216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0573 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0573  ABC transporter, substrate binding protein  100 
 
 
374 aa  769    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3035  periplasmic binding protein  56.13 
 
 
372 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1240  periplasmic binding protein  55.86 
 
 
372 aa  438  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1100  ABC transporter, substrate binding protein  53.91 
 
 
374 aa  437  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0595516  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2755  ABC transporter, substrate binding protein  53.12 
 
 
375 aa  431  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000138231  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  53.14 
 
 
394 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  37.13 
 
 
383 aa  250  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  34.34 
 
 
389 aa  239  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  34.34 
 
 
389 aa  239  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  34.34 
 
 
381 aa  239  5.999999999999999e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  34.07 
 
 
377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  32.69 
 
 
371 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7105  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  37.24 
 
 
401 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320123  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2758  periplasmic binding protein  31.22 
 
 
373 aa  220  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  32.54 
 
 
406 aa  217  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  31.23 
 
 
375 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  31.42 
 
 
375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  29.95 
 
 
373 aa  212  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3089  periplasmic binding protein  34.02 
 
 
375 aa  206  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  33.33 
 
 
370 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2249  periplasmic binding protein  32.76 
 
 
378 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2027  periplasmic binding protein  32.19 
 
 
378 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683361  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  36.11 
 
 
377 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0816  periplasmic binding protein  31.29 
 
 
366 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0919646  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4077  periplasmic binding protein  29.92 
 
 
383 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0154  hypothetical protein  31.29 
 
 
366 aa  195  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000656293 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0816  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.29 
 
 
366 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1058  periplasmic binding protein  32.05 
 
 
370 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3900  periplasmic binding protein  30.43 
 
 
386 aa  193  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3000  periplasmic binding protein  32.56 
 
 
369 aa  193  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.796809  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2567  periplasmic binding protein  33.73 
 
 
365 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0204616  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  31.56 
 
 
371 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1127  periplasmic binding protein  32.62 
 
 
368 aa  184  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1220  ABC transporter substrate binding protein (iron)  29.53 
 
 
383 aa  182  9.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1693  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  30.23 
 
 
370 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3531  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  29.73 
 
 
382 aa  169  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826718  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3611  periplasmic binding protein  29.15 
 
 
380 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486041  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2194  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  29.62 
 
 
377 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.0100465 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4137  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  29.94 
 
 
365 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  28.49 
 
 
384 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0797  periplasmic binding protein  29.65 
 
 
367 aa  149  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0161104  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  28.99 
 
 
427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  29.06 
 
 
364 aa  129  9.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1701  periplasmic binding protein  27.02 
 
 
365 aa  124  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1774  periplasmic binding protein  26.46 
 
 
363 aa  123  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  28 
 
 
429 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2539  periplasmic binding protein  25.9 
 
 
368 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  24.59 
 
 
407 aa  117  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1708  periplasmic binding protein  23.26 
 
 
392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2718  periplasmic binding protein  26.17 
 
 
360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410203  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2720  periplasmic binding protein  24.93 
 
 
363 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000254593  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2635  iron chelate ABC transporter periplasmic iron/siderophore-binding protein  24.93 
 
 
363 aa  97.8  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.97529e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  25.44 
 
 
483 aa  96.3  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  24.19 
 
 
380 aa  92  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  29.37 
 
 
375 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  25.68 
 
 
375 aa  82  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  24.71 
 
 
429 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  24.56 
 
 
478 aa  79.7  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  26.72 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  26.22 
 
 
409 aa  75.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  24.65 
 
 
362 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  25.69 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  25.69 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  23.8 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  25 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  27.5 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  25.3 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  23.99 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  23.51 
 
 
380 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  24.68 
 
 
362 aa  68.9  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  23.93 
 
 
360 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  24.54 
 
 
517 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  26.14 
 
 
366 aa  67  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  24.22 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  24.5 
 
 
361 aa  65.9  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  24.62 
 
 
337 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  22.12 
 
 
307 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  25.75 
 
 
354 aa  63.5  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  24.1 
 
 
333 aa  63.5  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  23.99 
 
 
354 aa  63.5  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1830  periplasmic binding protein  26.23 
 
 
360 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  23.51 
 
 
356 aa  61.6  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  24.27 
 
 
374 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  23.97 
 
 
372 aa  62  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  23.08 
 
 
309 aa  60.1  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  24.92 
 
 
322 aa  59.7  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  23.87 
 
 
365 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  25.95 
 
 
390 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3494  periplasmic binding protein  23.16 
 
 
317 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  24.56 
 
 
321 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0403  periplasmic binding protein  26.12 
 
 
327 aa  57.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  25.19 
 
 
381 aa  57.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  23.08 
 
 
331 aa  57.8  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  25.69 
 
 
409 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  26.14 
 
 
334 aa  57.4  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  24.39 
 
 
349 aa  57  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  24.16 
 
 
406 aa  57  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  23.66 
 
 
358 aa  56.2  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2494  periplasmic binding protein  23.55 
 
 
406 aa  56.2  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  23.53 
 
 
358 aa  55.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>