed DNA polymerase  34.34 
 
 
170 aa  71.2  1e-11  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  27.93 
 
 
1433 aa  70.1  2e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.36 
 
 
205 aa  70.1  2e-11  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02830  hypothetical protein  32.32 
 
 
204 aa  70.1  3e-11  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  29.82 
 
 
1438 aa  70.1  3e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  29.94 
 
 
1447 aa  70.1  3e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2007  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.96 
 
 
212 aa  69.7  3e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  29.82 
 
 
1438 aa  70.1  3e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1066  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  29.6 
 
 
237 aa  68.9  6e-11  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.327766  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4120  DNA-directed DNA polymerase  33.51 
 
 
203 aa  68.9  6e-11  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.242284  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  33.33 
 
 
578 aa  68.9  6e-11  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  29.89 
 
 
1402 aa  68.6  7e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6094  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 
212 aa  68.6  8e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0666129  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1983  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 
212 aa  68.6  8e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0699  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  26.79 
 
 
218 aa  67.8  1e-10  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2410  DNA-directed DNA polymerase  31.9 
 
 
208 aa  68.2  1e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0597525  hitchhiker  3.52729e-06 
 
 
-
 
NC_002620  TC0823  DNA polymerase III subunit epsilon  25.32 
 
 
250 aa  67  2e-10  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.167011  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000241  DNA polymerase III alpha subunit  31.1 
 
 
204 aa  67.4  2e-10  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  29.21 
 
 
1407 aa  67  2e-10  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  31.55 
 
 
1390 aa  67.4  2e-10  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.9 
 
 
921 aa  65.9  5e-10  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  28.18 
 
 
1468 aa  65.9  5e-10  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  30.86 
 
 
1464 aa  65.9  5e-10  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1907  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.88 
 
 
453 aa  65.5  6e-10  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1885  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.52 
 
 
204 aa  65.5  6e-10  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.491413  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.44 
 
 
934 aa  65.5  6e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  28.07 
 
 
1635 aa  65.1  8e-10  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.37 
 
 
565 aa  65.1  8e-10  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1880  DNA-directed DNA polymerase  30.14 
 
 
242 aa  64.3  1e-09  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115193  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.56 
 
 
934 aa  64.3  1e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  32.73 
 
 
578 aa  64.7  1e-09  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0503  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.93 
 
 
695 aa  63.9  2e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0629426  normal  0.16655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  29.35 
 
 
613 aa  63.9  2e-09  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  31.93 
 
 
570 aa  63.5  2e-09  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5114  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.49 
 
 
706 aa  63.9  2e-09  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.44 
 
 
934 aa  63.9  2e-09  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.44 
 
 
934 aa  63.5  2e-09  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.44 
 
 
934 aa  63.9  2e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.44 
 
 
934 aa  63.5  2e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.93 
 
 
463 aa  63.5  2e-09  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.44 
 
 
934 aa  63.5  2e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  6.49538e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.44 
 
 
934 aa  63.9  2e-09  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2613  DNA polymerase III subunit  31.1 
 
 
222 aa  63.5  2e-09  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>