95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1265 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1265  ribonuclease P protein component  100 
 
 
127 aa  263  8e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000149389  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  33.61 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  38.1 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  33.05 
 
 
119 aa  62  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  33.63 
 
 
120 aa  60.5  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  30.48 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  30.48 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  31.19 
 
 
115 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  27.36 
 
 
116 aa  53.9  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  34 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  35.37 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  36.17 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  26.09 
 
 
121 aa  52  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  35.63 
 
 
116 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  32.98 
 
 
162 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4004  ribonuclease P  28.07 
 
 
118 aa  51.2  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119749  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  29.7 
 
 
121 aa  51.6  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0008  ribonuclease P  28.07 
 
 
118 aa  50.8  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000450646  unclonable  0.0000000000397397 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4034  ribonuclease P  28.07 
 
 
118 aa  50.8  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000319179  hitchhiker  0.000155322 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3942  ribonuclease P  28.07 
 
 
118 aa  50.8  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000139461  unclonable  0.0000000000208872 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4382  ribonuclease P  28.07 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000348711  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4381  ribonuclease P  28.07 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000190839  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4523  ribonuclease P  28.07 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000021378  hitchhiker  0.000108776 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4327  ribonuclease P  28.07 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000794478  unclonable  0.00000000000188803 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0006  ribonuclease P  28.07 
 
 
118 aa  50.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  28.43 
 
 
115 aa  50.8  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  26.5 
 
 
122 aa  50.4  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  23.89 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  27.84 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  32.18 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3777  ribonuclease P  27.19 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000556747  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  36.84 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  23.89 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  36.84 
 
 
117 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  38.36 
 
 
117 aa  48.9  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  36.84 
 
 
117 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  23.89 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  23.89 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  23.89 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  32.18 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  23.89 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  23.89 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  23.89 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3035  ribonuclease P protein component  28.44 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  26.79 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  23.89 
 
 
115 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  29.46 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  36.05 
 
 
113 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  32.08 
 
 
116 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  27.36 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  25 
 
 
115 aa  47.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  32.08 
 
 
116 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  32.05 
 
 
130 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  28.32 
 
 
111 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  36.84 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  25.49 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  28.85 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0201  ribonuclease P  36.14 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  34.74 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  24.11 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  27.19 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000676804  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  28 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03125  possible ribonuclease P component  42.86 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.168885  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3868  ribonuclease P  30.12 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000277263  unclonable  0.00000245558 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3317  ribonuclease P  31.03 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4065  ribonuclease P  25.44 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000140717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  27.36 
 
 
126 aa  44.3  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  35.06 
 
 
116 aa  44.7  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3320  ribonuclease P protein component  32 
 
 
120 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  31.25 
 
 
154 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3076  hypothetical protein  37.84 
 
 
114 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  30.39 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0983  ribonuclease P protein component  29.67 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.162194  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1040  ribonuclease P protein component  33.82 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0513155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  29.76 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  29.11 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0821  ribonuclease P protein component  33.82 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0004  ribonuclease P  26.09 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000936038  unclonable  0.0000000000697895 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2932  hypothetical protein  41.79 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4931  ribonuclease P  26.13 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000059586  unclonable  0.00000000749508 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4259  ribonuclease P  28.92 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000742435  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  31.58 
 
 
180 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  26.32 
 
 
118 aa  41.6  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  34.18 
 
 
107 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  27.27 
 
 
126 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  30.63 
 
 
123 aa  41.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  26.89 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4314  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  32.05 
 
 
121 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52470  ribonuclease P  30.56 
 
 
130 aa  40.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  26.88 
 
 
152 aa  40.8  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  30.53 
 
 
129 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4266  ribonuclease P  26.13 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000515429  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2602  ribonuclease P protein component  30.77 
 
 
116 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.201057  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>