More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0836 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0836  penicillin-binding protein 1C  100 
 
 		 719 aa  1489    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0734378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2356  penicillin-binding protein 1C  36.33 
 
 		 762 aa  442  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1168  penicillin-binding protein 1C  36.35 
 
 		 798 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.676311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2036  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  42.16 
 
 		 779 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0247082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1842  glycosyl transferase family 51  41.56 
 
 		 782 aa  422  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0117542  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2518  glycosyl transferase family 51  39.47 
 
 		 857 aa  421  1e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1927  glycosyl transferase family 51  41.72 
 
 		 782 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0285568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2226  glycosyl transferase family protein  34.47 
 
 		 759 aa  399  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  35.33 
 
 		 860 aa  382  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  39.52 
 
 		 801 aa  376  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09670  penicillin-binding protein 1C  37.17 
 
 		 770 aa  375  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  36.64 
 
 		 853 aa  369  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2139  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.1 
 
 		 774 aa  372  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.911102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  36.22 
 
 		 952 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  34.45 
 
 		 855 aa  358  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1343  penicillin-binding protein 1C  35.25 
 
 		 747 aa  357  5e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00458316  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1290  penicillin-binding protein 1C  35.15 
 
 		 747 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00589164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3142  penicillin-binding protein 1C  35.24 
 
 		 742 aa  352  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3981  penicillin-binding protein 1C  34.21 
 
 		 745 aa  350  5e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.187688 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4091  penicillin-binding protein 1C  34.95 
 
 		 745 aa  350  7e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5748  penicillin-binding protein 1C  34.44 
 
 		 747 aa  346  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3812  penicillin-binding protein 1C  34.44 
 
 		 747 aa  346  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.596  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4556  penicillin-binding protein 1C  34.44 
 
 		 747 aa  346  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  32.94 
 
 		 861 aa  344  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1584  penicillin-binding protein 1C  34.1 
 
 		 844 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4445  penicillin-binding protein 1C  33.79 
 
 		 745 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0971962  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1576  penicillin-binding protein, putative  33.75 
 
 		 713 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.772594  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2639  penicillin-binding protein 1C  34.51 
 
 		 793 aa  336  1e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3299  penicillin-binding protein 1C  33.94 
 
 		 758 aa  335  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1957  penicillin-binding protein 1C  33.73 
 
 		 784 aa  333  7.000000000000001e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0162399 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2652  penicillin-binding protein 1C  33.75 
 
 		 768 aa  332  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.447412  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0941  penicillin-binding protein 1C  33.42 
 
 		 785 aa  331  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237946  normal  0.754349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3627  glycosyl transferase family protein  33.09 
 
 		 908 aa  331  3e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3529  penicillin-binding protein 1C  33.88 
 
 		 726 aa  330  4e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3383  penicillin-binding protein 1C  33.48 
 
 		 746 aa  330  6e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5300  penicillin-binding protein 1C  33.8 
 
 		 774 aa  330  7e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1324  glycosyl transferase family 51  32.23 
 
 		 980 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144561 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0508  peptidoglycan glycosyltransferase  32.85 
 
 		 927 aa  326  7e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2671  penicillin-binding protein 1C  33.78 
 
 		 770 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.122147 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3748  penicillin-binding protein 1C  33.78 
 
 		 770 aa  321  3e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1149  penicillin-binding protein 1C  33.61 
 
 		 770 aa  320  7.999999999999999e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391736  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1158  penicillin-binding protein 1C  33.61 
 
 		 770 aa  320  7.999999999999999e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.729598  normal  0.0485769 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3013  penicillin-binding protein 1C  31.45 
 
 		 774 aa  320  7.999999999999999e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.928991  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02411  fused transglycosylase/transpeptidase  33.61 
 
 		 770 aa  319  1e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02373  hypothetical protein  33.61 
 
 		 770 aa  319  1e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2803  penicillin-binding protein 1C  33.61 
 
 		 770 aa  319  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2670  penicillin-binding protein 1C  33.61 
 
 		 770 aa  318  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1163  penicillin-binding protein 1C  32.84 
 
 		 705 aa  318  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22385  normal  0.584003 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2894  penicillin-binding protein 1C  33.78 
 
 		 770 aa  317  4e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1192  glycosyltransferase  33.98 
 
 		 774 aa  316  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.224348  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0543  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein PbpC  32.95 
 
