More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0320 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
281 aa  586  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  90.39 
 
 
281 aa  541  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  58.39 
 
 
278 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  57.25 
 
 
279 aa  333  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3068  AraC family transcriptional regulator  58.39 
 
 
276 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.210951  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2430  AraC family transcriptional regulator  56.36 
 
 
276 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3265  AraC family transcriptional regulator  56.36 
 
 
276 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60832  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  53.99 
 
 
278 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  53.99 
 
 
278 aa  316  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2075  AraC family transcriptional regulator  56.36 
 
 
278 aa  315  5e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  49.08 
 
 
285 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  49.08 
 
 
285 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  48.72 
 
 
285 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  46.95 
 
 
300 aa  258  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4939  AraC family transcriptional regulator  47.83 
 
 
286 aa  241  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4421  AraC family transcriptional regulator  47.83 
 
 
286 aa  240  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707997  hitchhiker  0.00308382 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3402  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  41.07 
 
 
281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0066  AraC family transcriptional regulator  38.65 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 
288 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2811  transcriptional regulator, AraC family  37.88 
 
 
303 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1137  transcriptional regulator, AraC family  33.09 
 
 
270 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  32.56 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6117  transcriptional regulator, AraC family  33.79 
 
 
297 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939175  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1262  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  29.5 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4315  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.627035  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2749  putative transcriptional regulator  31.37 
 
 
271 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  28.02 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2540  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 
275 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 
275 aa  133  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2072  AraC family transcriptional regulator  33.08 
 
 
274 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.78712  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  32.68 
 
 
284 aa  132  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  33.97 
 
 
277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 
281 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 
281 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3671  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 
274 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 
284 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2287  transcriptional regulator, AraC family  31.77 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  32.95 
 
 
284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32450  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288191  normal  0.469508 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2024  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  29.62 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0886  AraC family transcriptional regulator  32.81 
 
 
316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2585  AraC family transcription regulator  33.07 
 
 
284 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429451  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0279  AraC family transcriptional regulator  33.07 
 
 
282 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.431722  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0312  AraC family transcriptional regulator  33.07 
 
 
284 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00105398  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2449  AraC family transcriptional regulator  33.07 
 
 
284 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1460  AraC family transcriptional regulator  33.07 
 
 
282 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1657  AraC family transcriptional regulator  33.07 
 
 
284 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441347  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  29.46 
 
 
275 aa  125  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  32.23 
 
 
270 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  31.54 
 
 
279 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  33.59 
 
 
277 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6121  AraC family transcriptional regulator  32.81 
 
 
289 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6409  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586073  normal  0.525784 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  31.8 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  30.59 
 
 
283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0576  AraC family transcriptional regulator  33.07 
 
 
284 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0806  transcriptional regulator, AraC family  33.58 
 
 
355 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.311156 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
278 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6120  transcriptional regulator, AraC family  31.09 
 
 
284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0621  AraC family transcriptional regulator  34.32 
 
 
278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.378205  hitchhiker  0.00472777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 
278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  28.96 
 
 
278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  30.65 
 
 
264 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 
300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2631  transcriptional regulator, AraC family  32.44 
 
 
282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54416  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5531  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  30.37 
 
 
275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 
276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  26.6 
 
 
300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.07 
 
 
277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2317  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
284 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 
278 aa  112  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0382  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 
274 aa  112  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 
266 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7070  transcriptional regulator AraC family  26.71 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  26.46 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  28.73 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 
278 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4098  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 
280 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424275 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1393  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 
277 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 
278 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6122  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 
280 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0193396  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  27.41 
 
 
278 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 
269 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.08 
 
 
278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1463  AraC family transcriptional regulator  29.48 
 
 
279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 
279 aa  109  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  26.07 
 
 
271 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  28.41 
 
 
279 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1549  transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 
311 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00923391  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 
264 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  26.44 
 
 
276 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0733  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 
275 aa  107  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.629568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>