More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0666 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0666  NusA antitermination factor  100 
 
 
463 aa  922    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0123778 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  38.83 
 
 
537 aa  329  6e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  37.61 
 
 
538 aa  327  4.0000000000000003e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  38.7 
 
 
536 aa  325  9e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  38.08 
 
 
537 aa  324  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  38.2 
 
 
539 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  38.32 
 
 
535 aa  322  9.000000000000001e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  38.26 
 
 
540 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  39.26 
 
 
531 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  37.98 
 
 
541 aa  319  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  36.96 
 
 
534 aa  317  4e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  37.47 
 
 
538 aa  316  5e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  37.64 
 
 
532 aa  316  6e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  37.7 
 
 
536 aa  315  8e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  38.91 
 
 
544 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2755  transcription elongation factor NusA  38.8 
 
 
534 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0382786  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  37.63 
 
 
536 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  44.2 
 
 
383 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  37.64 
 
 
537 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  37.64 
 
 
537 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  43.41 
 
 
382 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  43.41 
 
 
383 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  37.42 
 
 
537 aa  312  1e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3855  NusA antitermination factor  38.53 
 
 
538 aa  310  5e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0719337  normal  0.0942338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  38.64 
 
 
560 aa  310  5e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2824  transcription elongation factor NusA  37.92 
 
 
535 aa  307  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1163  transcription elongation factor NusA  37.92 
 
 
535 aa  307  3e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.605286  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  35.83 
 
 
533 aa  306  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  38.41 
 
 
545 aa  306  7e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  38.41 
 
 
545 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  45.75 
 
 
381 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  36.05 
 
 
552 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  43.53 
 
 
385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  35.6 
 
 
535 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  39.73 
 
 
506 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  36.51 
 
 
538 aa  303  5.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  37.47 
 
 
545 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3561  transcription elongation factor NusA  37.25 
 
 
544 aa  301  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  43.01 
 
 
365 aa  299  8e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  38.39 
 
 
475 aa  297  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  42.58 
 
 
406 aa  297  3e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  40.15 
 
 
449 aa  296  7e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  42.19 
 
 
377 aa  294  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  35.83 
 
 
572 aa  293  7e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  44.32 
 
 
385 aa  291  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  41.64 
 
 
362 aa  291  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2910  transcription elongation factor NusA  36.67 
 
 
538 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  43.28 
 
 
401 aa  288  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0497  transcription elongation factor NusA  37.38 
 
 
440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  40 
 
 
359 aa  286  4e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4218  NusA antitermination factor  37.25 
 
 
534 aa  286  5e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000184689  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  42.93 
 
 
404 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2412  transcription elongation factor NusA  36.9 
 
 
441 aa  286  7e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  41.21 
 
 
346 aa  285  8e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1691  transcription elongation factor NusA  35.51 
 
 
491 aa  285  9e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.349056  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  36.1 
 
 
506 aa  285  9e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  40.55 
 
 
384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  41.62 
 
 
383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  42.19 
 
 
381 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2068  transcription elongation factor NusA  37.02 
 
 
523 aa  285  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.571828 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1228  NusA antitermination factor  36.81 
 
 
557 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1160  NusA antitermination factor  36.81 
 
 
557 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1100  NusA antitermination factor  36.81 
 
 
557 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  39.73 
 
 
380 aa  282  7.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0610  transcription elongation factor NusA  37.1 
 
 
548 aa  282  8.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131908  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2515  transcription elongation factor NusA  36.88 
 
 
443 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2592  transcription elongation factor NusA  34.96 
 
 
559 aa  282  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.808645  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2492  transcription elongation factor NusA  36.42 
 
 
544 aa  281  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0183695  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1139  NusA antitermination factor  36.14 
 
 
556 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  36.93 
 
 
516 aa  280  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0031  transcription elongation factor NusA  35.41 
 
 
568 aa  280  5e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  41.39 
 
 
366 aa  278  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  41.18 
 
 
382 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  41.16 
 
 
372 aa  277  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  40.82 
 
 
378 aa  277  3e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  38.89 
 
 
373 aa  276  4e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3161  transcription elongation factor NusA  38.57 
 
 
429 aa  276  4e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00111335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  41.38 
 
 
368 aa  276  7e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  40.05 
 
 
493 aa  275  9e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2453  transcription elongation factor NusA  34.38 
 
 
490 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000540151  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1601  transcription elongation factor NusA  35.43 
 
 
503 aa  275  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.468238  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  39.46 
 
 
368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  39.46 
 
 
368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  39.46 
 
 
368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  39.46 
 
 
368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  39.46 
 
 
368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1750  transcription elongation factor NusA  37.15 
 
 
501 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.844805  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  39.46 
 
 
368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  39.46 
 
 
368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0562  transcription elongation factor NusA  35.43 
 
 
503 aa  274  3e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  40.85 
 
 
368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1700  NusA antitermination factor  36.23 
 
 
492 aa  273  5.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892855 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0061  transcription elongation factor NusA  38.14 
 
 
449 aa  273  6e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.941395  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3819  transcription elongation factor NusA  37.33 
 
 
529 aa  273  7e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0572  NusA antitermination factor  42.74 
 
 
371 aa  271  1e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0763996  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  35.35 
 
 
495 aa  272  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  40.85 
 
 
368 aa  271  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  41.67 
 
 
344 aa  271  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2747  NusA antitermination factor  35.46 
 
 
494 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  41.39 
 
 
344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>