More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0617 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  100 
 
 
158 aa  328  1e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.77 
 
 
147 aa  119  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  75.32 
 
 
165 aa  117  6e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.03 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.44 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 
151 aa  116  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  44.19 
 
 
168 aa  112  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.05 
 
 
170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.75 
 
 
152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.45 
 
 
175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  62.92 
 
 
182 aa  108  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 
156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  44.68 
 
 
155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.88 
 
 
155 aa  107  6e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.24 
 
 
168 aa  107  7.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.82 
 
 
169 aa  107  8.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.62 
 
 
161 aa  106  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  44.6 
 
 
172 aa  106  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.91 
 
 
167 aa  105  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.96 
 
 
166 aa  104  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42 
 
 
156 aa  104  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.51 
 
 
157 aa  103  6e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  44.85 
 
 
165 aa  103  9e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.87 
 
 
171 aa  102  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  37.36 
 
 
174 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.14 
 
 
163 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  69.86 
 
 
163 aa  102  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.29 
 
 
169 aa  102  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.44 
 
 
165 aa  100  6e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.21 
 
 
159 aa  100  8e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  63.53 
 
 
152 aa  99  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  65.75 
 
 
171 aa  99.4  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  66.67 
 
 
171 aa  99.4  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.28 
 
 
163 aa  97.8  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.72 
 
 
193 aa  97.4  6e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  48.57 
 
 
155 aa  97.4  6e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.19 
 
 
157 aa  97.1  9e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  65.33 
 
 
79 aa  95.9  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.37 
 
 
172 aa  94.4  6e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.81 
 
 
167 aa  94  8e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  41.94 
 
 
158 aa  93.2  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  37.79 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  40.12 
 
 
169 aa  92.4  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.49 
 
 
167 aa  90.5  8e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  34.71 
 
 
174 aa  89.7  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  48.57 
 
 
172 aa  87.4  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  63.01 
 
 
136 aa  87  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0526  hypothetical protein  38.78 
 
 
158 aa  87  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000137512  normal  0.350549 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.56 
 
 
179 aa  85.5  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.2 
 
 
167 aa  84  7e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.29 
 
 
175 aa  84  7e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  36.94 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.36 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.15 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  66.13 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  55.56 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  48.89 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  48.89 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.18 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  42.35 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  48.86 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  39.17 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1300  hypothetical protein  31.55 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  48.86 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  66.67 
 
 
174 aa  70.5  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  34.83 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  76.09 
 
 
48 aa  69.7  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  41.25 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  65.38 
 
 
527 aa  68.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  65.38 
 
 
634 aa  68.2  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  59.65 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  45.71 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  64.71 
 
 
567 aa  66.6  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  41.41 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  39.78 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  58.62 
 
 
548 aa  65.9  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  53.33 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  35.45 
 
 
208 aa  63.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  37.62 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  44.74 
 
 
130 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  48.48 
 
 
130 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  44.74 
 
 
130 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  46.27 
 
 
130 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  48.48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  39.53 
 
 
130 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  43.28 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  38.64 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  50 
 
 
133 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  39.08 
 
 
130 aa  60.8  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.22 
 
 
121 aa  60.8  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  39.33 
 
 
141 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  38.83 
 
 
196 aa  60.5  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  40.91 
 
 
221 aa  60.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.92 
 
 
170 aa  60.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  40.51 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  43.48 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  50 
 
 
188 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  42.68 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  40.22 
 
 
162 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.18456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>