More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0753 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  77.66 
 
 
503 aa  793  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
490 aa  1003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  59.92 
 
 
500 aa  588  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  50.82 
 
 
502 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2850  putative ABC transporter substrate-binding protein  49.9 
 
 
490 aa  482  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.938621  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  49.48 
 
 
502 aa  481  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  49.06 
 
 
498 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2847  4-phytase  47.4 
 
 
495 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640082  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5083  4-phytase  48.15 
 
 
495 aa  432  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.116329 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1506  extracellular solute-binding protein  44.86 
 
 
501 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0306373  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  40.76 
 
 
495 aa  364  2e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0145  extracellular solute-binding protein family 5  40.24 
 
 
552 aa  343  6e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  35.89 
 
 
517 aa  291  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.02 
 
 
510 aa  235  1e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  31.67 
 
 
519 aa  232  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4369  extracellular solute-binding protein family 5  31.13 
 
 
536 aa  230  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  32.38 
 
 
521 aa  223  9e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  31.65 
 
 
509 aa  217  3e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.63 
 
 
508 aa  216  8e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  29.41 
 
 
505 aa  214  3e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  30.83 
 
 
510 aa  213  6e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  32.13 
 
 
520 aa  212  9e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 
511 aa  211  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  29.83 
 
 
523 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 
510 aa  207  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  31.38 
 
 
508 aa  207  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 
515 aa  207  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  31.47 
 
 
513 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  28.81 
 
 
516 aa  202  9e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 
512 aa  202  1e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 
512 aa  202  1e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 
512 aa  202  1e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.46 
 
 
534 aa  201  2e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  30.83 
 
 
517 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  30.95 
 
 
509 aa  200  4e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0263  extracellular solute-binding protein family 5  30.68 
 
 
516 aa  200  4e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0801202  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  29.57 
 
 
502 aa  200  4e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  29.11 
 
 
512 aa  199  7e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2811  extracellular solute-binding protein family 5  30.94 
 
 
540 aa  199  1e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490323  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0232  extracellular solute-binding protein  30.72 
 
 
517 aa  198  2e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  30.85 
 
 
513 aa  197  4e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 
519 aa  196  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  28.89 
 
 
532 aa  196  7e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.84044e-11  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 
520 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  30.42 
 
 
517 aa  193  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  29.23 
 
 
527 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 
520 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 
520 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.21 
 
 
525 aa  192  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 
509 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  28.51 
 
 
535 aa  191  3e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  27.94 
 
 
520 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1599  extracellular solute-binding protein family 5  31.09 
 
 
535 aa  189  9e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  29.3 
 
 
512 aa  189  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  29.3 
 
 
512 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  29.3 
 
 
512 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  29.3 
 
 
512 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  29.1 
 
 
512 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 
520 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.35 
 
 
513 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  31.33 
 
 
508 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.2 
 
 
512 aa  187  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3427  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 
526 aa  187  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  29.98 
 
 
512 aa  186  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  29.46 
 
 
513 aa  186  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.65 
 
 
520 aa  185  1e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.99 
 
 
512 aa  186  1e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 
520 aa  186  1e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.95 
 
 
520 aa  185  1e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.99 
 
 
512 aa  186  1e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.99 
 
 
512 aa  186  1e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  29.94 
 
 
527 aa  185  2e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  29.23 
 
 
514 aa  184  2e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  29.15 
 
 
520 aa  185  2e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  28.84 
 
 
518 aa  185  2e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  30.61 
 
 
516 aa  185  2e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  30.19 
 
 
492 aa  184  4e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 
503 aa  183  5e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  28.78 
 
 
512 aa  183  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.78 
 
 
512 aa  183  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  28.78 
 
 
512 aa  183  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  28.78 
 
 
493 aa  183  8e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 
512 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  27.27 
 
 
521 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
521 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  27.27 
 
 
521 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  29.28 
 
 
503 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.27 
 
 
521 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  28.91 
 
 
517 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  27.8 
 
 
541 aa  181  3e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  6.66118e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 
520 aa  181  3e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  28.14 
 
 
517 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
512 aa  180  6e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 
520 aa  180  6e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  27.96 
 
 
516 aa  180  6e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  26.86 
 
 
521 aa  179  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 
509 aa  178  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 
517 aa  177  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 
520 aa  176  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  27.89 
 
 
531 aa  175  2e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>