More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1025 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  100 
 
 
391 aa  786    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02436  hypothetical protein  28.11 
 
 
395 aa  156  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  27.58 
 
 
362 aa  153  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  28.78 
 
 
383 aa  153  5.9999999999999996e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 
780 aa  149  8e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  29.41 
 
 
402 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  30.24 
 
 
387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  26.35 
 
 
378 aa  139  7e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
395 aa  138  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  27.38 
 
 
435 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3812  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 
430 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188014  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  29.05 
 
 
395 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0528  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 
405 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  26.2 
 
 
387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 
387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 
405 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0507  ABC-2 type transporter  27.68 
 
 
430 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  27.25 
 
 
375 aa  122  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3462  ABC-2 type transporter  27.08 
 
 
429 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3638  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 
431 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  24.62 
 
 
391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0489  ABC-2 type transporter  26.49 
 
 
429 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  23.98 
 
 
371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0584  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 
408 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0476  hypothetical protein  22.81 
 
 
372 aa  113  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  26.33 
 
 
379 aa  106  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1729  hypothetical protein  25.9 
 
 
390 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20100  hypothetical protein  26.2 
 
 
390 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.944312 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3728  hypothetical protein  24.85 
 
 
390 aa  103  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4570  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 
417 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 
376 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4392  ABC-2 type transporter  25.23 
 
 
384 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140219  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  26.27 
 
 
389 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0500  ABC-2 type transporter  25 
 
 
384 aa  99.8  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  23.15 
 
 
369 aa  96.3  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  25.29 
 
 
382 aa  95.5  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  24.67 
 
 
366 aa  92.8  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 
373 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  23.79 
 
 
373 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  24.43 
 
 
373 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  24.43 
 
 
373 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  23.86 
 
 
373 aa  90.5  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  25.85 
 
 
376 aa  90.1  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 
373 aa  90.1  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  24.21 
 
 
388 aa  89.7  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  22.57 
 
 
376 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  23.22 
 
 
379 aa  89  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  22.81 
 
 
371 aa  89.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  24.14 
 
 
373 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  22.28 
 
 
380 aa  89  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  24.67 
 
 
378 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  25.45 
 
 
382 aa  88.6  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  25.07 
 
 
384 aa  88.6  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  24.73 
 
 
381 aa  87.8  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 
373 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  24.14 
 
 
373 aa  87.4  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  22.19 
 
 
378 aa  87  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  24.44 
 
 
387 aa  87  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  26.17 
 
 
372 aa  86.7  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3708  ABC-2 type transporter  25.66 
 
 
374 aa  86.3  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  25.66 
 
 
372 aa  85.9  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  23.67 
 
 
904 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  23.06 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1136  hypothetical protein  22.55 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  21.8 
 
 
405 aa  84  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  22.76 
 
 
367 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  22.97 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  24.57 
 
 
378 aa  82.8  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  23.03 
 
 
384 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  24.78 
 
 
369 aa  82.8  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  21.71 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  23.03 
 
 
384 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  25.08 
 
 
372 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0092  transporter, putative  21.85 
 
 
379 aa  82  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0602598 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.99 
 
 
384 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 
380 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  22.28 
 
 
370 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  25.07 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  23.05 
 
 
364 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  24.01 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  27.98 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  25.08 
 
 
375 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.64 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  25.07 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0652  hypothetical protein  32.76 
 
 
491 aa  79.3  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.96 
 
 
365 aa  79  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  21.07 
 
 
379 aa  79.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  23.95 
 
 
382 aa  78.2  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  22.58 
 
 
369 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0019  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 
373 aa  79  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  23.36 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  21.98 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0720  hypothetical protein  20.86 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  22.13 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  21.76 
 
 
368 aa  76.3  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1478  ABC-2 type transporter  24.55 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  20.17 
 
 
381 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  24.2 
 
 
395 aa  75.9  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>