More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0628 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  100 
 
 
210 aa  434  1e-121  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  52.02 
 
 
197 aa  188  5.999999999999999e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  47.72 
 
 
256 aa  177  8e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  47.06 
 
 
257 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  49.46 
 
 
235 aa  176  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  46.77 
 
 
216 aa  175  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  47.83 
 
 
206 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  47.03 
 
 
218 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  49 
 
 
230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  50 
 
 
199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  44.95 
 
 
242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  46.08 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  42.03 
 
 
277 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  48.63 
 
 
198 aa  170  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  50.54 
 
 
254 aa  169  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  47.85 
 
 
209 aa  169  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  47.85 
 
 
209 aa  169  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  47.51 
 
 
209 aa  168  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  46.52 
 
 
268 aa  168  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0317  ribonuclease HII  44.55 
 
 
234 aa  168  6e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  47.25 
 
 
214 aa  167  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  45.16 
 
 
208 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  46 
 
 
214 aa  167  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  47.25 
 
 
248 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  48.5 
 
 
216 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  45.59 
 
 
256 aa  166  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  46.77 
 
 
240 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  45.9 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  43.96 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  44.04 
 
 
221 aa  166  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  46.91 
 
 
210 aa  165  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0352  ribonuclease HII  44.33 
 
 
234 aa  165  4e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227489  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  46.84 
 
 
206 aa  165  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  47.21 
 
 
208 aa  165  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  47.03 
 
 
199 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  46.24 
 
 
199 aa  164  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  46.2 
 
 
248 aa  164  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  47.8 
 
 
214 aa  164  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  47.8 
 
 
214 aa  164  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  47.8 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  47.25 
 
 
210 aa  162  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  50.75 
 
 
208 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1541  ribonuclease HII  46.99 
 
 
214 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0283248  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  46.99 
 
 
214 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  46.99 
 
 
214 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  46.99 
 
 
214 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  46.99 
 
 
214 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  45.9 
 
 
217 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  45.9 
 
 
217 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  44.83 
 
 
255 aa  159  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  44.83 
 
 
255 aa  159  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  46.45 
 
 
214 aa  158  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  44 
 
 
229 aa  158  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  46.45 
 
 
214 aa  157  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  49.48 
 
 
209 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  45.74 
 
 
215 aa  157  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  43.96 
 
 
211 aa  157  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  46.45 
 
 
214 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  47.06 
 
 
257 aa  156  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  47.06 
 
 
257 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  44.06 
 
 
229 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  45.27 
 
 
217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  46.57 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  47.06 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  48.04 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  47.03 
 
 
257 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  47.03 
 
 
257 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  46.31 
 
 
253 aa  154  6e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  44.02 
 
 
201 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  44.44 
 
 
198 aa  154  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  44.27 
 
 
219 aa  154  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01115  ribonuclease HII  44.62 
 
 
211 aa  153  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0002331  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  45.54 
 
 
269 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  48.5 
 
 
230 aa  153  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  46.57 
 
 
257 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  44.04 
 
 
245 aa  152  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  47.19 
 
 
203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  42.93 
 
 
201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  45.3 
 
 
240 aa  152  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  44.83 
 
 
213 aa  152  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  44.68 
 
 
220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1437  ribonuclease HII  45.96 
 
 
196 aa  151  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.480003  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  41.33 
 
 
209 aa  151  8e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  51.03 
 
 
217 aa  150  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  44.15 
 
 
217 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  44.51 
 
 
218 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  42.25 
 
 
218 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  45.36 
 
 
201 aa  150  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  43.48 
 
 
208 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  46.08 
 
 
257 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  45.54 
 
 
259 aa  148  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1252  Ribonuclease H  41.18 
 
 
224 aa  148  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.787291  normal  0.579547 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  48.63 
 
 
260 aa  148  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  43.17 
 
 
202 aa  148  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1966  ribonuclease HII  45.7 
 
 
217 aa  148  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138669  normal  0.413568 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  44.44 
 
 
279 aa  148  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  43.62 
 
 
207 aa  148  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  46.35 
 
 
206 aa  148  7e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  42.63 
 
 
224 aa  148  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  44.39 
 
 
227 aa  148  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>