More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1058 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  100 
 
 
176 aa  366  1e-100  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.23 
 
 
175 aa  91.3  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  38.73 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.83 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.84 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  47 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.29 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.28 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.47 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.18 
 
 
157 aa  79  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  61.19 
 
 
169 aa  78.2  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  56.25 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  53.75 
 
 
79 aa  78.6  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.29 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.13 
 
 
166 aa  77.4  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.46 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  76.47 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  60.32 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.86 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.14 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  56.76 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  50 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.22 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.76 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  64.06 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.29 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  58.82 
 
 
136 aa  73.9  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  67.27 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.38 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  49.43 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.29 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.38 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  64.29 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.9 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.61 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  53.76 
 
 
171 aa  72  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  58.21 
 
 
168 aa  72  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  68.52 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  36.54 
 
 
172 aa  70.5  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  64.81 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  81.82 
 
 
48 aa  70.1  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  62.07 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  62.07 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.35 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  65.45 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  67.27 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.72 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.73 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.65 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.16 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  70.83 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  77.27 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  50.72 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  56.36 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  56.9 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.44 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  83.78 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  62.75 
 
 
178 aa  62.4  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  76.19 
 
 
165 aa  62  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  51.72 
 
 
548 aa  61.6  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  57.69 
 
 
152 aa  62  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  53.57 
 
 
141 aa  61.2  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  54.39 
 
 
567 aa  61.6  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  49.12 
 
 
169 aa  60.8  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  56.36 
 
 
634 aa  60.8  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  55.36 
 
 
527 aa  60.5  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  51.72 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  44.93 
 
 
196 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0526  hypothetical protein  50.85 
 
 
158 aa  58.9  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000137512  normal  0.350549 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  35.71 
 
 
170 aa  58.2  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  46.03 
 
 
178 aa  57.8  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  51.02 
 
 
179 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  47.27 
 
 
168 aa  57.4  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  36.04 
 
 
170 aa  57.4  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.32 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  49.09 
 
 
162 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  53.06 
 
 
174 aa  57.4  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  50 
 
 
160 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  47.69 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  46.67 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  59.18 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  50 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  57.41 
 
 
187 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  45.28 
 
 
179 aa  55.1  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1201  Tfp pilus assembly protein PilE-like  54 
 
 
189 aa  55.1  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  66.67 
 
 
151 aa  54.7  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  52.27 
 
 
148 aa  54.7  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  68.57 
 
 
153 aa  54.7  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  42.62 
 
 
142 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  55.56 
 
 
182 aa  54.7  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  55.77 
 
 
176 aa  54.3  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  55.77 
 
 
176 aa  54.3  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  53.19 
 
 
141 aa  54.3  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  49.06 
 
 
142 aa  54.3  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  62.5 
 
 
135 aa  53.9  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  52.27 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  55 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  42.59 
 
 
188 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  42.5 
 
 
138 aa  53.9  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  46.15 
 
 
138 aa  53.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>