More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0770 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  100 
 
 
387 aa  796    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  67.55 
 
 
384 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  65.78 
 
 
387 aa  536  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  65.19 
 
 
387 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  63.64 
 
 
386 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  63.56 
 
 
387 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  63.03 
 
 
387 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  61.24 
 
 
387 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  61.24 
 
 
387 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  66.12 
 
 
324 aa  422  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  43.04 
 
 
349 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  41.71 
 
 
369 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  41.58 
 
 
369 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  41.58 
 
 
369 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  41.58 
 
 
369 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  41.58 
 
 
369 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  40.45 
 
 
338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  39.68 
 
 
276 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  36.39 
 
 
341 aa  209  7e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  29.63 
 
 
343 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  38.61 
 
 
404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  29.8 
 
 
429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  29.51 
 
 
334 aa  110  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  40.74 
 
 
172 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  34.64 
 
 
367 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  33.33 
 
 
359 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  36.71 
 
 
421 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  28.51 
 
 
353 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  29.26 
 
 
251 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2312  hypothetical protein  28.41 
 
 
364 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  38.99 
 
 
159 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  36.71 
 
 
412 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  27.02 
 
 
354 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  27.02 
 
 
354 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  34.87 
 
 
275 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  33.17 
 
 
386 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  30.2 
 
 
351 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3904  phage integrase family site specific recombinase  65.62 
 
 
122 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.908319  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  30.2 
 
 
351 aa  93.2  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  27.88 
 
 
401 aa  91.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  32 
 
 
334 aa  91.3  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  29.26 
 
 
402 aa  91.3  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  30.83 
 
 
347 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  30.83 
 
 
347 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  37.27 
 
 
188 aa  88.6  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6962  integrase family protein  30.67 
 
 
327 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  24.9 
 
 
337 aa  86.7  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  29.87 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  29.44 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  31.3 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1723  prophage DLP12 integrase  63.33 
 
 
128 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.241784  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1546  prophage DLP12 integrase  63.33 
 
 
128 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  28.39 
 
 
379 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  31.08 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  29.15 
 
 
338 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  32.29 
 
 
354 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2998  hypothetical protein  33.13 
 
 
212 aa  82.4  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2297  integrative genetic element Ppu40, integrase  29.31 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  28.57 
 
 
397 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  28.76 
 
 
372 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1525  phage integrase family site specific recombinase  48.91 
 
 
132 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3903  phage integrase family site specific recombinase  50 
 
 
99 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.823274  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  27.43 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  29.11 
 
 
340 aa  79.7  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  28.15 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2932  integrase family protein  27.39 
 
 
318 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  27.38 
 
 
366 aa  79.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1111  phage integrase family protein  26.38 
 
 
329 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30334  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  30.77 
 
 
444 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  24.57 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  34.38 
 
 
417 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  26.75 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  28.09 
 
 
330 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  29.85 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3039  phage integrase  29.28 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  26.64 
 
 
368 aa  73.9  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  27.19 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  26.84 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  26.36 
 
 
336 aa  73.6  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  27.63 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  26.91 
 
 
365 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4162  integrase family protein  26.16 
 
 
396 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  32.26 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  27.95 
 
 
340 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  25.2 
 
 
348 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  23.7 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  28.19 
 
 
332 aa  72  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  28.21 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3473  integrase family protein  25.26 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115261 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  29.86 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  26.89 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  27 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  23.02 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  23.02 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0269  integrase family protein  24.6 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  28.77 
 
 
415 aa  69.7  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  24.8 
 
 
389 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0382  putative site-specific integrase/recombinase  29.78 
 
 
204 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1727  phage integrase  28.09 
 
 
267 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  28.37 
 
 
381 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>