More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0101 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0101  DNA repair protein RadC  100 
 
 
221 aa  456  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  7.16823e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4055  DNA repair protein RadC  77.38 
 
 
221 aa  355  3e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3928  DNA repair protein RadC  77.38 
 
 
221 aa  355  3e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0713663  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3946  DNA repair protein RadC  77.38 
 
 
221 aa  355  3e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0929037  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4116  DNA repair protein RadC  77.38 
 
 
221 aa  355  3e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00598559  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4009  DNA repair protein RadC  77.38 
 
 
221 aa  354  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.273398  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4139  DNA repair protein RadC  74.88 
 
 
222 aa  349  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.7896e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5008  DNA repair protein RadC  74.88 
 
 
222 aa  349  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  9.00324e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3973  DNA repair protein RadC  74.88 
 
 
222 aa  349  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  1.5619e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3847  DNA repair protein RadC  74.88 
 
 
222 aa  348  4e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.55148e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03447  hypothetical protein  74.42 
 
 
222 aa  347  7e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00415391  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03495  DNA repair protein RadC  74.42 
 
 
222 aa  347  7e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0032943  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0067  DNA repair protein RadC  74.42 
 
 
222 aa  347  9e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.16711e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0073  DNA repair protein RadC  74.77 
 
 
214 aa  347  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000433644  hitchhiker  1.88277e-07 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4063  DNA repair protein RadC  74.42 
 
 
222 aa  345  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  7.37579e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0159  DNA repair protein RadC  60.09 
 
 
221 aa  278  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130887  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  60.56 
 
 
221 aa  278  4e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4100  DNA repair protein RadC  58.82 
 
 
221 aa  270  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0607652  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4390  DNA repair protein RadC  59.73 
 
 
221 aa  269  3e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00436549  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0061  DNA repair protein RadC  58.69 
 
 
222 aa  265  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  8.03057e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0055  DNA repair protein RadC  58.69 
 
 
222 aa  265  5e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00110117  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4155  DNA repair protein RadC  58.69 
 
 
222 aa  265  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  3.85869e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4842  DNA repair protein RadC  56.94 
 
 
227 aa  257  8e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000109613  hitchhiker  4.09278e-05 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  54.93 
 
 
224 aa  239  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0144  DNA repair protein RadC  49.54 
 
 
222 aa  234  8e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00783617  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  53.74 
 
 
224 aa  232  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  53.74 
 
 
224 aa  232  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.98963e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2597  DNA repair protein RadC  51.87 
 
 
224 aa  218  5e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.67988e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  49.77 
 
 
224 aa  217  9e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  50.23 
 
 
223 aa  215  3e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  51.17 
 
 
223 aa  215  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4376  DNA repair protein RadC  49.3 
 
 
224 aa  214  1e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  49.77 
 
 
224 aa  213  2e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  48.36 
 
 
224 aa  212  4e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2972  DNA repair protein RadC  49.3 
 
 
224 aa  210  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  50.23 
 
 
224 aa  209  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  1.27675e-05 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  46.95 
 
 
224 aa  209  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  5.07049e-11 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0046  DNA repair protein RadC  49.3 
 
 
224 aa  208  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178856  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  47.89 
 
 
224 aa  207  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6095  DNA repair protein RadC  47.89 
 
 
224 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.872274  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  46.95 
 
 
224 aa  206  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3481  DNA repair protein RadC  46.95 
 
 
233 aa  205  5e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421033  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  49.77 
 
 
224 aa  205  5e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0327  DNA repair protein RadC  47.89 
 
 
225 aa  204  8e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000320995  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70230  DNA repair protein RadC  46.95 
 
 
224 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  46.48 
 
 
224 aa  203  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3837  DNA repair protein RadC  46.48 
 
 
225 aa  202  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00013144  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  45.54 
 
 
224 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0528  DNA repair protein RadC  48.82 
 
 
224 aa  201  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  unclonable  3.01239e-11 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0358  DNA repair protein RadC  48.82 
 
 
224 aa  201  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0732931  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0326  DNA repair protein RadC  44.13 
 
