More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1026 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1026  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
326 aa  657    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0093  HlyD family secretion protein  44.62 
 
 
331 aa  246  4.9999999999999997e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0320304 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0477  hypothetical protein  40.74 
 
 
332 aa  245  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0396  secretion protein HlyD family protein  40.74 
 
 
330 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0506  secretion protein HlyD family protein  40.87 
 
 
324 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0531  secretion protein HlyD family protein  40.56 
 
 
324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0527  secretion protein HlyD family protein  40.56 
 
 
324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0568004  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003317  membrane-fusion protein  41.72 
 
 
326 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0583  secretion protein HlyD family protein  40.56 
 
 
324 aa  238  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3813  secretion protein HlyD family protein  40.25 
 
 
324 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3729  secretion protein HlyD family protein  39.26 
 
 
329 aa  235  6e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4089  HlyD family secretion protein  39.94 
 
 
324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3639  secretion protein HlyD family protein  40.06 
 
 
324 aa  231  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3745  secretion protein HlyD family protein  41.85 
 
 
323 aa  229  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0488  secretion protein HlyD family protein  39.75 
 
 
324 aa  229  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3463  secretion protein HlyD family protein  39.75 
 
 
324 aa  229  7e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0412  secretion protein HlyD family protein  40.06 
 
 
323 aa  227  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.604128  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0478  HlyD family secretion protein  41.2 
 
 
322 aa  226  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.161841 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0567  secretion protein HlyD family protein  41.96 
 
 
323 aa  225  9e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.142155 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1840  hypothetical protein  39.62 
 
 
332 aa  224  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.137202  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0604  secretion protein HlyD family protein  41.77 
 
 
326 aa  224  2e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1212  hypothetical protein  43.29 
 
 
324 aa  223  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000214097  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4393  secretion protein HlyD family protein  40.2 
 
 
323 aa  222  7e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0150137  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  37.69 
 
 
427 aa  218  8.999999999999998e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0653  secretion protein HlyD family protein  38.72 
 
 
357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0618  putative secretion protein, HlyD family  39.88 
 
 
326 aa  210  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02435  hypothetical protein  42.62 
 
 
326 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4571  secretion protein HlyD family protein  41.78 
 
 
349 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707913  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1189  secretion protein HlyD  38.79 
 
 
323 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1173  secretion protein HlyD family protein  41.18 
 
 
337 aa  199  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2682  secretion protein HlyD family protein  39.15 
 
 
323 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2777  secretion protein HlyD family protein  38.79 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.991626  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2703  secretion protein HlyD family protein  36.01 
 
 
367 aa  195  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4808  secretion protein HlyD family protein  37.62 
 
 
330 aa  189  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  32.36 
 
 
323 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  32.69 
 
 
323 aa  185  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  34.16 
 
 
323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1925  secretion protein HlyD family protein  34.37 
 
 
328 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0178624 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  26.94 
 
 
353 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2701  secretion protein HlyD family protein  29.89 
 
 
333 aa  113  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  27.72 
 
 
398 aa  112  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  30.72 
 
 
354 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  30.67 
 
 
347 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  27.97 
 
 
334 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  27.8 
 
 
331 aa  102  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  27.81 
 
 
328 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  27.81 
 
 
328 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  28.85 
 
 
333 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  28.06 
 
 
333 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  26.16 
 
 
335 aa  99.8  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  27.41 
 
 
342 aa  99.4  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  27.49 
 
 
329 aa  99  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  25.57 
 
 
335 aa  98.6  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  27.46 
 
 
331 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  27.46 
 
 
331 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  27.46 
 
 
331 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  27.86 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  27.46 
 
 
331 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  27.46 
 
 
331 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  29.63 
 
 
337 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  29.21 
 
 
337 aa  96.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.32 
 
 
414 aa  95.9  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.152554 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  27.05 
 
 
328 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  29.59 
 
 
344 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  26.21 
 
 
357 aa  94.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  27.33 
 
 
336 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  25.25 
 
 
356 aa  94  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.32 
 
 
462 aa  94.4  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  27.3 
 
 
355 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  27.3 
 
 
355 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  27.3 
 
 
355 aa  92  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  27.17 
 
 
355 aa  92  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  27.3 
 
 
355 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  27.3 
 
 
355 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  27.3 
 
 
355 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  29.15 
 
 
342 aa  92  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  26.55 
 
 
331 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  26.55 
 
 
332 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  26.55 
 
 
331 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  26.55 
 
 
331 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  26.55 
 
 
331 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  27.21 
 
 
332 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  26.55 
 
 
332 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  26.55 
 
 
331 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  26.55 
 
 
331 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  27.74 
 
 
355 aa  90.5  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  28.24 
 
 
335 aa  89  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  25.08 
 
 
344 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  26.21 
 
 
331 aa  88.6  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  28.7 
 
 
359 aa  87.8  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  28.26 
 
 
357 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  25.82 
 
 
359 aa  87.4  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.5 
 
 
397 aa  86.3  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  27.22 
 
 
355 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4577  secretion protein HlyD  27.32 
 
 
354 aa  85.9  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.231546  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3835  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  27.08 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  27.7 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  22.46 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  28.24 
 
 
357 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4061  secretion protein HlyD family protein  25.41 
 
 
354 aa  85.5  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>