245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0525 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0525  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 
152 aa  310  3e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00173992 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4963  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  83.44 
 
 
152 aa  261  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.289705  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4905  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain protein  83.44 
 
 
152 aa  261  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.286575  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4870  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain protein  83.44 
 
 
152 aa  261  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4802  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain protein  83.44 
 
 
152 aa  261  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.576416  normal  0.802544 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4957  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  83.44 
 
 
152 aa  261  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4026  hypothetical protein  70.2 
 
 
158 aa  231  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46740  hypothetical protein  68.87 
 
 
158 aa  229  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932046  decreased coverage  1.41029e-07 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6541  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  66.23 
 
 
152 aa  216  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.361078 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6129  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  66.23 
 
 
152 aa  216  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.684201  normal  0.245919 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0561  hypothetical protein  66.23 
 
 
152 aa  214  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.155042  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0219  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  69.33 
 
 
153 aa  213  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.303284 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3822  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  65.56 
 
 
159 aa  213  7e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.808721  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3616  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  64.9 
 
 
152 aa  211  3e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1653  putative ybaK-like protein  66.89 
 
 
155 aa  211  4e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0303  hypothetical protein  65.56 
 
 
152 aa  207  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0686  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  62.91 
 
 
188 aa  206  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2912  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  66.23 
 
 
155 aa  206  9e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14862  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1755  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  63.58 
 
 
156 aa  205  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3997  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  63.58 
 
 
156 aa  203  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.277402 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4680  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  62.25 
 
 
160 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1416  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  63.33 
 
 
162 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3961  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  59.6 
 
 
155 aa  191  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0580  ebsC protein, putative  58.94 
 
 
256 aa  191  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2443  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  58.94 
 
 
151 aa  190  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1464  putative ebsC protein  58.94 
 
 
151 aa  190  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2579  YbaK  58.94 
 
 
151 aa  190  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508763  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1661  putative ebsC protein  58.94 
 
 
151 aa  190  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0316  putative ebsC protein  58.94 
 
 
151 aa  190  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129099  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0284  putative ebsC protein  58.28 
 
 
160 aa  188  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.663414  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0881  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  58.28 
 
 
202 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.623093  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1123  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  63.58 
 
 
155 aa  188  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.435066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1396  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  65.33 
 
 
160 aa  177  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0527  hypothetical protein  58.94 
 
 
132 aa  174  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0664  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  49.34 
 
 
155 aa  144  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0491998  hitchhiker  0.00288999 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1212  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  47.68 
 
 
151 aa  142  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0760914  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0120  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.74 
 
 
156 aa  140  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0019  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  47.68 
 
 
153 aa  138  2e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4290  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.37 
 
 
152 aa  139  2e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.09077e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0203  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.05 
 
 
157 aa  127  4e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2044  YbaK/EbsC family protein  41.67 
 
 
156 aa  120  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2368  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  42.11 
 
 
153 aa  112  1e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  2.65357e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0441  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.67 
 
 
154 aa  112  2e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2174  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.05 
 
 
157 aa  97.1  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  3.43666e-11 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0968  hypothetical protein  33.11 
 
 
154 aa  95.5  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.107423  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0821  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.94 
 
 
151 aa  91.7  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.811085  hitchhiker  1.71458e-08 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1376  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.61 
 
 
154 aa  87.4  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1948  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.77 
 
 
164 aa  73.9  7e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2120  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.25 
 
 
156 aa  71.6  3e-12  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2267  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.33 
 
 
164 aa  70.1  1e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0466  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.56 
 
 
161 aa  67  8e-11  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4348  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.11 
 
 
167 aa  66.6  1e-10  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3486  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.14 
 
 
157 aa  65.9  2e-10  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3288  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.29 
 
 
171 aa  65.5  3e-10  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.545646  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3353  hypothetical protein  35.54 
 
 
165 aa  65.1  4e-10  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4709  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.8 
 
 
162 aa  63.2  1e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0706  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.34 
 
 
131 aa  63.2  1e-09  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4036  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.43 
 
 
157 aa  63.5  1e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0164  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.35 
 
 
177 aa  62.8  2e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.85 
 
 
250 aa  61.6  4e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5963  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.93 
 
 
167 aa  61.2  5e-09  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851834  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0119  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.54 
 
 
165 aa  60.8  5e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0263477  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1677  hypothetical protein  46.3 
 
 
56 aa  61.2  5e-09  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0515  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.82 
 
 
183 aa  60.1  1e-08  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0151737  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.86 
 
 
251 aa  59.3  2e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3243  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.15 
 
 
162 aa  59.3  2e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156466  normal  0.0643244 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6310  YbaK/prolyl-tRNA synthetase like protein  32.12 
 
 
178 aa  58.5  3e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0596  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.6 
 
 
159 aa  58.5  3e-08  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3080  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.83 
 
 
157 aa  58.5  3e-08  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304757  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2956  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.88 
 
 
186 aa  57.8  5e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  32.06 
 
 
248 aa  57.4  7e-08  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2871  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.12 
 
 
168 aa  57.4  8e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.806354 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3008  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.12 
 
 
168 aa  57.4  8e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3551  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.46 
 
 
201 aa  56.6  1e-07  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0146665  normal  0.0164615 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2981  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.66 
 
 
168 aa  55.8  2e-07  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0899  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.85 
 
 
159 aa  55.8  2e-07  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.322941  normal  0.0622589 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.29 
 
 
174 aa  55.8  2e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0120  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.88 
 
 
166 aa  56.2  2e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4271  hypothetical protein  30.88 
 
 
173 aa  55.8  2e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0312  ybaK/ebsC protein  31.62 
 
 
168 aa  55.8  2e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3021  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.61 
 
 
155 aa  55.1  3e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00107771  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0439  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.41 
 
 
173 aa  55.1  3e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2512  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.46 
 
 
156 aa  55.1  3e-07  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0327  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.58 
 
 
160 aa  55.5  3e-07  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5549  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.67 
 
 
159 aa  54.7  4e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.837846 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3755  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.86 
 
 
162 aa  54.7  4e-07  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.445295  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0113  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.15 
 
 
166 aa  55.1  4e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3036  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.86 
 
 
162 aa  55.1  4e-07  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.784305  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0260  hypothetical protein  28.95 
 
 
170 aa  54.3  6e-07  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393792  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2346  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.66 
 
 
168 aa  54.3  6e-07  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.654281  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2960  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.66 
 
 
168 aa  54.3  6e-07  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333843  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1120  hypothetical protein  38.04 
 
 
157 aa  53.9  7e-07  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1918  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.56 
 
 
158 aa  53.9  7e-07  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0942433  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2447  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  29.45 
 
 
166 aa  53.5  1e-06  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.106663  hitchhiker  0.000551583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3470  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.04 
 
 
162 aa  53.5  1e-06  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.116245  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03547  hypothetical protein  24.16 
 
 
157 aa  53.5  1e-06  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2791  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.29 
 
 
159 aa  53.5  1e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  31.5 
 
 
157 aa  53.5  1e-06  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0548  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.53 
 
 
163 aa  53.5  1e-06  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2007  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.37 
 
 
163 aa  53.1  1e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173109  normal  0.652045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>