More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1279 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  100 
 
 
428 aa  877  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  33.11 
 
 
443 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  32.87 
 
 
432 aa  244  2e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  33.1 
 
 
429 aa  232  9e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.0948e-15  normal 
 
 
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  34.56 
 
 
440 aa  232  1e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.03 
 
 
430 aa  225  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  36.67 
 
 
407 aa  225  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  2.66488e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  36.5 
 
 
435 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  4.01957e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  32.7 
 
 
427 aa  224  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.81605e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  36.67 
 
 
407 aa  223  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.11 
 
 
444 aa  216  6e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  2.57607e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  32.58 
 
 
457 aa  209  9e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  30.17 
 
 
438 aa  206  5e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  7.69838e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  32.05 
 
 
449 aa  204  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  30.43 
 
 
442 aa  198  1e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  32.77 
 
 
445 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  31.88 
 
 
444 aa  194  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  7.50977e-07  decreased coverage  9.15698e-05 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  30.52 
 
 
441 aa  191  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  2.57042e-08  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  32.55 
 
 
434 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  32.55 
 
 
434 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  32.55 
 
 
434 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  32.91 
 
 
445 aa  186  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  33.86 
 
 
440 aa  186  7e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  4.1437e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  32.5 
 
 
437 aa  183  4e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  30.14 
 
 
436 aa  181  3e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  28.2 
 
 
432 aa  180  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  30.02 
 
 
438 aa  179  6e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  28.09 
 
 
434 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  28.98 
 
 
426 aa  177  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  30.84 
 
 
446 aa  174  2e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  30.79 
 
 
431 aa  174  2e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  27.08 
 
 
429 aa  173  6e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  31.27 
 
 
450 aa  172  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  30.99 
 
 
450 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  30.25 
 
 
435 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  35.62 
 
 
462 aa  170  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  30.21 
 
 
435 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  28.9 
 
 
432 aa  169  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  34.04 
 
 
446 aa  169  9e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  32.53 
 
 
461 aa  169  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  30.34 
 
 
450 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  28.54 
 
 
435 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  28.43 
 
 
438 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.86 
 
 
448 aa  169  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  30.7 
 
 
444 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  28.36 
 
 
434 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  31.45 
 
 
441 aa  168  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  29.7 
 
 
443 aa  168  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  31.56 
 
 
450 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  29.63 
 
 
431 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  35.27 
 
 
449 aa  166  6e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  27.9 
 
 
450 aa  166  6e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  28.14 
 
 
441 aa  166  6e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  35.27 
 
 
449 aa  166  7e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  28.93 
 
 
435 aa  166  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  34.63 
 
 
451 aa  166  9e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  27.8 
 
 
422 aa  166  9e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.8 
 
 
422 aa  166  9e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  28.4 
 
 
441 aa  166  1e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  30.11 
 
 
444 aa  165  1e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  29.14 
 
 
419 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  31.6 
 
 
444 aa  164  4e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  31.6 
 
 
444 aa  164  4e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  28.28 
 
 
443 aa  163  4e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  27.14 
 
 
446 aa  163  5e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.93 
 
 
442 aa  163  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  28.67 
 
 
421 aa  163  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  28.97 
 
 
431 aa  163  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  29.67 
 
 
431 aa  162  8e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  32.28 
 
 
454 aa  162  8e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  26.7 
 
 
403 aa  162  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  26.79 
 
 
436 aa  162  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  30.3 
 
 
439 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.57 
 
 
442 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  28.74 
 
 
431 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  27.15 
 
 
425 aa  161  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  27.76 
 
 
415 aa  160  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  4.1462e-08  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.91 
 
 
428 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  28.74 
 
 
431 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  29.14 
 
 
419 aa  161  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  28.74 
 
 
431 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  26.54 
 
 
443 aa  160  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  27.71 
 
 
430 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  28.01 
 
 
430 aa  160  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  29.18 
 
 
437 aa  159  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  27.82 
 
 
443 aa  159  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  28.01 
 
 
442 aa  159  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  27.82 
 
 
443 aa  159  9e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  27.23 
 
 
440 aa  159  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  27.65 
 
 
428 aa  159  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  27.71 
 
 
430 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  32.28 
 
 
450 aa  157  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  27.93 
 
 
441 aa  156  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  31.59 
 
 
461 aa  155  9e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  28.37 
 
 
442 aa  154  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  27.78 
 
 
408 aa  154  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  28.22 
 
 
442 aa  153  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  4.3993e-06 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  27.51 
 
 
463 aa  154  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  28.92 
 
 
442 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.49314e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  28.7 
 
 
442 aa  152  9e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  7.14613e-09  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>