More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1357 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1357  single-strand binding protein  100 
 
 		 144 aa  299  7.000000000000001e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  32.64 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  41.18 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  35.03 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  32.24 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  30.41 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  29.45 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0862  single-strand binding protein  33.06 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2511  single-strand binding protein  35.96 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000121094  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  31.85 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0148  single-strand binding protein  31.25 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000006762  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  37.86 
 
 		 206 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0115  single-strand binding protein  34.82 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0108  single-strand binding protein  35.96 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000326316  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  35.09 
 
 		 209 aa  77  0.00000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  44.23 
 
 		 166 aa  77  0.00000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0163  single-strand binding protein  34.82 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000810976  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  32.64 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0095  single-strand binding protein  34.21 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200743  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  31.88 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  29.25 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0159  single-strand binding protein  35.45 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000321111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  28.97 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  29.56 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  31.58 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  41.75 
 
 		 301 aa  74.3  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000779972  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  31.58 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  35.92 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  30 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  42.53 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  34.23 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  29.5 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  35.24 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  34.95 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  34.35 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  34.95 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  33.58 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  31.01 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  31.15 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  33.02 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  34.95 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  30.41 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1777  single-strand binding protein  31.43 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000276416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  39.08 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  32.67 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  26.43 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  30.07 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  36.76 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  37.86 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1661  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  31.51 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  26.25 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  34.86 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  30.97 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  35.2 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  34.95 
 
 		 166 aa  67  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  28.29 
 
 		 156 aa  67  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  37.8 
 
 		 161 aa  66.6  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  36.89 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  30.65 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  29.37 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  30.49 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0651  single-strand binding protein  36.26 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.136208  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  32.41 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  38.37 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  29.37 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  38.37 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  29.61 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  34.95 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  29.93 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0156  single-strand binding protein  35.56 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  28.99 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  32.87 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  29.25 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  32.04 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  30 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0828  single-strand binding protein  38.39 
 
 		 275 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.333907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  34.91 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  33.98 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  30 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  34.19 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  32.48 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  29.32 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  33.01 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  35.2 
 
 		 173 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  35.2 
 
 		 173 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  35.2 
 
 		 173 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  35.2 
 
 		 173 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  30.6 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  35.2 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  35.2 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  30.6 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  35.2 
 
 		 173 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  35.2 
 
 		 172 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 166 aa  63.5  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1033  single-stranded DNA-binding protein  32.04 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.391899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  34.58 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>