119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0021 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02276  D-serine dehydratase  81.45 
 
 
442 aa  721    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1291  D-serine ammonia-lyase  81.22 
 
 
442 aa  719    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02237  hypothetical protein  81.45 
 
 
442 aa  721    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0021  D-serine dehydratase  100 
 
 
434 aa  892    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2503  D-serine dehydratase  81.45 
 
 
442 aa  721    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.270405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2652  D-serine dehydratase  81.45 
 
 
442 aa  721    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3449  D-serine dehydratase  74.6 
 
 
441 aa  649    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1303  D-serine dehydratase  81.22 
 
 
442 aa  719    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.29121  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2516  D-serine dehydratase  81.92 
 
 
438 aa  719    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232923  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2735  D-serine dehydratase  80.72 
 
 
422 aa  664    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4082  D-serine dehydratase  81.69 
 
 
440 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4132  D-serine dehydratase  81.69 
 
 
440 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.293568  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4011  D-serine dehydratase  81.69 
 
 
440 aa  710    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4027  D-serine dehydratase  81.69 
 
 
440 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4190  D-serine dehydratase  81.69 
 
 
440 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3597  D-serine dehydratase  81.45 
 
 
442 aa  721    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277726 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4659  D-serine dehydratase  71.14 
 
 
443 aa  629  1e-179  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347338  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003747  D-serine dehydratase  72.27 
 
 
443 aa  618  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0243202  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02609  D-serine dehydratase  70.91 
 
 
443 aa  619  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0362  D-serine dehydratase  71 
 
 
441 aa  614  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2515  D-serine dehydratase  72.85 
 
 
445 aa  609  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.790637 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1718  D-serine dehydratase  68.84 
 
 
432 aa  572  1.0000000000000001e-162  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3112  D-serine dehydratase  63.64 
 
 
445 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1855  D-serine dehydratase  62.53 
 
 
443 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.478558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3545  D-serine dehydratase  62.53 
 
 
443 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3070  D-serine dehydratase  63.4 
 
 
449 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14369  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1650  D-serine dehydratase  63.07 
 
 
445 aa  534  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351732  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1653  D-serine dehydratase  60.78 
 
 
446 aa  528  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1600  D-serine dehydratase  61.24 
 
 
446 aa  529  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.99334  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1784  D-serine dehydratase  60.78 
 
 
446 aa  528  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.936434  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3266  D-serine dehydratase  67.74 
 
 
446 aa  530  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1796  D-serine dehydratase  61.84 
 
 
443 aa  529  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.395569  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1631  D-serine dehydratase  61.01 
 
 
446 aa  527  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.325851  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20650  D-serine dehydratase  62.16 
 
 
448 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00676968  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3934  D-serine ammonia-lyase  61.47 
 
 
451 aa  526  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1773  D-serine dehydratase  62.39 
 
 
448 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1833  D-serine dehydratase  60.78 
 
 
464 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1907  D-serine dehydratase  61.01 
 
 
443 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000531501  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4129  D-serine ammonia-lyase  61.86 
 
 
456 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1151  D-serine ammonia-lyase  63.26 
 
 
461 aa  513  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3826  D-serine dehydratase  58.51 
 
 
445 aa  513  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.419593 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2017  D-serine dehydratase  60.18 
 
 
464 aa  514  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2895  D-serine dehydratase  58.88 
 
 
449 aa  490  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2763  D-serine dehydratase  55.63 
 
 
459 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0789  D-serine ammonia-lyase  52.47 
 
 
438 aa  441  9.999999999999999e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000399356  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4614  D-serine dehydratase  50.24 
 
 
455 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1621  D-serine dehydratase  44.57 
 
 
440 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.48816  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2915  D-serine dehydratase  46.92 
 
 
443 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.464648  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2092  D-serine dehydratase  45.67 
 
 
442 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.962214  normal  0.0544874 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1364  D-serine dehydratase  46.72 
 
 
446 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0657  D-serine dehydratase  45.61 
 
 
473 aa  360  2e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0245  D-serine dehydratase  44.37 
 
 
444 aa  334  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2250  D-serine dehydratase  46.23 
 
 
451 aa  332  9e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.81638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2428  D-serine dehydratase  50 
 
 
379 aa  331  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1624  D-serine dehydratase  45.99 
 
 
451 aa  331  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0232  D-serine dehydratase  48.29 
 
 
429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.910645  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2856  D-serine dehydratase  44.16 
 
 
445 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298475  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2980  D-serine dehydratase  44.16 
 
 
445 aa  295  7e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1220  D-serine dehydratase  43.93 
 
 
445 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1577  D-serine dehydratase  49.28 
 
 
282 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1763  D-serine dehydratase  49.28 
 
 
283 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.634059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0329  D-serine dehydratase  48.24 
 
 
110 aa  73.6  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4533  diaminopropionate ammonia-lyase  27.52 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4911  diaminopropionate ammonia-lyase  26.69 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  23.74 
 
 
403 aa  63.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  25.98 
 
 
290 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3965  diaminopropionate ammonia-lyase  23.08 
 
 
415 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2576  diaminopropionate ammonia-lyase  26.11 
 
 
401 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264217  normal  0.398915 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1499  diaminopropionate ammonia-lyase  24.73 
 
 
410 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  24.6 
 
 
291 aa  59.3  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  24.47 
 
 
403 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  24.47 
 
 
403 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0358  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  26.82 
 
 
318 aa  57.4  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.1667  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  23.05 
 
 
403 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0630  diaminopropionate ammonia-lyase  23.53 
 
 
403 aa  56.6  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1422  diaminopropionate ammonia-lyase  24.42 
 
 
393 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000227055 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4067  diaminopropionate ammonia-lyase  25.27 
 
 
407 aa  51.6  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  20.15 
 
 
753 aa  50.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0159  diaminopropionate ammonia-lyase  23.81 
 
 
410 aa  50.1  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04926  diaminopropionate ammonia-lyase  22.57 
 
 
393 aa  50.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1576  D-serine ammonia-lyase  38.4 
 
 
155 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1762  D-serine dehydratase  38.4 
 
 
155 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5456  diaminopropionate ammonia-lyase  24.46 
 
 
414 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.372384 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  23.87 
 
 
304 aa  48.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2493  tryptophan synthase subunit beta  24.42 
 
 
451 aa  47.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0413  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  23.14 
 
 
326 aa  47.4  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.531296  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  23.14 
 
 
304 aa  47  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1091  cysteine synthase  22.75 
 
 
303 aa  47.4  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000826995  decreased coverage  0.00308217 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2553  cysteine synthase A  24.58 
 
 
366 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0093457  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1677  cysteine synthase  25.16 
 
 
317 aa  47  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  22.62 
 
 
520 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  24.35 
 
 
402 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08057  Cysteine synthase (CSase)(EC 2.5.1.47)(O-acetylserine sulfhydrylase)(O-acetylserine (thiol)-lyase)(OAS-TL) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P50867]  23.81 
 
 
370 aa  46.6  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2099  hypothetical protein  24.9 
 
 
328 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0730  hypothetical protein  24.31 
 
 
321 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0901199  normal  0.986029 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4908  diaminopropionate ammonia-lyase  21.95 
 
 
414 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509638  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  24.35 
 
 
408 aa  45.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3338  threonine dehydratase, biosynthetic  23.1 
 
 
511 aa  45.8  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  25.31 
 
 
333 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.982421  normal  0.0175954 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3711  tryptophan synthase subunit beta  24.43 
 
 
454 aa  45.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>