110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0911 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0911  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
226 aa  457  9.999999999999999e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000610478  hitchhiker  0.00000000000000386547 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3149  cyclic nucleotide-binding protein  41.78 
 
 
238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1423  cyclic nucleotide-binding protein  37.73 
 
 
222 aa  165  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0243241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0705  cyclic nucleotide-binding protein  34.53 
 
 
227 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0034  cyclic nucleotide-binding protein  34.72 
 
 
219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000350916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0702  cyclic nucleotide-binding protein  34.08 
 
 
233 aa  145  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01090  transcriptional regulator, crp family  35.94 
 
 
224 aa  138  8.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2189  hypothetical protein  37.63 
 
 
219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0895568  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0213  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.18 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05960  cAMP-binding protein  33.49 
 
 
215 aa  129  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.65 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.07605e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0741  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.86 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.343914  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2221  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.63 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.181319  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03090  cAMP-binding protein  31.31 
 
 
227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0333204  hitchhiker  1.31136e-22 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1360  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.42 
 
 
235 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990851  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.17 
 
 
225 aa  97.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000947161  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2845  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.87 
 
 
226 aa  87  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0478  cyclic nucleotide binding domain-containing protein  30 
 
 
216 aa  86.7  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1171  cyclic nucleotide-binding protein  28.64 
 
 
226 aa  85.9  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00521884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2531  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.73 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13660  cAMP-binding protein  24.5 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1162  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1827  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.94 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3951  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.05 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.8 
 
 
254 aa  62.8  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
225 aa  62  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3304  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.11 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010506 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.32 
 
 
226 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0463  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.96 
 
 
221 aa  58.5  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.607183  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0857  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.14 
 
 
229 aa  58.5  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0981  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.14 
 
 
246 aa  58.5  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0154476 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.97 
 
 
227 aa  58.5  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1580  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.65 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1555  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.92 
 
 
230 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.19 
 
 
229 aa  55.5  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.64 
 
 
228 aa  55.1  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  20.67 
 
 
223 aa  53.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
234 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1724  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.57 
 
 
230 aa  53.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3468  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.24 
 
 
236 aa  52.8  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.96 
 
 
232 aa  52.8  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0079  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.36 
 
 
225 aa  52.4  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.849443  normal  0.162256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0407  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.17 
 
 
243 aa  51.6  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1053  transcriptional regulator, putative  20 
 
 
228 aa  51.6  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0216294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7767  putative nitrogen fixation regulation protein fixK  25.93 
 
 
153 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0621624  normal  0.228605 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0756  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.39 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2472  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20 
 
 
238 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.18 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.15 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2562  cyclic AMP receptor protein  22.35 
 
 
222 aa  50.1  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.553837  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2778  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20 
 
 
238 aa  50.1  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0529131  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6767  cyclic nucleotide-binding protein  23.86 
 
 
228 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171014  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2478  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.39 
 
 
249 aa  49.3  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1303  CRP/FNR family transcriptional regulator  20 
 
 
229 aa  49.7  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3114  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.35 
 
 
232 aa  49.3  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6568  cyclic nucleotide-binding protein  24.23 
 
 
228 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538415  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.62 
 
 
234 aa  49.3  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.42 
 
 
241 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1444  Crp/Fnr family transcriptional regulator  23.67 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.04 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.04 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.42 
 
 
229 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  22.48 
 
 
225 aa  47  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5361  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.35 
 
 
299 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3945  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.48 
 
 
240 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000374248  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2066  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.61 
 
 
224 aa  46.6  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0111986  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4876  cyclic nucleotide-binding  25.9 
 
 
317 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.55 
 
 
222 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1658  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.55 
 
 
222 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0327  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.67 
 
 
233 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539351  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0968  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.43 
 
 
210 aa  46.2  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.72963  normal  0.699928 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1972  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.67 
 
 
233 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0629  transcriptional regulator FixK  26.52 
 
 
215 aa  45.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.595222  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4621  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.69 
 
 
236 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4632  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
234 aa  45.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.5 
 
 
227 aa  45.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.851339  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1273  cAMP-binding protein  26.83 
 
 
243 aa  45.1  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.22 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4116  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.93 
 
 
205 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2874  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 
228 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.191735 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.93 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1523  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.08 
 
 
231 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2636  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.47 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.12 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3444  cyclic nucleotide-binding  22.5 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
249 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.67 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  28 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191538  hitchhiker  0.00387918 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.46 
 
 
222 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3741  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.36 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2085  cyclic nucleotide binding protein  24.77 
 
 
238 aa  43.5  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7766  nitrogen fixation regulation protein fixK  25.5 
 
 
235 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  23 
 
 
226 aa  43.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0917  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.2 
 
 
254 aa  43.1  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1580  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.45 
 
 
240 aa  42.7  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391426  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.39 
 
 
230 aa  42.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3066  cyclic nucleotide-binding  20.48 
 
 
240 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1678  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.18 
 
 
230 aa  42.4  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.330352  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1070  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.47 
 
 
235 aa  42.4  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105875  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.62 
 
 
231 aa  42.4  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>