More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0614 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00069  thiamin ABC transporter membrane protein  84.89 
 
 
536 aa  836    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3532  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  83.96 
 
 
536 aa  829    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0118  thiamine transporter membrane protein  82.84 
 
 
536 aa  829    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0583  thiamine transporter membrane protein  74.21 
 
 
537 aa  663    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2944  thiamine transporter membrane protein  73.22 
 
 
535 aa  745    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0113  thiamine transporter membrane protein  82.84 
 
 
536 aa  830    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.195449 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0071  thiamine transporter membrane protein  84.51 
 
 
536 aa  834    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.818645  normal  0.387113 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0111  thiamine transporter membrane protein  83.21 
 
 
536 aa  831    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3590  thiamine transporter membrane protein  84.51 
 
 
536 aa  833    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.838581  hitchhiker  0.00000463415 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3620  thiamine transporter membrane protein  73.6 
 
 
535 aa  731    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0118  thiamine transporter membrane protein  83.21 
 
 
536 aa  832    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0333218 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0072  thiamine transporter membrane protein  83.96 
 
 
536 aa  828    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0614  thiamine transporter membrane protein  100 
 
 
536 aa  1058    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.012901 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3809  thiamine transporter membrane protein  73.6 
 
 
535 aa  727    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0736  thiamine transporter membrane protein  73.27 
 
 
535 aa  706    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0069  thiamine transporter membrane protein  84.33 
 
 
536 aa  830    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0622  thiamine transporter membrane protein  73.87 
 
 
536 aa  684    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3415  thiamine transporter membrane protein  73.41 
 
 
535 aa  745    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3543  thiamine transporter membrane protein  73.6 
 
 
535 aa  748    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0114  thiamine transporter membrane protein  83.02 
 
 
536 aa  831    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.576888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0059  thiamine transporter membrane protein  84.14 
 
 
536 aa  827    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00068  hypothetical protein  84.89 
 
 
536 aa  836    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0071  thiamine transporter membrane protein  84.51 
 
 
536 aa  833    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  48.52 
 
 
516 aa  443  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0350  thiamine transporter membrane protein  47.06 
 
 
540 aa  437  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  48.81 
 
 
516 aa  437  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  48.59 
 
 
530 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0386  thiamine transporter membrane protein  44.26 
 
 
534 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1012  thiamine transporter membrane protein  43.15 
 
 
514 aa  397  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1758  thiamine transporter membrane protein  43.24 
 
 
543 aa  362  9e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000432752  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1141  thiamine transporter membrane protein  41.58 
 
 
541 aa  332  8e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3260  thiamine transporter membrane protein  41.09 
 
 
545 aa  322  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3471  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  40.12 
 
 
509 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3108  thiamine transporter membrane protein  41.08 
 
 
531 aa  302  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1199  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  42.51 
 
 
555 aa  286  5.999999999999999e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.60189  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4267  thiamine transporter membrane protein  39.19 
 
 
542 aa  255  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1392  thiamine transporter membrane protein  38.87 
 
 
504 aa  252  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2817  thiamine transporter membrane protein  39.62 
 
 
523 aa  251  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229213  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0329  thiamine transporter membrane protein  39.54 
 
 
521 aa  251  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.356206 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2799  thiamine transporter membrane protein  39.42 
 
 
504 aa  248  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0059  thiamine transporter membrane protein  40.24 
 
 
504 aa  246  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.75 
 
 
565 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.55 
 
 
564 aa  103  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.63 
 
 
606 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.24 
 
 
634 aa  97.4  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.68 
 
 
544 aa  96.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10733  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.76 
 
 
663 aa  95.1  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0144  thiamine ABC transporter, permease protein  22.66 
 
 
560 aa  92.8  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.997679  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.6 
 
 
550 aa  93.2  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.88 
 
 
510 aa  92.4  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  24.17 
 
 
547 aa  90.9  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.71 
 
 
572 aa  89  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000013975  decreased coverage  0.00476885 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.6 
 
 
515 aa  87.8  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.99 
 
 
532 aa  85.1  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.763133  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2199  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.39 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133413  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.54 
 
 
540 aa  82.4  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.666018  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.98 
 
 
597 aa  81.3  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3530  molybdenum ABC transporter, permease protein  28.32 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1449  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.75 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.847792 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0489  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  29.49 
 
 
315 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357372  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0857  ABC transporter, permease protein  29.49 
 
 
315 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.020364  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1902  PhnU  29.49 
 
 
315 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.92 
 
 
728 aa  79  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4009  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  28.7 
 
 
278 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2214  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  29.49 
 
 
315 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.201652  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0586  ABC-type sulfate transport system, permease component  29.49 
 
 
315 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000133683  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0898  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  29.49 
 
 
315 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00123492  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1760  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  29.49 
 
 
315 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10579  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2109  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.33 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.440331  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19470  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  25.85 
 
 
576 aa  77.8  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0624  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.57 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6756  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.25 
 
 
285 aa  76.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1924  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.34 
 
 
222 aa  76.6  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5844  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.25 
 
 
285 aa  76.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443331  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0966  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.95 
 
 
279 aa  75.5  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0121  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.05 
 
 
288 aa  75.5  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2052  ABC transporter, permease protein  29.33 
 
 
315 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.667193  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3401  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.81 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.140858  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.25 
 
 
569 aa  74.7  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0105  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  27.86 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0108  sulfate ABC transporter, permease protein  28.24 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368477  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1520  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  26.79 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5368  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.8 
 
 
574 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2337  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  26.79 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0669426  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0867  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.71 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2546  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  26.79 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.99 
 
 
601 aa  73.6  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0744847  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1518  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.14 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139492  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1498  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.14 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0376  ABC transporter, permease protein, putative  22.5 
 
 
539 aa  73.2  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0514897  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4543  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.2 
 
 
285 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199466  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.55 
 
 
565 aa  73.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5170  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.57 
 
 
272 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.451944  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  31.6 
 
 
232 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2479  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30 
 
 
306 aa  72  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1635  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.48 
 
 
299 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1848  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  30 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.704864  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1641  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.65 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0807  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  30 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0353  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  30 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.303881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>