More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1542 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1542  parB-like partition protein  100 
 
 
294 aa  595  1e-169  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000160995  unclonable  1.80022e-19 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  42.61 
 
 
294 aa  205  6e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  39.32 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  40.83 
 
 
282 aa  195  9e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  41.72 
 
 
314 aa  193  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  40.45 
 
 
323 aa  193  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  38.74 
 
 
309 aa  193  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  37.37 
 
 
306 aa  191  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  40.96 
 
 
303 aa  191  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  39.58 
 
 
290 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  39.58 
 
 
290 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  39.59 
 
 
290 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  38.91 
 
 
281 aa  189  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  37.88 
 
 
286 aa  189  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  39.18 
 
 
286 aa  189  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  38.59 
 
 
310 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  41.2 
 
 
289 aa  188  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  38.6 
 
 
289 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  39.58 
 
 
290 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  39.02 
 
 
306 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  38.36 
 
 
296 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  40.99 
 
 
272 aa  185  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  38.1 
 
 
295 aa  185  6e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  39.59 
 
 
289 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  41.2 
 
 
274 aa  185  9e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  40.64 
 
 
272 aa  185  9e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  39.14 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  37.5 
 
 
310 aa  183  3e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  40.91 
 
 
290 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0509  parB-like partition protein  45.05 
 
 
284 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  38.21 
 
 
312 aa  182  7e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  40.56 
 
 
290 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  37.5 
 
 
283 aa  182  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  39.73 
 
 
300 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  37.79 
 
 
299 aa  181  9.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  37.75 
 
 
304 aa  181  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  37.97 
 
 
296 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  38.62 
 
 
288 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  36.39 
 
 
301 aa  179  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  37.63 
 
 
301 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  40.56 
 
 
290 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  37.84 
 
 
292 aa  178  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  38.98 
 
 
289 aa  178  9e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  37.88 
 
 
288 aa  178  9e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  36.9 
 
 
283 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  36.52 
 
 
283 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  36.86 
 
 
283 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  36.88 
 
 
294 aa  178  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  37.88 
 
 
290 aa  178  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  37.54 
 
 
294 aa  177  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  43.17 
 
 
304 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  37.54 
 
 
283 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  37.54 
 
 
283 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  38.06 
 
 
295 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  37.79 
 
 
303 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1473  chromosome partitioning protein  38.16 
 
 
310 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  39.38 
 
 
286 aa  177  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  37.5 
 
 
286 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  37.5 
 
 
286 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  38.32 
 
 
529 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  37.76 
 
 
302 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  37.59 
 
 
283 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  36.77 
 
 
286 aa  177  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  36.18 
 
 
283 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  36.18 
 
 
283 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1399  parB-like partition protein  38.56 
 
 
310 aa  176  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  37.79 
 
 
303 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  39.73 
 
 
294 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  38.01 
 
 
293 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  40.46 
 
 
331 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  39.93 
 
 
290 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1732  stage 0 sporulation protein J  35.96 
 
 
286 aa  176  5e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  37.67 
 
 
303 aa  176  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  36.99 
 
 
295 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  39.06 
 
 
255 aa  176  5e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  37.36 
 
 
326 aa  176  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  40.21 
 
 
290 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  35.25 
 
 
280 aa  175  7e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  34.88 
 
 
288 aa  175  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  37.46 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  39.74 
 
 
303 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  40.15 
 
 
328 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  37.04 
 
 
286 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  37.98 
 
 
305 aa  174  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  37.63 
 
 
278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  35.1 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  36.43 
 
 
284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  37.63 
 
 
278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  40.48 
 
 
280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  38.97 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  35.27 
 
 
305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  37.22 
 
 
314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  36.55 
 
 
283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  36.36 
 
 
294 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  36.81 
 
 
298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  42.22 
 
 
304 aa  172  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  38.23 
 
 
284 aa  172  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  38.24 
 
 
313 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  36.63 
 
 
303 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  35.91 
 
 
296 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>