 
225 aa  200  1e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2301  DNA repair protein RadC  47.87 
 
 
224 aa  200  1e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0056  DNA repair protein RadC  45.54 
 
 
225 aa  197  8e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183755  normal  0.0623388 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2291  DNA repair protein RadC  47.87 
 
 
242 aa  197  1e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0121519 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  47.39 
 
 
224 aa  196  2e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3828  DNA repair protein RadC  44.6 
 
 
225 aa  196  2e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.760529  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  45.07 
 
 
224 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  47.39 
 
 
224 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0385  DNA repair protein RadC  45.54 
 
 
225 aa  194  8e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00103198  hitchhiker  1.53707e-07 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4561  DNA repair protein RadC  42.25 
 
 
225 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000169917  hitchhiker  6.17306e-06 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1254  DNA repair protein RadC  45.79 
 
 
225 aa  190  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  46.92 
 
 
224 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2553  DNA repair protein RadC  43.19 
 
 
227 aa  188  7e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  46.92 
 
 
224 aa  187  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1917  DNA repair protein RadC  44.81 
 
 
237 aa  187  9e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2409  DNA repair protein RadC  43.4 
 
 
227 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3339  DNA repair protein RadC  43.66 
 
 
224 aa  186  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0155907  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00049  DNA repair protein RadC  42.25 
 
 
225 aa  186  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00103184  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4248  DNA repair protein RadC  46.95 
 
 
225 aa  184  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3597  DNA repair protein RadC  46.95 
 
 
225 aa  184  7e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0215962  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0402  DNA repair protein RadC  46.48 
 
 
225 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.30829e-07  hitchhiker  1.66485e-10 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0388  DNA repair protein RadC  46.48 
 
 
225 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  1.31294e-06  hitchhiker  7.32355e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0377  DNA repair protein RadC  46.48 
 
 
225 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000108999  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0462  DNA repair protein RadC  46.01 
 
 
225 aa  184  1e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  1.08191e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0948  DNA repair protein RadC  43.66 
 
 
244 aa  184  1e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0376  DNA repair protein RadC  46.48 
 
 
225 aa  184  1e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000147811  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0794  DNA repair protein RadC  42.06 
 
 
256 aa  182  4e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.132133 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0359  DNA repair protein RadC  46.48 
 
 
225 aa  182  4e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3770  DNA repair protein RadC  46.48 
 
 
225 aa  182  4e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625851  normal  0.642753 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3142  DNA repair protein RadC  47.42 
 
 
226 aa  182  5e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00442306  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0186  DNA repair protein RadC  43.19 
 
 
226 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.953222  hitchhiker  6.62884e-07 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02919  DNA repair protein RadC  42.25 
 
 
225 aa  180  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1654  DNA repair protein RadC  42.48 
 
 
237 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794365  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  42.18 
 
 
228 aa  180  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  43.58 
 
 
234 aa  179  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0585  DNA repair protein RadC  41.59 
 
 
242 aa  179  3e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  44.86 
 
 
229 aa  179  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0125  DNA repair protein RadC  42.25 
 
 
242 aa  179  4e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.695011  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0110  DNA repair protein RadC  42.25 
 
 
242 aa  179  4e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5194  DNA repair protein RadC  43.19 
 
 
235 aa  178  5e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0102732  normal  0.30357 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2695  DNA repair protein RadC  50.46 
 
 
222 aa  178  6e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5833  DNA repair protein RadC  41.78 
 
 
257 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1890  DNA repair protein RadC  41.31 
 
 
257 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2526  DNA repair protein RadC  41.31 
 
 
257 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2501  DNA repair protein RadC  41.31 
 
 
257 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1020  DNA repair protein RadC  45.12 
 
 
278 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.569834  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2646  DNA repair protein RadC  45.12 
 
 
278 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0979  DNA repair protein RadC  45.12 
 
 
278 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5284  DNA repair protein RadC  43.19 
 
 
226 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5335  DNA repair protein RadC  43.66 
 
 
226 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>