More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1180 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  834    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  44.64 
 
 
406 aa  320  3e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  42.75 
 
 
401 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  46.63 
 
 
409 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  45.64 
 
 
409 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  46.13 
 
 
409 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  45.59 
 
 
409 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  45.39 
 
 
408 aa  310  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  38.25 
 
 
403 aa  298  1e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  40.2 
 
 
406 aa  298  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  42.96 
 
 
406 aa  293  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  39.75 
 
 
400 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  39.7 
 
 
406 aa  289  7e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  40.25 
 
 
400 aa  288  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  40.49 
 
 
400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  40.49 
 
 
400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  39 
 
 
401 aa  282  7.000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  38.33 
 
 
405 aa  279  6e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  39.21 
 
 
406 aa  278  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  37.66 
 
 
403 aa  276  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  39.4 
 
 
405 aa  276  4e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  39 
 
 
402 aa  276  5e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  40.99 
 
 
409 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  44.78 
 
 
409 aa  273  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  40.49 
 
 
409 aa  272  9e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  42.48 
 
 
405 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  40.25 
 
 
409 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  42.18 
 
 
404 aa  270  4e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  39.36 
 
 
411 aa  268  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  36.02 
 
 
402 aa  265  8e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  41.4 
 
 
402 aa  265  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  38.21 
 
 
401 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  38.41 
 
 
443 aa  260  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  37.97 
 
 
658 aa  260  3e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  39.26 
 
 
401 aa  260  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  39.26 
 
 
401 aa  260  4e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  40.05 
 
 
410 aa  259  8e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  42.51 
 
 
391 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  35.52 
 
 
456 aa  258  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  37.59 
 
 
402 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  37.59 
 
 
402 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  39.55 
 
 
651 aa  257  3e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  39.75 
 
 
409 aa  256  4e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  37.5 
 
 
405 aa  256  7e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1168  hypothetical protein  42.07 
 
 
406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.69946  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  36.22 
 
 
715 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  39.12 
 
 
408 aa  253  4.0000000000000004e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  37.9 
 
 
403 aa  252  7e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  36.85 
 
 
707 aa  249  4e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  36.39 
 
 
400 aa  249  5e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  37.06 
 
 
407 aa  249  7e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  39.55 
 
 
652 aa  249  8e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  38.9 
 
 
653 aa  249  9e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  37.66 
 
 
405 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  35.64 
 
 
398 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  38.67 
 
 
661 aa  246  8e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  37.8 
 
 
663 aa  246  8e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  37.79 
 
 
418 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  36.66 
 
 
644 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2608  hypothetical protein  37.13 
 
 
411 aa  244  3e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  37.75 
 
 
663 aa  243  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  35.15 
 
 
410 aa  242  7e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  34.99 
 
 
409 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  35.15 
 
 
410 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  38.9 
 
 
656 aa  241  2e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  37.56 
 
 
657 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  35.57 
 
 
454 aa  240  4e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  37.47 
 
 
654 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  36.43 
 
 
404 aa  239  5e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  39.26 
 
 
657 aa  239  6.999999999999999e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  37 
 
 
405 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  36.19 
 
 
404 aa  238  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  36.59 
 
 
411 aa  238  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  36.75 
 
 
405 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  37.75 
 
 
410 aa  236  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  37.02 
 
 
409 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  37.29 
 
 
412 aa  236  5.0000000000000005e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  37.62 
 
 
671 aa  236  6e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  39.8 
 
 
670 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  34.16 
 
 
409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  36 
 
 
405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  38.06 
 
 
653 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  36.5 
 
 
405 aa  232  9e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  36.5 
 
 
405 aa  232  9e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  35.73 
 
 
409 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  35.73 
 
 
409 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  35.47 
 
 
657 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  38.21 
 
 
657 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  37.8 
 
 
414 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  35.75 
 
 
656 aa  229  8e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2149  hypothetical protein  37.41 
 
 
402 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531927  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2039  hypothetical protein  36.25 
 
 
403 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  38.4 
 
 
657 aa  224  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  38.59 
 
 
415 aa  224  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7079  protein of unknown function DUF214  32.68 
 
 
452 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  35.7 
 
 
405 aa  224  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  33.91 
 
 
409 aa  224  3e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  33.33 
 
 
647 aa  224  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  35.87 
 
 
648 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  35.87 
 
 
648 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>