More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0693 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0693  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 417 aa  849    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0357164  unclonable  3.07983e-19 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3495  diaminopimelate decarboxylase  51.91 
 
 		 421 aa  439  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.844313 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3059  diaminopimelate decarboxylase  50 
 
 		 431 aa  425  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.038181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0396  diaminopimelate decarboxylase  49.53 
 
 		 425 aa  421  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0943424  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0997  diaminopimelate decarboxylase  49.28 
 
 		 421 aa  418  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.877632  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0481  diaminopimelate decarboxylase  48.56 
 
 		 421 aa  416  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2020  diaminopimelate decarboxylase  49.28 
 
 		 421 aa  415  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0158  diaminopimelate decarboxylase  49.28 
 
 		 417 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2448  diaminopimelate decarboxylase  49.52 
 
 		 421 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147668  normal  0.347917 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0729  diaminopimelate decarboxylase  48.81 
 
 		 421 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3567  diaminopimelate decarboxylase  48.33 
 
 		 422 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2384  diaminopimelate decarboxylase  48.81 
 
 		 421 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  0.99015 
 
 
-
 
NC_004310  BR1983  diaminopimelate decarboxylase  49.52 
 
 		 421 aa  410  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3860  diaminopimelate decarboxylase  48.56 
 
 		 422 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1908  diaminopimelate decarboxylase  49.52 
 
 		 421 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  48.31 
 
 		 420 aa  405  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2538  diaminopimelate decarboxylase  46.65 
 
 		 422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0787755  normal  0.617657 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1600  diaminopimelate decarboxylase  49.4 
 
 		 422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.458641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3040  diaminopimelate decarboxylase  48.56 
 
 		 421 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365095  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  49.03 
 
 		 417 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0829  diaminopimelate decarboxylase  45.45 
 
 		 421 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3816  diaminopimelate decarboxylase  46.3 
 
 		 422 aa  393  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4020  diaminopimelate decarboxylase  48.33 
 
 		 423 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3213  diaminopimelate decarboxylase  47.73 
 
 		 432 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  46.14 
 
 		 434 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  44.98 
 
 		 421 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4873  diaminopimelate decarboxylase  45.45 
 
 		 421 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  46.86 
 
 		 417 aa  385  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  46.38 
 
 		 417 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0938  diaminopimelate decarboxylase  44.74 
 
 		 421 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0056  diaminopimelate decarboxylase  45.15 
 
 		 424 aa  388  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0713  diaminopimelate decarboxylase  43.78 
 
 		 421 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.788055 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  47.34 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0541  diaminopimelate decarboxylase  46.96 
 
 		 418 aa  382  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2862  diaminopimelate decarboxylase  45.61 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0197535  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  49.38 
 
 		 419 aa  380  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3475  diaminopimelate decarboxylase  44.26 
 
 		 421 aa  381  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  46.72 
 
 		 422 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0041  diaminopimelate decarboxylase  46.1 
 
 		 414 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  46.06 
 
 		 416 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2877  diaminopimelate decarboxylase  45.63 
 
 		 419 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3279  diaminopimelate decarboxylase  45.63 
 
 		 419 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1682  diaminopimelate decarboxylase  44.87 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0238  diaminopimelate decarboxylase  44.63 
 
 		 414 aa  373  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  43.36 
 
 		 425 aa  372  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0203  diaminopimelate decarboxylase  44.95 
 
 		 419 aa  374  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.628049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1740  diaminopimelate decarboxylase  44.26 
 
 		 422 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1147  diaminopimelate decarboxylase  45.22 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2675  diaminopimelate decarboxylase  46.04 
 
 		 419 aa  365  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  44.44 
 
 		 412 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  44.28 
 
 		 427 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0314  diaminopimelate decarboxylase  44.07 
 
 		 417 aa  364  1e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  49.13 
 
 		 420 aa  363  2e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0050  diaminopimelate decarboxylase  44.81 
 
 		 423 aa  363  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  44.33 
 
 		 415 aa  363  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  44.15 
 
 		 414 aa  363  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  42.05 
 
 		 418 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  43.96 
 
 		 427 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1787  diaminopimelate decarboxylase  43.1 
 
 		 422 aa  362  8e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.16455 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  43.9 
 
 		 416 aa  362  9e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3139  diaminopimelate decarboxylase  43.72 
 
 		 419 aa  361  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167339  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  43.55 
 
 		 427 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  42.68 
 
 		 414 aa  360  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  44.42 
 
 		 423 aa  360  3e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  44.83 
 
 		 423 aa  360  4e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  45.81 
 
 		 423 aa  359  6e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2979  diaminopimelate decarboxylase protein  45.32 
 
 		 451 aa  358  9e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0830  diaminopimelate decarboxylase  45.05 
 
 		 423 aa  358  9e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00206  putative diaminopimelate decarboxylase  45.87 
 
 		 416 aa  358  9e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  44.79 
 
 		 445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  43.41 
 
 		 414 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4848  diaminopimelate decarboxylase  44.02 
 
 		 423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0946328 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  43.45 
 
 		 419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  44.5 
 
 		 420 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  45.11 
 
 		 447 aa  356  3.9999999999999996e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3588  diaminopimelate decarboxylase  44.87 
 
 		 417 aa  356  3.9999999999999996e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.776676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0322  diaminopimelate decarboxylase  42.68 
 
 		 414 aa  356  5e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.475449  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  44.04 
 
 		 415 aa  356  5e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2394  diaminopimelate decarboxylase  44.31 
 
 		 417 aa  355  7.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.362349  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  44.94 
 
 		 418 aa  355  8.999999999999999e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002110  diaminopimelate decarboxylase  45.91 
 
 		 417 aa  355  8.999999999999999e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  40.34 
 
 		 416 aa  354  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  42.2 
 
 		 414 aa  352  5e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0351  diaminopimelate decarboxylase  43.34 
 
 		 420 aa  352  5e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  43.6 
 
 		 415 aa  352  5e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0391  diaminopimelate decarboxylase  41.95 
 
 		 414 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3634  diaminopimelate decarboxylase  41.95 
 
 		 414 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4309  diaminopimelate decarboxylase  42.2 
 
 		 414 aa  350  3e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00310  diaminopimelate decarboxylase  45.41 
 
 		 417 aa  350  3e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0390  diaminopimelate decarboxylase  41.95 
 
 		 414 aa  350  3e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6020  diaminopimelate decarboxylase  42.68 
 
 		 415 aa  349  5e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0226  diaminopimelate decarboxylase  43.07 
 
 		 414 aa  349  6e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2802  diaminopimelate decarboxylase  43.83 
 
 		 420 aa  348  7e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0486  diaminopimelate decarboxylase  42.72 
 
 		 414 aa  348  8e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.012167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3410  diaminopimelate decarboxylase  42.65 
 
 		 422 aa  348  1e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000272348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1721  diaminopimelate decarboxylase  42.62 
 
 		 422 aa  348  1e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0720  diaminopimelate decarboxylase  43.69 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00473762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  42.82 
 
 		 418 aa  347  2e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  44.85 
 
 		 417 aa  347  2e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3250  diaminopimelate decarboxylase  43.9 
 
 		 414 aa  346  4e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.773654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>