 		 780 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3968  penicillin-binding protein  33.57 
 
 		 790 aa  313  5.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337015  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1366  penicillin-binding protein 1C  34.18 
 
 		 794 aa  310  5.9999999999999995e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0369246  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3903  penicillin-binding protein 1C  33.98 
 
 		 766 aa  310  9e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1435  bifunctional penicillin-binding protein 1C precursor  33.84 
 
 		 794 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.443847  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2383  penicillin-binding protein 1C  32.88 
 
 		 729 aa  307  4.0000000000000004e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.977643  normal  0.393038 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2901  penicillin-binding protein 1C  32.88 
 
 		 771 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2770  penicillin-binding protein 1C  32.77 
 
 		 771 aa  304  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2683  penicillin-binding protein 1C  32.77 
 
 		 771 aa  304  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2726  penicillin-binding protein 1C  32.77 
 
 		 771 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2789  penicillin-binding protein 1C  32.77 
 
 		 771 aa  303  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0400715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3022  penicillin-binding protein 1C  33.33 
 
 		 793 aa  302  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505998 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2824  penicillin-binding protein 1C  32.72 
 
 		 680 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2077  penicillin-binding protein 1C  32.93 
 
 		 706 aa  297  4e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145944  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1534  penicillin-binding protein 1C  33.74 
 
 		 706 aa  295  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232379  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2552  penicillin-binding protein 1C  32.77 
 
 		 750 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0465357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5076  penicillin-binding protein 1C  31.83 
 
 		 816 aa  293  6e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.634438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0263  penicillin-binding protein 1C  29.73 
 
 		 679 aa  293  6e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0258  penicillin-binding protein 1C  32.45 
 
 		 699 aa  292  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3614  penicillin-binding protein 1C  32.09 
 
 		 774 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.355013 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0390  penicillin-binding protein 1C  34.11 
 
 		 780 aa  288  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0164  penicillin-binding protein 1C  32.28 
 
 		 797 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2918  penicillin-binding protein 1C  31.35 
 
 		 731 aa  287  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3916  penicillin-binding protein 1C (PBP-1C)  32.18 
 
 		 745 aa  287  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.787281 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0107  penicillin-binding protein 1C  31.4 
 
 		 762 aa  286  7e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2980  penicillin-binding protein 1C  31.76 
 
 		 787 aa  286  9e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1881  penicillin-binding protein 1C  31.76 
 
 		 787 aa  286  9e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.983342  hitchhiker  0.000428352 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3054  penicillin-binding protein 1C  31.76 
 
 		 787 aa  286  9e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3260  penicillin-binding protein 1C  34.17 
 
 		 696 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247594  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3446  penicillin-binding protein 1C  30.62 
 
 		 695 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2472  penicillin-binding protein 1C  33.63 
 
 		 799 aa  286  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462783 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4387  penicillin-binding protein 1C  30.41 
 
 		 782 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0617  penicillin-binding protein 1C  33.16 
 
 		 784 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701974  normal  0.0771525 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  32.2 
 
 		 701 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1396  penicillin-binding protein 1C  31.57 
 
 		 767 aa  283  7.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1671  penicillin-binding protein 1C  31.07 
 
 		 733 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.60886 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0572  penicillin-binding protein 1C  32.41 
 
 		 784 aa  280  7e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4847  penicillin-binding protein  31.27 
 
 		 782 aa  280  8e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0611  penicillin-binding protein 1C  32.24 
 
 		 784 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585704  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0067  penicillin-binding protein 1C, putative  32.14 
 
 		 760 aa  278  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4628  penicillin-binding protein 1C  31.01 
 
 		 684 aa  278  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.170087 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  31.81 
 
 		 744 aa  279  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  30.82 
 
 		 662 aa  278  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0067  penicillin-binding protein 1C  33.28 
 
 		 762 aa  278  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0405  penicillin-binding protein 1C  32.48 
 
 		 699 aa  278  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00905597  normal  0.606283 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0072  penicillin-binding protein 1C  33.45 
 
 		 760 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1391  penicillin-binding protein 1C  31.34 
 
 		 704 aa  277  6e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0603  bifunctional penicillin-binding protein 1C  32.39 
 
 		 807 aa  276  9e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  31.69 
 
 		 667 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3922  penicillin-binding protein  29.06 
 
 		 695 aa  275  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.731246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>