125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0457 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  88.58 
 
 		 536 aa  1001    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 539 aa  1123    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  50 
 
 		 532 aa  502  1e-141  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.25 
 
 		 547 aa  486  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  46.58 
 
 		 539 aa  478  1e-134  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.97 
 
 		 546 aa  467  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.85 
 
 		 559 aa  458  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.27 
 
 		 541 aa  460  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  46.25 
 
 		 541 aa  460  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.26 
 
 		 537 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  44.89 
 
 		 537 aa  445  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  44.55 
 
 		 523 aa  438  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  43.12 
 
 		 550 aa  427  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  42.72 
 
 		 514 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  40.8 
 
 		 540 aa  392  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  36.57 
 
 		 558 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  36.86 
 
 		 516 aa  283  7.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  32.39 
 
 		 553 aa  276  6e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  33.52 
 
 		 512 aa  273  7e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  32.98 
 
 		 552 aa  270  5e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  34.07 
 
 		 519 aa  269  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.04 
 
 		 538 aa  244  3.9999999999999997e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  34.26 
 
 		 563 aa  243  6e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  34.62 
 
 		 517 aa  238  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  30.26 
 
 		 577 aa  226  6e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  32.04 
 
 		 497 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  31.48 
 
 		 566 aa  225  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  32.54 
 
 		 512 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.98 
 
 		 558 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  31.64 
 
 		 581 aa  220  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  32.34 
 
 		 496 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  30.94 
 
 		 556 aa  209  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  30.92 
 
 		 546 aa  203  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  33.67 
 
 		 484 aa  203  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  29.42 
 
 		 636 aa  203  8e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.49 
 
 		 515 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  35.76 
 
 		 492 aa  194  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  38.89 
 
 		 488 aa  191  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  36.53 
 
 		 542 aa  189  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  31.67 
 
 		 526 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  33.33 
 
 		 497 aa  189  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  35.96 
 
 		 586 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  25.89 
 
 		 571 aa  175  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  36.04 
 
 		 451 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  32.06 
 
 		 498 aa  154  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  28.39 
 
 		 546 aa  153  7e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  26.82 
 
 		 1195 aa  146  9e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  29.71 
 
 		 591 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  27.12 
 
 		 521 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.38 
 
 		 562 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  24.55 
 
 		 560 aa  141  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  27.46 
 
 		 665 aa  140  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  23.37 
 
 		 532 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  26.12 
 
 		 572 aa  133  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  25.94 
 
 		 535 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  25.18 
 
 		 746 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.57 
 
 		 540 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  23.59 
 
 		 551 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  24.66 
 
 		 547 aa  124  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  26.68 
 
 		 537 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  25.59 
 
 		 504 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  23.84 
 
 		 522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  23.85 
 
 		 536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  25.4 
 
 		 511 aa  120  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  26.74 
 
 		 522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  27.65 
 
 		 534 aa  118  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  25.21 
 
 		 1338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  26.04 
 
 		 537 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  25.55 
 
 		 650 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  26 
 
 		 530 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  25.99 
 
 		 518 aa  113  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  23.33 
 
 		 543 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  25.61 
 
 		 545 aa  111  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  29.56 
 
 		 527 aa  109  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1879  beta-xylosidase  26.89 
 
 		 590 aa  108  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  24.63 
 
 		 691 aa  106  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  25.74 
 
 		 525 aa  104  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  25.28 
 
 		 522 aa  104  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  26.67 
 
 		 1585 aa  103  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  25.24 
 
 		 797 aa  99  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  22.76 
 
 		 1474 aa  97.8  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  24.36 
 
 		 518 aa  95.9  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  25.24 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  24.02 
 
 		 522 aa  83.6  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  23.88 
 
 		 524 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  26.37 
 
 		 495 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  23.52 
 
 		 532 aa  77.4  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  22.64 
 
 		 500 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  23.57 
 
 		 503 aa  69.3  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  24.18 
 
 		 508 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  23.27 
 
 		 501 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  24.42 
 
 		 901 aa  66.6  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  26.29 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01043  conserved hypothetical protein  33.62 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  23.12 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  23.01 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  23.76 
 
 		 323 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  26.06 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.74 
 
 		 341 aa  57  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  25.94 
 
 		 537 aa  57  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>