170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1024 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  595  1e-169  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  30.48 
 
 
395 aa  162  4e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  30.96 
 
 
780 aa  159  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  32.07 
 
 
405 aa  152  8e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  29.47 
 
 
383 aa  141  1e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  33.73 
 
 
392 aa  141  1e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0620  ABC-2 type transporter  29.51 
 
 
378 aa  139  7e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  31.38 
 
 
397 aa  138  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  30.53 
 
 
397 aa  136  3e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02437  hypothetical protein  33.33 
 
 
383 aa  136  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3811  ABC-2 type transporter  30.58 
 
 
383 aa  134  1e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0533  ABC-2 type transporter  30.58 
 
 
379 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1842  hypothetical protein  30.2 
 
 
395 aa  132  7e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0529  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 
381 aa  132  7e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0508  ABC-2 type transporter  29.07 
 
 
381 aa  132  8e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4087  hypothetical protein  30.48 
 
 
378 aa  130  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0585  ABC-2 type transporter  30.17 
 
 
382 aa  129  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 
383 aa  129  8e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0490  hypothetical protein  28.37 
 
 
383 aa  128  9e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3637  hypothetical protein  28.37 
 
 
383 aa  128  9e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1214  hypothetical protein  30.53 
 
 
382 aa  127  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  33.47 
 
 
377 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0651  ABC-2 type transporter  31.36 
 
 
496 aa  124  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0480  hypothetical protein  31.25 
 
 
386 aa  122  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.292724 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  31.3 
 
 
384 aa  121  1e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3727  hypothetical protein  28.37 
 
 
381 aa  121  1e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1171  hypothetical protein  29.27 
 
 
375 aa  118  1e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4806  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 
367 aa  117  2e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271694  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3743  ABC-2 type transporter  30.74 
 
 
384 aa  113  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0414  ABC-2 type transporter  31.96 
 
 
381 aa  109  7e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0569  ABC-2 type transporter  30.18 
 
 
382 aa  99.4  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  27.2 
 
 
377 aa  99  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  25.66 
 
 
378 aa  96.3  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  23.75 
 
 
391 aa  95.1  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  26.44 
 
 
377 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  28.28 
 
 
383 aa  89  8e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  26.46 
 
 
376 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2683  hypothetical protein  28.22 
 
 
378 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25949  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 
379 aa  86.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  24.6 
 
 
395 aa  86.7  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1038  hypothetical protein  31.11 
 
 
434 aa  85.5  1e-15  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2778  ABC-2 type transporter  27.61 
 
 
378 aa  85.5  1e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  23.91 
 
 
379 aa  81.6  1e-14  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 
389 aa  80.9  2e-14  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1188  hypothetical protein  27.04 
 
 
378 aa  81.3  2e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  24.23 
 
 
391 aa  79  8e-14  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  24.38 
 
 
387 aa  79  8e-14  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0489  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 
429 aa  77.4  2e-13  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0652  hypothetical protein  26.99 
 
 
491 aa  77.4  3e-13  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3462  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 
429 aa  77  3e-13  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  24.34 
 
 
402 aa  76.6  4e-13  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  26.4 
 
 
387 aa  76.3  6e-13  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3638  ABC-2 type transporter  29.08 
 
 
431 aa  76.3  6e-13  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0584  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 
408 aa  75.5  9e-13  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  28.64 
 
 
435 aa  74.7  2e-12  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0092  transporter, putative  22.76 
 
 
379 aa  74.7  2e-12  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0602598 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0476  hypothetical protein  23.83 
 
 
372 aa  74.7  2e-12  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  28.72 
 
 
405 aa  73.6  4e-12  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0528  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 
405 aa  73.2  5e-12  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3812  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 
430 aa  73.2  5e-12  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188014  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4392  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 
384 aa  72.8  6e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140219  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  22.3 
 
 
375 aa  72.8  7e-12  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0507  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 
430 aa  72.8  7e-12  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2779  ABC-2 type transporter  25.35 
 
 
405 aa  72.4  9e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  27.14 
 
 
395 aa  72.4  9e-12  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  23.53 
 
 
371 aa  71.2  2e-11  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2331  hypothetical protein  24.05 
 
 
399 aa  71.2  2e-11  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3728  hypothetical protein  24.36 
 
 
390 aa  70.5  3e-11  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  24.02 
 
 
362 aa  69.3  8e-11  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1729  hypothetical protein  25.98 
 
 
390 aa  68.6  1e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0895  ABC-2 type transporter  24.5 
 
 
378 aa  67.4  3e-10  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  24.74 
 
 
387 aa  67  3e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  24.91 
 
 
384 aa  66.6  4e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4570  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 
417 aa  66.2  5e-10  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20100  hypothetical protein  25.2 
 
 
390 aa  65.9  7e-10  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.944312 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  22.75 
 
 
415 aa  65.1  1e-09  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  20.98 
 
 
368 aa  64.3  2e-09  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1187  hypothetical protein  21.03 
 
 
407 aa  65.1  2e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  20.74 
 
 
380 aa  63.9  3e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  22.66 
 
 
397 aa  63.9  3e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  22.67 
 
 
372 aa  62.8  6e-09  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  25.86 
 
 
382 aa  62.4  8e-09  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  21.07 
 
 
390 aa  62.4  9e-09  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02436  hypothetical protein  25.14 
 
 
395 aa  62.4  9e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  21.48 
 
 
370 aa  61.2  2e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  20.91 
 
 
370 aa  60.5  3e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1927  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 
390 aa  59.3  7e-08  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.751197  normal  0.0397267 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  20.27 
 
 
371 aa  58.5  1e-07  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2684  ABC-2 type transporter  23.94 
 
 
405 aa  58.2  2e-07  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020702  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  23.86 
 
 
371 aa  57.8  2e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  23.86 
 
 
371 aa  57.8  2e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0500  ABC-2 type transporter  27.62 
 
 
384 aa  57.4  3e-07  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  22.46 
 
 
384 aa  55.5  1e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0341  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 
394 aa  54.7  2e-06  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  21.31 
 
 
381 aa  54.3  2e-06  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  24.37 
 
 
381 aa  54.7  2e-06  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  22.87 
 
 
368 aa  53.9  3e-06  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  22.11 
 
 
384 aa  53.9  3e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  22.63 
 
 
382 aa  53.9  3e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  22.43 
 
 
414 aa  53.5  4e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>