200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0524 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0524  DNA-binding transcriptional activator BglJ  100 
 
 
211 aa  437  1e-122  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.441884  decreased coverage  0.00182445 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3631  transcriptional regulator, LuxR family  49.48 
 
 
225 aa  187  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00452114  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3689  DNA-binding transcriptional activator BglJ  49.48 
 
 
207 aa  187  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.256974  decreased coverage  6.89885e-06 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04243  DNA-binding transcriptional activator  49.48 
 
 
207 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0432345  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4960  DNA-binding transcriptional activator BglJ  49.48 
 
 
225 aa  187  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.3279e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4599  DNA-binding transcriptional activator BglJ  49.48 
 
 
225 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.41662e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04209  hypothetical protein  49.48 
 
 
207 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5879  DNA-binding transcriptional activator BglJ  49.48 
 
 
225 aa  187  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0356322  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4912  DNA-binding transcriptional activator BglJ  48.96 
 
 
225 aa  184  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  3.5455e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4956  DNA-binding transcriptional activator BglJ  48.96 
 
 
224 aa  172  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4904  DNA-binding transcriptional activator BglJ  48.96 
 
 
224 aa  172  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.53459  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4801  DNA-binding transcriptional activator BglJ  48.96 
 
 
224 aa  172  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.564373  normal  0.609809 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4869  DNA-binding transcriptional activator BglJ  48.96 
 
 
224 aa  172  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0232651  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4962  DNA-binding transcriptional activator BglJ  48.96 
 
 
224 aa  173  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.793457  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0595  transcriptional regulator FimZ  40.48 
 
 
210 aa  67.4  2e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0598  transcriptional regulator FimZ  40.48 
 
 
210 aa  67.4  2e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.110504 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0594  transcriptional regulator FimZ  39.68 
 
 
210 aa  65.1  7e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627077  hitchhiker  0.00790766 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0659  transcriptional regulator FimZ  39.68 
 
 
210 aa  65.1  7e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0602  transcriptional regulator FimZ  39.68 
 
 
210 aa  65.1  7e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  0.0923244 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0993  transcriptional regulator FimZ  36.51 
 
 
210 aa  61.2  9e-09  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287084 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2764  transcriptional regulator RcsB  48.33 
 
 
217 aa  60.1  2e-08  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408225  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1307  transcriptional regulator RcsB  48.33 
 
 
217 aa  60.1  2e-08  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0162714  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2843  transcriptional regulator RcsB  48.33 
 
 
217 aa  60.1  2e-08  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0161  LuxR family DNA-binding response regulator  56.36 
 
 
220 aa  58.9  5e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1630  DNA-binding response regulator  56.36 
 
 
220 aa  58.9  5e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0322132  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3267  transcriptional regulator RcsB  47.46 
 
 
216 aa  58.2  8e-08  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00059602  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2797  transcriptional regulator RcsB  47.46 
 
 
216 aa  58.2  8e-08  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  2.83918e-07  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 
216 aa  58.2  9e-08  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.59515e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2517  transcriptional regulator RcsB  47.46 
 
 
216 aa  58.2  9e-08  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  6.00529e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3357  transcriptional regulator RcsB  47.46 
 
 
216 aa  58.2  9e-08  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000561339  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2614  transcriptional regulator RcsB  47.46 
 
 
216 aa  58.2  9e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.588596 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1433  transcriptional regulator RcsB  47.46 
 
 
216 aa  58.2  9e-08  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0102563  hitchhiker  0.00285537 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0187  LuxR response regulator receiver  54.55 
 
 
220 aa  58.2  9e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2366  transcriptional regulator RcsB  47.46 
 
 
216 aa  58.2  9e-08  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.82288e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4699  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
246 aa  58.2  9e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372391  hitchhiker  0.00465492 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2406  transcriptional regulator RcsB  47.46 
 
 
216 aa  58.2  9e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  6.25449e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2510  transcriptional regulator RcsB  47.46 
 
 
216 aa  58.2  9e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.0675268 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2496  transcriptional regulator RcsB  47.46 
 
 
216 aa  58.2  9e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.424983  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2455  transcriptional regulator RcsB  47.46 
 
 
216 aa  58.2  9e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.0831575 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1107  transcriptional regulator RcsB  47.46 
 
 
216 aa  57.8  1e-07  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0142  DNA-binding response regulator  54.55 
 
 
220 aa  57.8  1e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0721  transcriptional regulator RcsB  47.46 
 
 
228 aa  58.2  1e-07  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000245188  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2357  transcriptional regulator RcsB  47.46 
 
