187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0609 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  100 
 
 
387 aa  794    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  58.64 
 
 
385 aa  456  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  54.69 
 
 
388 aa  436  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  56.51 
 
 
387 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  56.51 
 
 
387 aa  437  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  55.87 
 
 
386 aa  427  1e-118  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  51.44 
 
 
392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  53.61 
 
 
387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1371  galactokinase  54.31 
 
 
388 aa  404  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  53.68 
 
 
394 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  53.93 
 
 
390 aa  393  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  53.54 
 
 
389 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  51.3 
 
 
396 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  49.23 
 
 
389 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  48.21 
 
 
392 aa  367  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2244  galactokinase  49.74 
 
 
399 aa  360  2e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  49.6 
 
 
394 aa  358  9.999999999999999e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1069  galactokinase  47.62 
 
 
396 aa  355  5e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  46.93 
 
 
405 aa  348  8e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  47.15 
 
 
383 aa  347  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1322  galactokinase  47.16 
 
 
396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  47.59 
 
 
386 aa  329  5.0000000000000004e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  44.87 
 
 
397 aa  323  3e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  43.52 
 
 
386 aa  315  9e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  43.67 
 
 
399 aa  313  2.9999999999999996e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  44.42 
 
 
387 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  43.78 
 
 
405 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  43.38 
 
 
386 aa  312  6.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  43.63 
 
 
404 aa  311  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  41.99 
 
 
403 aa  298  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  40.31 
 
 
382 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  40.57 
 
 
382 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  40.57 
 
 
382 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  40.57 
 
 
382 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  40.57 
 
 
382 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  40.87 
 
 
382 aa  296  6e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  41.09 
 
 
382 aa  295  7e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  41.09 
 
 
382 aa  295  7e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  41.09 
 
 
382 aa  295  7e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  41.09 
 
 
382 aa  295  7e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  41.09 
 
 
382 aa  295  7e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  40.83 
 
 
382 aa  293  3e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  39.69 
 
 
391 aa  291  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  40.57 
 
 
382 aa  291  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  37.98 
 
 
398 aa  285  5.999999999999999e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  38.3 
 
 
391 aa  285  7e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  42.26 
 
 
383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  41.93 
 
 
385 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  40.67 
 
 
383 aa  279  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  42.12 
 
 
383 aa  279  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  40.67 
 
 
383 aa  279  5e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  40.67 
 
 
383 aa  279  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  39.74 
 
 
383 aa  276  4e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  41.19 
 
 
414 aa  275  9e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  40.79 
 
 
409 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  40.53 
 
 
385 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  40.15 
 
 
389 aa  271  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  38.74 
 
 
395 aa  269  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  39.5 
 
 
389 aa  269  7e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  38.21 
 
 
388 aa  269  7e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  38.58 
 
 
379 aa  265  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  39.74 
 
 
385 aa  262  6.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  39.58 
 
 
372 aa  262  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  36.96 
 
 
394 aa  262  8e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  39.59 
 
 
387 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  38.87 
 
 
388 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  38.28 
 
 
389 aa  260  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  37.37 
 
 
388 aa  260  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  38.92 
 
 
387 aa  259  4e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  38.5 
 
 
392 aa  258  1e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  39.43 
 
 
384 aa  256  6e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  37.73 
 
 
380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  36.81 
 
 
386 aa  253  5.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  38.24 
 
 
388 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  39.74 
 
 
412 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  38.5 
 
 
387 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  37.24 
 
 
393 aa  250  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  39 
 
 
359 aa  247  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  41.94 
 
 
390 aa  245  9e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  40.29 
 
 
349 aa  241  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  39.48 
 
 
350 aa  236  4e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  39.48 
 
 
350 aa  236  4e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  39.46 
 
 
376 aa  229  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  35.23 
 
 
387 aa  229  8e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  36.77 
 
 
358 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  33.78 
 
 
355 aa  226  7e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  35.38 
 
 
381 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  35.38 
 
 
381 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  35.38 
 
 
381 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  35.38 
 
 
381 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  34.62 
 
 
384 aa  224  3e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  36.13 
 
 
369 aa  223  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  34.96 
 
 
381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  38.15 
 
 
351 aa  220  3e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  35.6 
 
 
348 aa  218  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  34.62 
 
 
381 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  35.79 
 
 
401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0694  galactokinase  34.87 
 
 
381 aa  216  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3578  galactokinase  34.62 
 
 
381 aa  216  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  34.49 
 
 
394 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>