More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1249 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
254 aa  526  1e-148  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  36.44 
 
 
278 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  34 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 
319 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 
321 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  33.84 
 
 
224 aa  125  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  34.03 
 
 
275 aa  125  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0625  polysaccharide deacetylase  31.42 
 
 
266 aa  124  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0292231  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  33.19 
 
 
261 aa  120  3e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  29.8 
 
 
279 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  33.52 
 
 
510 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  33.52 
 
 
645 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 
615 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 
615 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 
627 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  34.08 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  32.5 
 
 
373 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  30.51 
 
 
264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  28.65 
 
 
255 aa  108  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 
270 aa  108  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  29.24 
 
 
274 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 
319 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  27.91 
 
 
289 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  32.09 
 
 
256 aa  106  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  30.63 
 
 
234 aa  106  4e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 
1015 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  34.69 
 
 
318 aa  105  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 
336 aa  102  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  26.86 
 
 
274 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  28.43 
 
 
306 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  27.91 
 
 
306 aa  99.4  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  36.78 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.79 
 
 
409 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  29.88 
 
 
256 aa  96.3  5e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
291 aa  95.5  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.36 
 
 
409 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 
316 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  25.52 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.36 
 
 
409 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  30.2 
 
 
313 aa  92.8  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0171  polysaccharide deacetylase  26.56 
 
 
259 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0521886  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 
322 aa  92.8  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0138  polysaccharide deacetylase domain protein  29.36 
 
 
409 aa  92  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  29.36 
 
 
409 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  29.36 
 
 
409 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  29.36 
 
 
409 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  29.36 
 
 
409 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  29.22 
 
 
258 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  29.39 
 
 
370 aa  91.3  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0792  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 
278 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.623292  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
598 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  29.8 
 
 
363 aa  90.9  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5797  polysaccharide deacetylase  26.29 
 
 
289 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  29.13 
 
 
590 aa  90.5  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  27.18 
 
 
244 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  27.18 
 
 
244 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1796  polysaccharide deacetylase  25.24 
 
 
344 aa  90.1  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  27.83 
 
 
276 aa  89.7  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  27.18 
 
 
244 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0310  polysaccharide deacetylase  32.4 
 
 
358 aa  89.4  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1105  polysaccharide deacetylase  24.66 
 
 
270 aa  89.4  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  27.36 
 
 
253 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  31.8 
 
 
277 aa  89  7e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0298  polysaccharide deacetylase  32.4 
 
 
360 aa  87.8  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  29.53 
 
 
265 aa  87.8  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4943  polysaccharide deacetylase-like protein  31.84 
 
 
360 aa  87  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  25.96 
 
 
426 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0377  polysaccharide deacetylase-like protein  32.4 
 
 
360 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0309  polysaccharide deacetylase  32.37 
 
 
361 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  29.02 
 
 
273 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0360  polysaccharide deacetylase-like protein  31.84 
 
 
360 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0404  polysaccharide deacetylase-like protein  31.84 
 
 
360 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.606713  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4541  polysaccharide deacetylase  26.15 
 
 
263 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00515582 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  26.58 
 
 
239 aa  86.3  5e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4408  polysaccharide deacetylase  26.15 
 
 
263 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0020  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 
381 aa  85.5  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  28.57 
 
 
273 aa  85.5  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  28.57 
 
 
273 aa  85.5  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  26.8 
 
 
1001 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0846  polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 
280 aa  84.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  29.02 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.02 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0658  xylanase/chitin deacetylase-like protein  28.5 
 
 
221 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  26.16 
 
 
239 aa  84  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  27.37 
 
 
278 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  27.11 
 
 
264 aa  84  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  27.37 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  29.31 
 
 
273 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  27.95 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3475  polysaccharide deacetylase  27.19 
 
 
437 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  25.85 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0204  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.19 
 
 
409 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  27.36 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  27.19 
 
 
407 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  28.31 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1014  polysaccharide deacetylase family protein  27.19 
 
 
417 aa  82.4  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4358  polysaccharide deacetylase  29.47 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3346  polysaccharide deacetylase family protein  27.19 
 
 
417 aa  82.4  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000257148  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  28.07 
 
 
415 aa  82.4  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 
244 aa  82  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>