 
228 aa  58.2  1e-07  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.98144e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1041  transcriptional regulator RcsB  36.63 
 
 
218 aa  57  2e-07  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.140172  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3017  transcriptional regulator RcsB  36.63 
 
 
216 aa  57  2e-07  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3209  transcriptional regulator RcsB  47.46 
 
 
216 aa  57  2e-07  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26570  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 
212 aa  56.6  3e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.604718  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1403  DNA-binding response regulator  49.06 
 
 
210 aa  55.1  8e-07  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.846273  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0685  capsular synthesis regulator component B  49.06 
 
 
210 aa  55.1  8e-07  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.394747  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0473  DNA-binding response regulator  49.06 
 
 
210 aa  55.1  8e-07  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1618  DNA-binding response regulator  49.06 
 
 
210 aa  55.1  8e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0879  DNA-binding response regulator  49.06 
 
 
210 aa  55.1  8e-07  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888299  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1640  capsular synthesis regulator component B  49.06 
 
 
210 aa  55.1  8e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841891  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1797  DNA-binding response regulator  49.06 
 
 
210 aa  55.1  8e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2255  putative transcriptional regulator  48.08 
 
 
212 aa  55.1  9e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0808718  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5845  LuxR response regulator receiver  36.79 
 
 
214 aa  54.7  1e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0735  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 
213 aa  54.3  1e-06  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2674  DNA-binding response regulator  49.02 
 
 
210 aa  53.5  2e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1021  putative response regulator  44.64 
 
 
214 aa  52.4  5e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0155  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.35 
 
 
212 aa  52  6e-06  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16350  putative two-component response regulator  37.61 
 
 
213 aa  52  6e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4224  two component LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 
231 aa  51.6  8e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.434129 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6659  two component LuxR family transcriptional regulator  46.97 
 
 
207 aa  51.6  9e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  3.89797e-05  hitchhiker  0.000384101 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00485  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.03 
 
 
210 aa  51.2  1e-05  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00490  hypothetical protein  32.03 
 
 
210 aa  51.2  1e-05  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0610  transcriptional regulator FimZ  32.03 
 
 
210 aa  51.2  1e-05  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0580  transcriptional regulator FimZ  32.03 
 
 
210 aa  51.2  1e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3087  transcriptional regulator FimZ  32.03 
 
 
210 aa  51.2  1e-05  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0636  transcriptional regulator FimZ  32.03 
 
 
210 aa  51.2  1e-05  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.931873  normal  0.250092 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0577  transcriptional regulator FimZ  32.03 
 
 
210 aa  51.2  1e-05  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3078  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.03 
 
 
210 aa  51.2  1e-05  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11120  putative response regulator  42.86 
 
 
214 aa  51.2  1e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
231 aa  50.1  2e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3417  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 
232 aa  50.4  2e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.901274  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0280  two component LuxR family transcriptional regulator  53.06 
 
 
229 aa  50.8  2e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188137 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3071  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 
232 aa  50.4  2e-05  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0354  two component LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 
217 aa  49.7  3e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1157  two component LuxR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
215 aa  50.1  3e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505737  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3752  two component LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
215 aa  49.7  3e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2879  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
199 aa  49.7  3e-05  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  50.98 
 
 
215 aa  49.3  4e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00851836  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4235  two component LuxR family transcriptional regulator  50.98 
 
 
215 aa  49.3  4e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4225  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 
241 aa  48.9  5e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107538  normal  0.322545 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1484  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.96 
 
 
208 aa  48.9  6e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1421  putative two-component response regulator  50.98 
 
 
213 aa  48.5  8e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4702  two component LuxR family transcriptional regulator  27.95 
 
 
213 aa  48.1  8e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.121015 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3677  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.02 
 
 
229 aa  48.1  8e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0102182  hitchhiker  6.74126e-11 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1294  LuxR response regulator receiver  47.06 
 
 
220 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2872  two component LuxR family transcriptional regulator  51.02 
 
 
235 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891055  hitchhiker  2.01971e-10 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0289  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3081  two component LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 
217 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450994  normal  0.856151 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1621  capsular synthesis response regulator transcription regulator protein  38.55 
 
 
219 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.848219 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2078  LuxR family DNA-binding response regulator  26.72 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4679  LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
203 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  3.2992e-05  normal  0.146168 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2153  two component LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.848776  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2225  DNA-binding response regulator  26.72 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4444  capsular synthesis regulator component B, putative  45.83 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2022  DNA-binding response regulator  26.72 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1034  DNA-binding response regulator  26.72 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.315998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>