More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0581 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0581  transcriptional activator NhaR  100 
 
 
300 aa  626  1e-178  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  1.22436e-06  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00019  DNA-binding transcriptional activator  90.94 
 
 
301 aa  574  1e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.537169  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0020  transcriptional activator NhaR  90.94 
 
 
299 aa  573  1e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0536334  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00020  hypothetical protein  90.94 
 
 
301 aa  574  1e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.592554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0020  transcriptional activator NhaR  90.94 
 
 
299 aa  573  1e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0017  transcriptional activator NhaR  90.94 
 
 
299 aa  573  1e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.11428e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3637  transcriptional activator NhaR  90.6 
 
 
301 aa  573  1e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3577  transcriptional regulator, LysR family  91.22 
 
 
299 aa  572  1e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.33722e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0018  transcriptional activator NhaR  90.88 
 
 
301 aa  571  1e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0018  transcriptional activator NhaR  90.67 
 
 
301 aa  573  1e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.278045  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0045  transcriptional activator NhaR  91.16 
 
 
299 aa  562  1e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.87006  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0043  transcriptional activator NhaR  91.16 
 
 
299 aa  562  1e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.73078  hitchhiker  0.00860797 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0044  transcriptional activator NhaR  91.16 
 
 
297 aa  561  1e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.491871  normal  0.174595 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0044  transcriptional activator NhaR  91.16 
 
 
297 aa  561  1e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0045  transcriptional activator NhaR  91.16 
 
 
299 aa  562  1e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0695  transcriptional activator NhaR  81.76 
 
 
297 aa  517  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  1.92027e-08  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0794  transcriptional activator NhaR  79.39 
 
 
299 aa  498  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  9.65689e-08  normal  0.230148 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3656  transcriptional activator NhaR  77.18 
 
 
317 aa  499  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.231756  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3463  transcriptional activator NhaR  79.39 
 
 
299 aa  498  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.46578e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3850  transcriptional activator NhaR  76.25 
 
 
301 aa  496  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3591  transcriptional activator NhaR  79.05 
 
 
299 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  3.48545e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0545  transcriptional activator NhaR  74.83 
 
 
296 aa  476  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0584  transcriptional activator NhaR  74.15 
 
 
295 aa  464  1e-130  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0575  transcriptional activator NhaR  63.61 
 
 
313 aa  405  1e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000414941  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0209  transcriptional activator NhaR  64.75 
 
 
296 aa  403  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.05029e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1044  transcriptional activator NhaR  59.32 
 
 
302 aa  368  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.205907  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00975  transcriptional activator NhaR  61.57 
 
 
283 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004424  transcriptional activator NhaR  61.57 
 
 
283 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00877643  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1233  transcriptional activator NhaR  58.5 
 
 
302 aa  363  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.498359  hitchhiker  0.000251035 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2939  transcriptional activator NhaR  58.98 
 
 
307 aa  362  4e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1138  transcriptional activator NhaR  58.5 
 
 
302 aa  362  6e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.823681  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1149  transcriptional activator NhaR  58.64 
 
 
302 aa  361  7e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.291866  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1268  transcriptional activator NhaR  58.98 
 
 
311 aa  361  8e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1191  transcriptional activator NhaR  58.98 
 
 
304 aa  360  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1235  transcriptional activator NhaR  58.98 
 
 
311 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3122  transcriptional activator NhaR  58.64 
 
 
302 aa  358  8e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.896078  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1338  transcriptional activator NhaR  57.97 
 
 
302 aa  354  9e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0870  transcriptional activator NhaR  58.64 
 
 
302 aa  354  9e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.1204 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3036  transcriptional activator NhaR  58.64 
 
 
302 aa  354  1e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.440521 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2858  transcriptional activator NhaR  58.31 
 
 
302 aa  352  3e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2940  transcriptional activator NhaR  58.31 
 
 
302 aa  352  3e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252143  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1027  transcriptional activator NhaR  55.78 
 
 
302 aa  348  8e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2776  transcriptional activator NhaR  55.52 
 
 
304 aa  342  4e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2422  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.54 
 
 
300 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.727626  normal  0.292199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3529  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 
297 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589302  normal  0.0874139 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3250  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
297 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159046  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2444  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 
297 aa  221  1e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2689  transcriptional regulator, LysR family  40.2 
 
 
300 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.876751  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3182  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
297 aa  214  1e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574811  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3707  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
299 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0005  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
299 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472408 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3458  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 
299 aa  207  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1110  LysR family transcriptional regulator  38 
 
 
302 aa  206  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2094  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
298 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347604  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4158  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
309 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3867  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
309 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0459798  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2991  transcriptional regulator, LysR family  35.93 
 
 
300 aa  200  2e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194845  normal  0.0299844 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1946  transcriptional regulator, LysR family  38 
 
 
302 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.652063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2017  LysR family transcriptional regulator  38 
 
 
302 aa  198  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1861  transcriptional regulator, LysR family  38 
 
 
302 aa  198  7e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2604  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
301 aa  198  9e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.704513 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3443  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
298 aa  197  1e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2804  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
313 aa  195  7e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  2.08854e-06 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2321  LysR family transcriptional regulator  36.88 
 
 
303 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  8.23941e-09  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3167  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
300 aa  192  6e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  8.77646e-05  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2067  transcriptional regulator, LysR family  36.79 
 
 
298 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.016585 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3633  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 
298 aa  188  7e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3405  transcriptional regulator, LysR family  36.93 
 
 
298 aa  188  9e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3265  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
296 aa  184  1e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000583732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1440  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
299 aa  183  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1792  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
301 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0292  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
302 aa  173  4e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3085  transcriptional regulator, LysR family  35.14 
 
 
296 aa  172  9e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3124  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 
298 aa  171  9e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.381105  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4198  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 
295 aa  170  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.408644  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4489  transcriptional regulator, LysR family  34.52 
 
 
292 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0808  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
293 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.461181 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0610  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 
305 aa  160  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1718  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
293 aa  152  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0772437 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00631  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.14 
 
 
296 aa  149  7e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0783692  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3348  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
293 aa  143  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5521  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
295 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.0878172 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1178  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
299 aa  142  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0949168  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2907  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
301 aa  141  2e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1134  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
301 aa  141  2e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0315  transcriptional activator protein NhaR  31.82 
 
 
301 aa  140  2e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0037078  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2751  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
301 aa  141  2e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4462  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
296 aa  139  5e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3860  LysR family transcriptional regulator  29.18 
 
 
308 aa  136  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3133  transcriptional regulator, LysR family  29.18 
 
 
308 aa  135  7e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1367  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
302 aa  135  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1379  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 
295 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1183  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 
303 aa  128  2e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1259  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
297 aa  126  4e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0187245  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0778  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
297 aa  126  4e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1231  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
297 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181186  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1138  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
297 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1150  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
297 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal  0.337548 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2059  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
297 aa  121  2e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.059408  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4402  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 
297 aa  119  4e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>